Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Skap1-201ENSMUST00000071510 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 Gm16291-201ENSMUST00000147378 2594 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 Gm42847-201ENSMUST00000201732 2553 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 Hdac9-203ENSMUST00000209667 1635 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 Gpr151-201ENSMUST00000054738 1633 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 Gm26792-201ENSMUST00000180538 2799 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 Gm37607-201ENSMUST00000194925 2623 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 Gm27034-201ENSMUST00000182552 940 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 Sbp-206ENSMUST00000183155 882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 Gm9022-202ENSMUST00000183285 483 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 Gm19637-201ENSMUST00000185933 579 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 Gm6693-201ENSMUST00000189583 813 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 Gm37503-201ENSMUST00000192088 319 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 Gm38053-201ENSMUST00000193938 160 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 Igkv2-105-201ENSMUST00000196931 377 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 4930441H08Rik-201ENSMUST00000205699 501 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 Gm8745-201ENSMUST00000207846 782 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 Gm7397-201ENSMUST00000208298 361 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 Gm18623-201ENSMUST00000219860 953 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 Gm20288-201ENSMUST00000222078 180 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 Clpsl2-201ENSMUST00000025061 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 Olfr437-201ENSMUST00000060243 1018 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 Ctla4-202ENSMUST00000097720 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 Olfr1314-201ENSMUST00000099598 939 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 Txndc16-201ENSMUST00000022377 4028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 Sema4d-202ENSMUST00000110039 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 Mmp27-202ENSMUST00000151853 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 Rsrc2-219ENSMUST00000182955 1685 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 Erbin-203ENSMUST00000091269 6224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 Trim43b-201ENSMUST00000167113 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 AC154642.2-201ENSMUST00000223657 2485 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 Vmn1r34-206ENSMUST00000228498 3078 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 Net1-202ENSMUST00000099946 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 Stard13-202ENSMUST00000110483 5662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 Adra2b-201ENSMUST00000071902 3936 ntAPPRIS P2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 Lcp1-202ENSMUST00000124499 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 Agtr1b-201ENSMUST00000068316 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 Serpinb9g-201ENSMUST00000081927 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 AC154729.1-201ENSMUST00000224481 1501 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 Ccdc80-201ENSMUST00000061050 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 Ssr1-201ENSMUST00000021864 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 Nphp3-207ENSMUST00000194774 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 B4galnt3-201ENSMUST00000057283 3677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 Zfp111-203ENSMUST00000086006 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 Gm37457-201ENSMUST00000193639 2433 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 Tmem68-201ENSMUST00000029891 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 Pde4b-202ENSMUST00000097949 2465 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 Tango6-201ENSMUST00000048359 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 Pde1a-203ENSMUST00000102652 1646 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 Map2-207ENSMUST00000114018 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 Cdh8-204ENSMUST00000142129 2711 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 Gm8113-201ENSMUST00000160298 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 Kcnma1-206ENSMUST00000163322 3162 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 Eci2-213ENSMUST00000178421 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 Orc1-201ENSMUST00000102744 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 Gm43111-201ENSMUST00000197445 1919 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 Gm44812-201ENSMUST00000207627 5349 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 Gm3126-201ENSMUST00000216513 1468 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 Prox2-202ENSMUST00000177289 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 Gpr85-203ENSMUST00000115492 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 4933425L06Rik-201ENSMUST00000022232 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 Pdzd9-201ENSMUST00000033178 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 Gm15721-201ENSMUST00000138406 3308 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 Scel-201ENSMUST00000095576 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 Lancl1-201ENSMUST00000027149 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 Def8-202ENSMUST00000065534 3127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 Ighv1-22-201ENSMUST00000103507 351 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 Gm13526-201ENSMUST00000117970 189 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 Gm11923-201ENSMUST00000118135 508 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 Gm13991-201ENSMUST00000120190 648 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 Gm14524-201ENSMUST00000121066 683 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 Gm14765-201ENSMUST00000121954 326 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 Gm16159-201ENSMUST00000126122 947 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 Gm13377-201ENSMUST00000137984 683 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 Gm12962-201ENSMUST00000138697 580 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 Gm23167-201ENSMUST00000157155 103 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 Gm24240-201ENSMUST00000157785 135 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 Gm25736-201ENSMUST00000175165 101 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 Gm24518-201ENSMUST00000180275 94 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 Gm26964-201ENSMUST00000182516 832 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 Scgb1b13-ps-201ENSMUST00000187330 273 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 Gm29012-201ENSMUST00000187882 469 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 Scgb1b34-ps-201ENSMUST00000187959 331 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 1700030F04Rik-202ENSMUST00000188781 617 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 Tmem265-202ENSMUST00000190278 587 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 Gm44341-201ENSMUST00000196168 138 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 AC125099.1-201ENSMUST00000197780 138 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 AC125099.2-201ENSMUST00000198228 138 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 Gm2623-201ENSMUST00000199229 286 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 Gm43442-201ENSMUST00000202865 414 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 Gm7384-201ENSMUST00000203682 530 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 Gm2796-201ENSMUST00000204007 496 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 Gm36843-201ENSMUST00000209303 627 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 Gm44992-209ENSMUST00000209680 1083 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 Gm45798-201ENSMUST00000212370 511 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 Gm45704-201ENSMUST00000212582 403 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 Gm8940-201ENSMUST00000212585 219 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 1700054O05Rik-201ENSMUST00000214107 555 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 AC118476.4-201ENSMUST00000215385 790 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Riok3Q9DBU3 AC164424.3-201ENSMUST00000220809 148 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms