Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm10709-201ENSMUST00000213318 480 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm1715-201ENSMUST00000213681 1018 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm18252-202ENSMUST00000214886 409 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 5330439M10Rik-201ENSMUST00000218667 348 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Glrx-202ENSMUST00000220523 493 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 AC211878.2-201ENSMUST00000222486 488 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 AC165347.1-201ENSMUST00000224089 1025 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r202-201ENSMUST00000078642 909 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Csn2-201ENSMUST00000082370 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Ift80-202ENSMUST00000107812 4063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Gm44777-201ENSMUST00000205941 4052 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 4930550C14Rik-203ENSMUST00000215668 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Gm20125-201ENSMUST00000185722 3201 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Dus4l-201ENSMUST00000020977 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Akr1c19-202ENSMUST00000118663 5832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 2900079G21Rik-202ENSMUST00000144424 2944 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Tmc5-201ENSMUST00000057320 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Themis-203ENSMUST00000105516 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Scn11a-201ENSMUST00000070617 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Rbms3-205ENSMUST00000111772 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Coro2a-201ENSMUST00000030021 4112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 3000002C10Rik-203ENSMUST00000144161 3977 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Gm1698-201ENSMUST00000136749 2313 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Mipol1-203ENSMUST00000130447 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Lrrc9-206ENSMUST00000162159 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Gm15741-201ENSMUST00000119401 754 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Gm15490-201ENSMUST00000119894 387 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Rpl36a-ps4-201ENSMUST00000121019 296 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Gm5809-201ENSMUST00000121854 529 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Gm26069-201ENSMUST00000157497 277 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Gm15810-201ENSMUST00000160241 681 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Atxn3-204ENSMUST00000160251 998 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 A730017C20Rik-206ENSMUST00000175830 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Stx5a-215ENSMUST00000176570 563 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Mir6943-201ENSMUST00000185186 66 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Gm28103-201ENSMUST00000188392 416 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Gm28137-201ENSMUST00000191478 416 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Rrh-205ENSMUST00000196902 1250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Gm17984-201ENSMUST00000205286 859 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Gm30928-202ENSMUST00000206881 271 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Olfr1352-201ENSMUST00000058991 4356 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 4930529C04Rik-201ENSMUST00000131367 3534 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Btbd35f14-201ENSMUST00000105117 1701 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Cyp2j6-201ENSMUST00000030303 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Rlim-202ENSMUST00000121153 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Cacna1e-201ENSMUST00000004214 12697 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Gm37773-201ENSMUST00000194141 2120 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Syn3-202ENSMUST00000121789 4006 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Rhbdd1-202ENSMUST00000140020 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Prom1-203ENSMUST00000087441 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Ube4a-202ENSMUST00000117549 3415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Oxr1-205ENSMUST00000166917 2509 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Tdo2-204ENSMUST00000193879 1616 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Aox1-201ENSMUST00000001027 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Ms4a1-201ENSMUST00000169159 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Ssh2-201ENSMUST00000037912 9178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Gm11826-201ENSMUST00000118781 438 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Gm4831-201ENSMUST00000174626 594 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Ly6a-204ENSMUST00000187994 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Gm28501-201ENSMUST00000188729 421 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Gm32051-201ENSMUST00000196818 709 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Gm43467-201ENSMUST00000197441 437 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Gm17766-201ENSMUST00000209223 442 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 AL807824.1-201ENSMUST00000223151 183 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 AC154755.1-201ENSMUST00000225244 537 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
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Col5a3Q9JLI2 Olfr720-202ENSMUST00000206298 4437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Cyp4a12a-201ENSMUST00000084343 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Olfr726-208ENSMUST00000217422 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 AC162936.1-201ENSMUST00000223676 2368 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Ncor1-205ENSMUST00000101067 7243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Anks4b-201ENSMUST00000033201 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Heatr5a-201ENSMUST00000040583 7763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Dock8-201ENSMUST00000025831 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 AC154630.1-201ENSMUST00000215334 2440 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Gm44275-201ENSMUST00000203442 2519 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Srcap-214ENSMUST00000190390 9633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Igkv4-92-201ENSMUST00000103332 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Mageb6-ps-201ENSMUST00000126612 1032 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Gm25383-201ENSMUST00000157810 144 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Gm7316-201ENSMUST00000165395 445 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r-ps25-201ENSMUST00000173545 799 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Gm28976-201ENSMUST00000188070 144 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Gm18717-201ENSMUST00000192744 1241 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Gm37381-202ENSMUST00000194643 657 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Gm43057-201ENSMUST00000196789 429 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Gm44717-201ENSMUST00000208133 578 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Gm44516-201ENSMUST00000208794 833 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 AC160120.1-201ENSMUST00000227446 663 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Bcl2l15-201ENSMUST00000062945 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Olfr48-201ENSMUST00000099762 906 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Gm21051-201ENSMUST00000221757 1688 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Enpp2-201ENSMUST00000041591 3095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Asap1-208ENSMUST00000176014 3435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Gm13928-201ENSMUST00000120326 1732 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Gm17791-201ENSMUST00000185660 1501 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Ago3-201ENSMUST00000069097 15595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
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