Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Smg9Q9DB90 Gm28254-201ENSMUST00000189207 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm29063-201ENSMUST00000190236 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 AC127371.2-201ENSMUST00000228108 1933 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm11541-201ENSMUST00000069852 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Ccdc7b-201ENSMUST00000026912 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm43429-201ENSMUST00000197889 2251 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Arhgap6-203ENSMUST00000112127 3973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Vip-201ENSMUST00000019906 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm614-201ENSMUST00000101358 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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Smg9Q9DB90 Gm15715-201ENSMUST00000118032 283 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm12740-201ENSMUST00000118794 308 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm11343-201ENSMUST00000120579 599 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm5166-201ENSMUST00000121332 573 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm11254-201ENSMUST00000122368 653 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm15551-201ENSMUST00000132762 535 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm12144-201ENSMUST00000136288 1292 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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Smg9Q9DB90 BC028528-205ENSMUST00000171519 447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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Smg9Q9DB90 Fxyd4-207ENSMUST00000204214 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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Smg9Q9DB90 Gm20234-201ENSMUST00000214134 717 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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Smg9Q9DB90 n-R5s168-201ENSMUST00000083948 104 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Mir465c-1-201ENSMUST00000093560 81 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
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Smg9Q9DB90 Ctage5-223ENSMUST00000219140 4194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
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Smg9Q9DB90 Gm2026-201ENSMUST00000109007 1621 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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Smg9Q9DB90 Trim43c-201ENSMUST00000163255 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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Smg9Q9DB90 4931413K12Rik-201ENSMUST00000142068 1282 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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Smg9Q9DB90 Vmn2r-ps4-201ENSMUST00000176989 1015 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm4373-201ENSMUST00000178571 556 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm25598-201ENSMUST00000179031 107 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Sbp-206ENSMUST00000183155 882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm38093-201ENSMUST00000195210 710 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
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