Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5W5

Ighv1-54, Immunoglobulin heavy variable V1-54 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-54A0A075B5W5 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ighv1-54A0A075B5W5 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ighv1-54A0A075B5W5 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ighv1-54A0A075B5W5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ighv1-54A0A075B5W5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ighv1-54A0A075B5W5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ighv1-54A0A075B5W5 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ighv1-54A0A075B5W5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ighv1-54A0A075B5W5 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ighv1-54A0A075B5W5 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ighv1-54A0A075B5W5 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ighv1-54A0A075B5W5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ighv1-54A0A075B5W5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ighv1-54A0A075B5W5 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ighv1-54A0A075B5W5 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ighv1-54A0A075B5W5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ighv1-54A0A075B5W5 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ighv1-54A0A075B5W5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ighv1-54A0A075B5W5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ighv1-54A0A075B5W5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ighv1-54A0A075B5W5 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ighv1-54A0A075B5W5 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ighv1-54A0A075B5W5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ighv1-54A0A075B5W5 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ighv1-54A0A075B5W5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ighv1-54A0A075B5W5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ighv1-54A0A075B5W5 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ighv1-54A0A075B5W5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ighv1-54A0A075B5W5 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ighv1-54A0A075B5W5 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ighv1-54A0A075B5W5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ighv1-54A0A075B5W5 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ighv1-54A0A075B5W5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ighv1-54A0A075B5W5 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ighv1-54A0A075B5W5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ighv1-54A0A075B5W5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ighv1-54A0A075B5W5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ighv1-54A0A075B5W5 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ighv1-54A0A075B5W5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ighv1-54A0A075B5W5 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ighv1-54A0A075B5W5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ighv1-54A0A075B5W5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ighv1-54A0A075B5W5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ighv1-54A0A075B5W5 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ighv1-54A0A075B5W5 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ighv1-54A0A075B5W5 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ighv1-54A0A075B5W5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ighv1-54A0A075B5W5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ighv1-54A0A075B5W5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ighv1-54A0A075B5W5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ighv1-54A0A075B5W5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ighv1-54A0A075B5W5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ighv1-54A0A075B5W5 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ighv1-54A0A075B5W5 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ighv1-54A0A075B5W5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ighv1-54A0A075B5W5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ighv1-54A0A075B5W5 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ighv1-54A0A075B5W5 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ighv1-54A0A075B5W5 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ighv1-54A0A075B5W5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ighv1-54A0A075B5W5 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ighv1-54A0A075B5W5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ighv1-54A0A075B5W5 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ighv1-54A0A075B5W5 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ighv1-54A0A075B5W5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ighv1-54A0A075B5W5 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ighv1-54A0A075B5W5 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ighv1-54A0A075B5W5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ighv1-54A0A075B5W5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ighv1-54A0A075B5W5 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ighv1-54A0A075B5W5 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ighv1-54A0A075B5W5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ighv1-54A0A075B5W5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ighv1-54A0A075B5W5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ighv1-54A0A075B5W5 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ighv1-54A0A075B5W5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ighv1-54A0A075B5W5 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ighv1-54A0A075B5W5 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ighv1-54A0A075B5W5 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ighv1-54A0A075B5W5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ighv1-54A0A075B5W5 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ighv1-54A0A075B5W5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ighv1-54A0A075B5W5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ighv1-54A0A075B5W5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ighv1-54A0A075B5W5 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ighv1-54A0A075B5W5 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ighv1-54A0A075B5W5 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ighv1-54A0A075B5W5 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ighv1-54A0A075B5W5 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ighv1-54A0A075B5W5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ighv1-54A0A075B5W5 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ighv1-54A0A075B5W5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ighv1-54A0A075B5W5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ighv1-54A0A075B5W5 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ighv1-54A0A075B5W5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ighv1-54A0A075B5W5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ighv1-54A0A075B5W5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ighv1-54A0A075B5W5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ighv1-54A0A075B5W5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ighv1-54A0A075B5W5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms