Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Ms4a4b-201ENSMUST00000035258 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr134-201ENSMUST00000074883 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 3110018I06Rik-201ENSMUST00000082269 1005 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm25004-201ENSMUST00000083811 161 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Kmo-202ENSMUST00000097458 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Nemf-201ENSMUST00000021368 4732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Vwa5a-202ENSMUST00000118144 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm21698-202ENSMUST00000191203 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45290-201ENSMUST00000211177 3890 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Slc28a2-201ENSMUST00000028652 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm21761-202ENSMUST00000187530 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Slc7a11-201ENSMUST00000029297 9223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Ano5-202ENSMUST00000207044 3311 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Serpinb5-202ENSMUST00000112729 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr491-203ENSMUST00000214605 2136 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Pias1-201ENSMUST00000098651 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Csnk1g1-213ENSMUST00000206528 1740 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14406-202ENSMUST00000108945 1348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Slmap-204ENSMUST00000112330 3962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Bmp10-201ENSMUST00000032125 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13088-201ENSMUST00000105771 1819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Mrgprb2-201ENSMUST00000052730 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr823-202ENSMUST00000213145 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Nol8-203ENSMUST00000221142 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Prelp-201ENSMUST00000048432 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gabra3-202ENSMUST00000114554 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Mir683-2-201ENSMUST00000102099 109 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Trbv1-201ENSMUST00000103262 417 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Sirpb1c-205ENSMUST00000108354 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Prl2c1-202ENSMUST00000110335 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14865-201ENSMUST00000117523 494 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11971-201ENSMUST00000117715 288 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15126-201ENSMUST00000118631 833 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14631-201ENSMUST00000119067 594 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm7670-201ENSMUST00000121272 641 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5809-201ENSMUST00000121854 529 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 AV064505-201ENSMUST00000124572 522 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15860-202ENSMUST00000137257 506 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12860-201ENSMUST00000148457 957 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm16113-201ENSMUST00000159629 372 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Tnfsf10-202ENSMUST00000174840 989 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Mir683-1-201ENSMUST00000179371 109 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Mrps36-ps3-201ENSMUST00000183899 305 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm27596-201ENSMUST00000185061 83 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm29286-202ENSMUST00000187736 537 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28087-201ENSMUST00000189195 767 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28987-201ENSMUST00000191071 537 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37383-201ENSMUST00000191750 745 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm38281-201ENSMUST00000192301 315 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm38328-201ENSMUST00000195582 317 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 1700094M23Rik-201ENSMUST00000197695 695 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm42804-201ENSMUST00000199701 178 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm42883-201ENSMUST00000202594 222 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm29759-201ENSMUST00000205860 327 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm2774-201ENSMUST00000213650 1165 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm34005-201ENSMUST00000215834 282 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 CT009718.2-202ENSMUST00000222092 704 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 AC151730.2-201ENSMUST00000224027 475 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 AC118006.2-201ENSMUST00000224167 962 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Ly96-201ENSMUST00000026881 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr159-201ENSMUST00000053931 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr1448-201ENSMUST00000054737 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr469-201ENSMUST00000075704 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Lats2-203ENSMUST00000077981 786 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Akr1c19-201ENSMUST00000081326 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm24451-201ENSMUST00000083353 133 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr679-201ENSMUST00000098158 952 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Axdnd1-211ENSMUST00000213088 3561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Kat6a-202ENSMUST00000110696 9041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Rhbdd1-202ENSMUST00000140020 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 B3gnt5-201ENSMUST00000079780 4258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 4930548H24Rik-201ENSMUST00000031020 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Anks1b-201ENSMUST00000099364 1383 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Cfap70-203ENSMUST00000056073 3615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp9-201ENSMUST00000161170 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp712-201ENSMUST00000167565 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Atp12a-201ENSMUST00000007340 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Golga3-202ENSMUST00000112512 8132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Atp13a4-202ENSMUST00000057018 4054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr121-202ENSMUST00000174675 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gnpnat1-206ENSMUST00000227468 1490 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Arhgap15-203ENSMUST00000112824 3118 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Cxcr4-201ENSMUST00000052172 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Fbxw26-201ENSMUST00000071917 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Oxr1-205ENSMUST00000166917 2509 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Ttk-201ENSMUST00000070326 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr536-204ENSMUST00000215340 3938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Ros1-201ENSMUST00000020045 7401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43882-201ENSMUST00000204871 2264 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm31805-201ENSMUST00000211921 4031 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Pum2-216ENSMUST00000178015 5874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 4930529C04Rik-201ENSMUST00000131367 3534 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem100-201ENSMUST00000092788 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Ksr2-202ENSMUST00000180430 13125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 1700017N19Rik-203ENSMUST00000187119 1524 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Crtam-204ENSMUST00000188848 5001 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 1700011H14Rik-205ENSMUST00000228936 3444 ntAPPRIS P2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Thap6-201ENSMUST00000191860 3151 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12231-201ENSMUST00000119447 695 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12104-201ENSMUST00000120359 979 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms