Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 AC166258.1-201ENSMUST00000219823 893 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 AC132121.1-201ENSMUST00000220774 332 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 AC121912.1-201ENSMUST00000227525 1201 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 AC118250.1-201ENSMUST00000228569 875 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 AC122035.2-201ENSMUST00000228698 462 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Pate4-201ENSMUST00000034610 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Gm6563-201ENSMUST00000056396 869 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Ube2dnl2-201ENSMUST00000062695 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Zfp993-201ENSMUST00000070932 387 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Prelid2-201ENSMUST00000070949 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Prl3d1-201ENSMUST00000082079 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Gml-201ENSMUST00000096400 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Olfr556-201ENSMUST00000098219 1023 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Gm32122-201ENSMUST00000212119 2259 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Taf13-204ENSMUST00000143054 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Vmn2r-ps119-201ENSMUST00000177481 2406 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Clca1-201ENSMUST00000029919 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Rag2-202ENSMUST00000111227 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Olfr1055-203ENSMUST00000213564 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Dcp2-201ENSMUST00000025350 8616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Gm18066-201ENSMUST00000210904 1774 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Gm10603-202ENSMUST00000184420 4520 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Gm38128-201ENSMUST00000192085 3250 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Kcnj1-202ENSMUST00000172015 3075 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Gm42892-201ENSMUST00000196227 3973 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Gm7903-202ENSMUST00000179953 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Gm45413-201ENSMUST00000210389 3538 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Vmn1r87-204ENSMUST00000228800 1993 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Gm10693-202ENSMUST00000205904 4007 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Zfp184-201ENSMUST00000006903 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Olfr1392-206ENSMUST00000215861 3670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 4932416K20Rik-201ENSMUST00000093229 3554 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
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Usp29Q9ES63 Mir449c-201ENSMUST00000102192 109 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Gm7146-201ENSMUST00000116079 739 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
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Usp29Q9ES63 Gm8501-201ENSMUST00000117684 432 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Gm6744-201ENSMUST00000119303 543 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Gm12618-201ENSMUST00000121754 483 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Gimap4-205ENSMUST00000121957 775 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Gm15237-201ENSMUST00000122104 469 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Spata3-203ENSMUST00000125083 704 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Gm11734-201ENSMUST00000132261 728 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Med9os-202ENSMUST00000139794 446 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Bloc1s6os-201ENSMUST00000150154 696 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
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Usp29Q9ES63 Gm28996-201ENSMUST00000190316 721 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Ighv1-14-201ENSMUST00000194015 402 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Gm2429-201ENSMUST00000194635 586 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Gm3970-201ENSMUST00000198001 334 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
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Usp29Q9ES63 Gm18689-201ENSMUST00000203969 902 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
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Usp29Q9ES63 Rab3c-201ENSMUST00000167824 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
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Usp29Q9ES63 Gm43328-201ENSMUST00000198544 1434 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Gm43900-201ENSMUST00000204868 2669 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Gm45752-201ENSMUST00000212917 3186 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Fgb-201ENSMUST00000048246 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Gm10033-204ENSMUST00000213012 7778 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Zfp60-201ENSMUST00000042641 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Smarca2-203ENSMUST00000112637 1962 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Trmt10a-201ENSMUST00000040321 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
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Usp29Q9ES63 Pcdh15-202ENSMUST00000092420 6917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Ifi204-201ENSMUST00000111214 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Vmn1r219-202ENSMUST00000226845 5979 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Vmn1r219-205ENSMUST00000228666 5993 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Gm3424-201ENSMUST00000164585 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Gm3182-201ENSMUST00000167902 1753 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Rfc1-203ENSMUST00000203581 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Vmn2r-ps54-205ENSMUST00000182110 2587 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Hdac9-201ENSMUST00000110819 4413 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Olfr1564-202ENSMUST00000208645 5213 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Mfap1a-201ENSMUST00000089926 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Gm15023-201ENSMUST00000113183 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 AV320801-201ENSMUST00000068340 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Gm23739-201ENSMUST00000102295 108 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Ppp1r1c-203ENSMUST00000111780 708 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
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