Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm32114-203ENSMUST00000195759 1499 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm26740-202ENSMUST00000181532 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Akap5-201ENSMUST00000095610 6687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Olfr1215-203ENSMUST00000216271 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Hspa9-ps1-201ENSMUST00000119602 1933 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Vmn2r-ps117-201ENSMUST00000176899 2188 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 A730009L09Rik-201ENSMUST00000209558 2512 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm13544-201ENSMUST00000131189 2940 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Slc7a2-203ENSMUST00000117077 7626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Traj46-201ENSMUST00000103696 63 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm14115-201ENSMUST00000119242 482 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm14485-201ENSMUST00000119489 493 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Olfr360-201ENSMUST00000120704 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm15898-201ENSMUST00000162213 627 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Mup7-203ENSMUST00000166098 1033 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Cabcoco1-202ENSMUST00000166919 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Vmn1r123-201ENSMUST00000166948 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm20453-201ENSMUST00000173968 226 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm27512-201ENSMUST00000175328 126 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Ighv3-2-201ENSMUST00000191842 349 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm37573-201ENSMUST00000193993 931 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm43222-201ENSMUST00000199013 603 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm8930-201ENSMUST00000201693 768 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm44422-201ENSMUST00000204142 1025 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Fxyd4-207ENSMUST00000204214 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Cx3cl1-205ENSMUST00000211947 377 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 AC118476.1-201ENSMUST00000216237 349 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm40787-201ENSMUST00000218056 317 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 AC132384.8-201ENSMUST00000218152 1204 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 AC153357.1-201ENSMUST00000219190 482 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Vmn1r22-205ENSMUST00000228322 909 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Tmem253-204ENSMUST00000228408 415 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Psma4-201ENSMUST00000034848 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Mup4-201ENSMUST00000075973 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm7808-201ENSMUST00000082002 387 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm26063-201ENSMUST00000083378 107 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Fpr-rs6-201ENSMUST00000095636 1020 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Mup13-202ENSMUST00000098042 984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Prkg2-205ENSMUST00000162619 1308 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm5868-201ENSMUST00000031124 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Naip3-201ENSMUST00000118082 4208 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm5594-201ENSMUST00000172712 1429 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm43328-201ENSMUST00000198544 1434 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm28278-201ENSMUST00000185603 1499 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm28279-201ENSMUST00000186248 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm28491-202ENSMUST00000186902 1493 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm29368-201ENSMUST00000187201 1489 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm28088-202ENSMUST00000187402 1493 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm28674-201ENSMUST00000187502 1493 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm28131-203ENSMUST00000187841 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm28487-202ENSMUST00000187894 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm29056-201ENSMUST00000187933 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm29074-203ENSMUST00000188026 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm28754-201ENSMUST00000188778 1493 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm28520-202ENSMUST00000189379 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm29275-202ENSMUST00000189475 1494 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm28963-202ENSMUST00000189567 1493 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm28519-203ENSMUST00000190126 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm29207-202ENSMUST00000190931 1493 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm28310-202ENSMUST00000191136 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm29646-202ENSMUST00000191146 1493 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm28762-203ENSMUST00000191259 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm28691-202ENSMUST00000191561 1493 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm38174-201ENSMUST00000191787 1494 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Pus10-201ENSMUST00000020520 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm14391-204ENSMUST00000109058 1854 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm37079-201ENSMUST00000194114 2135 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm44750-201ENSMUST00000206185 2223 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 9330159M07Rik-201ENSMUST00000180712 2702 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Olfr78-204ENSMUST00000217123 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Lama2-207ENSMUST00000189575 4244 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 CT033783.1-201ENSMUST00000220881 2884 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm7969-201ENSMUST00000221347 2884 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 CT033783.2-201ENSMUST00000222807 2884 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Kmt2d-202ENSMUST00000178486 19805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Vmn2r3-202ENSMUST00000176328 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Zpld1-201ENSMUST00000036412 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Tor1aip2-203ENSMUST00000097526 2589 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Slc22a29-201ENSMUST00000113298 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Vmn1r9-202ENSMUST00000227399 6778 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm13119-201ENSMUST00000094526 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Zfhx4-201ENSMUST00000026284 13874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm5930-201ENSMUST00000111863 1746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm13101-201ENSMUST00000105763 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Hspd1-ps2-201ENSMUST00000210003 1697 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Mat2a-206ENSMUST00000206692 1400 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Tcf7l2-202ENSMUST00000061496 4053 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Olfr361-201ENSMUST00000100145 969 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm20486-201ENSMUST00000101544 128 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm25917-201ENSMUST00000104267 130 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm26144-201ENSMUST00000104475 132 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Apoa2-203ENSMUST00000111320 470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Vmn1r-ps94-201ENSMUST00000122016 458 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm25782-201ENSMUST00000122526 289 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm26106-201ENSMUST00000157254 228 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm24179-201ENSMUST00000158925 127 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm15970-201ENSMUST00000160623 834 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm20490-201ENSMUST00000173622 198 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Vmn2r-ps12-201ENSMUST00000175833 623 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm18444-201ENSMUST00000191239 629 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.9 ms