Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Bbox1-201ENSMUST00000046233 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Use1Q9CQ56 Gm14391-204ENSMUST00000109058 1854 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Use1Q9CQ56 Gm43523-201ENSMUST00000197397 2878 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Use1Q9CQ56 Amd2-201ENSMUST00000080898 3218 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Use1Q9CQ56 Gm44750-201ENSMUST00000206185 2223 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Use1Q9CQ56 Spata6-203ENSMUST00000084354 2239 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Use1Q9CQ56 Pign-206ENSMUST00000187537 4006 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Use1Q9CQ56 1700024B05Rik-202ENSMUST00000168972 1573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Use1Q9CQ56 Gm43771-201ENSMUST00000202931 1578 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Use1Q9CQ56 Il18r1-205ENSMUST00000193793 1652 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Use1Q9CQ56 AC156569.1-201ENSMUST00000222020 3841 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Use1Q9CQ56 AC155255.1-201ENSMUST00000218751 1428 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Use1Q9CQ56 Olfr1505-203ENSMUST00000216835 3685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Use1Q9CQ56 Ktn1-225ENSMUST00000191446 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Use1Q9CQ56 Gm37773-201ENSMUST00000194141 2120 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Use1Q9CQ56 Gm43900-201ENSMUST00000204868 2669 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Use1Q9CQ56 Olfr1166-201ENSMUST00000099833 1628 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Use1Q9CQ56 Gm25795-201ENSMUST00000104421 132 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Use1Q9CQ56 Klra7-204ENSMUST00000112013 1104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Use1Q9CQ56 Magea6-202ENSMUST00000112562 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Use1Q9CQ56 Olfr50-201ENSMUST00000112950 1157 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Use1Q9CQ56 Mageb16-ps1-201ENSMUST00000117991 1127 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Use1Q9CQ56 Gm15078-201ENSMUST00000118371 782 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Use1Q9CQ56 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Use1Q9CQ56 Pttg1-206ENSMUST00000121638 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Use1Q9CQ56 Gm11200-201ENSMUST00000121698 448 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Use1Q9CQ56 Tnfsf13os-201ENSMUST00000140371 816 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Use1Q9CQ56 Gm15740-201ENSMUST00000159703 1292 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Use1Q9CQ56 G930045G22Rik-202ENSMUST00000161723 673 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Use1Q9CQ56 Obox3-ps1-201ENSMUST00000176885 995 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Use1Q9CQ56 Prp2-202ENSMUST00000178961 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Use1Q9CQ56 Gm29464-201ENSMUST00000187692 513 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Use1Q9CQ56 Gm28066-201ENSMUST00000188657 472 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Use1Q9CQ56 Gm28918-201ENSMUST00000188822 699 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Use1Q9CQ56 Gm4856-201ENSMUST00000192696 1091 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Use1Q9CQ56 4930562F17Rik-201ENSMUST00000195279 960 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Use1Q9CQ56 AC117240.1-201ENSMUST00000199436 61 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Use1Q9CQ56 Gm42640-201ENSMUST00000199792 1195 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Use1Q9CQ56 Ifitm6-203ENSMUST00000211330 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Use1Q9CQ56 Gm7570-201ENSMUST00000215246 698 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Use1Q9CQ56 Gm4489-201ENSMUST00000219576 517 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Use1Q9CQ56 Gm32172-201ENSMUST00000220029 633 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Use1Q9CQ56 AC141425.1-201ENSMUST00000224989 265 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Use1Q9CQ56 Glycam1-204ENSMUST00000228895 641 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Use1Q9CQ56 Cypt1-201ENSMUST00000024026 672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Use1Q9CQ56 Olfr148-201ENSMUST00000050807 1017 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Use1Q9CQ56 1810024B03Rik-201ENSMUST00000056146 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Use1Q9CQ56 Olfr1503-ps1-201ENSMUST00000076614 803 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Use1Q9CQ56 Magea6-201ENSMUST00000076986 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Use1Q9CQ56 Xpo4-201ENSMUST00000089482 3456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Use1Q9CQ56 Tra2b-201ENSMUST00000023564 1369 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Use1Q9CQ56 Ythdc1-201ENSMUST00000038384 2960 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Use1Q9CQ56 Zmynd11-201ENSMUST00000062658 3796 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
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Use1Q9CQ56 Sirpb1c-203ENSMUST00000108350 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Use1Q9CQ56 Ifi206-201ENSMUST00000160565 3047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
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Use1Q9CQ56 Pnpla8-202ENSMUST00000122902 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
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Use1Q9CQ56 Mdm4-210ENSMUST00000188090 7105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
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Use1Q9CQ56 Prom1-207ENSMUST00000177946 3534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
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Use1Q9CQ56 Rpl31-ps23-201ENSMUST00000180440 388 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
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Use1Q9CQ56 Gm2367-201ENSMUST00000192374 472 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
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Use1Q9CQ56 AC153845.2-203ENSMUST00000215889 617 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Use1Q9CQ56 AC154517.1-201ENSMUST00000222785 629 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Use1Q9CQ56 AC154757.2-201ENSMUST00000228885 743 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Use1Q9CQ56 Rps11-ps4-201ENSMUST00000062226 474 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Use1Q9CQ56 Gm24032-201ENSMUST00000083932 159 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Use1Q9CQ56 Vmn1r57-202ENSMUST00000227798 2409 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Use1Q9CQ56 AC117769.3-201ENSMUST00000225814 1664 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Use1Q9CQ56 Piga-202ENSMUST00000112255 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
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