Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Gm24465-201ENSMUST00000178398 107 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Gm28929-201ENSMUST00000185330 1193 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Gm29156-201ENSMUST00000187764 499 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Gm32950-201ENSMUST00000193336 232 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Gm43316-201ENSMUST00000197252 1295 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Gm43063-201ENSMUST00000198198 1081 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Gm43241-201ENSMUST00000198375 364 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Gm4410-201ENSMUST00000199349 686 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 A530053G22Rik-203ENSMUST00000204370 612 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Gm17992-201ENSMUST00000207346 1072 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Olfr1434-203ENSMUST00000208197 1229 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Olfr1233-203ENSMUST00000215469 1205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Olfr1233-204ENSMUST00000216561 1192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 AC124489.3-201ENSMUST00000224037 278 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Tpbpa-202ENSMUST00000225275 642 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 AC154562.1-201ENSMUST00000226140 966 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 AC114008.1-201ENSMUST00000226193 937 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Olfr812-201ENSMUST00000057775 1043 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Skint10-202ENSMUST00000068851 493 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Mir365-2-201ENSMUST00000083555 112 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Gm24029-201ENSMUST00000083928 143 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Olfr570-201ENSMUST00000098215 1045 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Olfr1252-202ENSMUST00000213196 3331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Bicd1-201ENSMUST00000003544 2928 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Plxna4os2-201ENSMUST00000152538 2044 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Cd96-201ENSMUST00000023336 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Cyp39a1-201ENSMUST00000170988 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Gm18880-201ENSMUST00000223333 1541 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Gm37140-201ENSMUST00000192914 1684 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Gm4011-201ENSMUST00000174657 2555 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Gm10377-201ENSMUST00000100695 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Atp6ap1l-201ENSMUST00000109541 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Prl8a8-202ENSMUST00000110350 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Gm3676-201ENSMUST00000111869 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Gm3543-201ENSMUST00000111870 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Ncald-202ENSMUST00000116445 858 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Gm12677-201ENSMUST00000118668 426 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Gm7927-201ENSMUST00000118818 880 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Gm4853-201ENSMUST00000119359 394 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 2210409E12Rik-201ENSMUST00000122062 346 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Lrrc72-202ENSMUST00000122115 934 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Gm16052-201ENSMUST00000129681 505 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 1700027A07Rik-201ENSMUST00000150472 458 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Gm25332-201ENSMUST00000158038 105 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
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Rnf4Q9QZS2 Gm23343-201ENSMUST00000158964 143 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Gm6133-201ENSMUST00000164064 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Gm7980-201ENSMUST00000168107 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Gm3573-201ENSMUST00000168673 898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Gm10376-202ENSMUST00000169756 900 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Gm25675-201ENSMUST00000174979 118 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Mir5110-201ENSMUST00000175537 87 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Trav21-dv12-201ENSMUST00000180938 360 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Gm27006-201ENSMUST00000182218 943 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Gm26970-201ENSMUST00000182990 964 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Gm27762-201ENSMUST00000183417 109 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 A630095E13Rik-202ENSMUST00000184611 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
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Rnf4Q9QZS2 Scgb1b14-ps-201ENSMUST00000188286 275 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
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Rnf4Q9QZS2 Gm37719-201ENSMUST00000194615 292 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 4930568G15Rik-202ENSMUST00000195635 996 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
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Rnf4Q9QZS2 AC122035.2-201ENSMUST00000228698 462 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Vmn1r54-201ENSMUST00000058039 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Gm8412-201ENSMUST00000077493 440 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 9630028B13Rik-201ENSMUST00000143787 3406 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Gm26893-202ENSMUST00000180965 2079 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Gm26552-202ENSMUST00000180980 2079 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Siae-201ENSMUST00000002007 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 AC121942.1-201ENSMUST00000224459 2891 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Olfr979-202ENSMUST00000215523 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Olfr635-202ENSMUST00000209473 8565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 AC130827.1-201ENSMUST00000220476 3850 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 CT009696.4-201ENSMUST00000213487 1801 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Hnmt-201ENSMUST00000051416 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Olfr1250-203ENSMUST00000215730 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Scn1a-203ENSMUST00000112366 8386 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Dach2-204ENSMUST00000113380 2894 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Mme-205ENSMUST00000194134 8039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Mnd1-ps-202ENSMUST00000224435 2574 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 A530053G22Rik-205ENSMUST00000205153 1448 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Dennd6a-204ENSMUST00000224248 2775 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Atad2-208ENSMUST00000228783 3472 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 n-R5s16-201ENSMUST00000104555 119 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
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