Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7240-204ENSMUST00000222847 2239 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Dclre1a-204ENSMUST00000182276 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43000-201ENSMUST00000198482 3343 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Dgkk-201ENSMUST00000067410 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn2r-ps57-201ENSMUST00000173861 2598 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Ptprd-201ENSMUST00000050757 4698 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Cnot4-203ENSMUST00000114993 3473 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Bicd1-201ENSMUST00000003544 2928 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm23768-201ENSMUST00000104440 131 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Cdc42se1-202ENSMUST00000107199 652 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11011-201ENSMUST00000109160 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm22952-201ENSMUST00000116720 120 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13770-201ENSMUST00000117149 305 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14116-201ENSMUST00000117733 805 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Dnajc5b-202ENSMUST00000118735 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Nr6a1os-201ENSMUST00000129089 645 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12249-201ENSMUST00000132323 719 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12239-201ENSMUST00000134285 500 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14325-202ENSMUST00000150650 310 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm23762-201ENSMUST00000158348 106 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Dab2-209ENSMUST00000161040 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 4930486I03Rik-201ENSMUST00000161509 788 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26557-201ENSMUST00000180756 493 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm27006-201ENSMUST00000182218 943 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26972-201ENSMUST00000183218 344 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28080-201ENSMUST00000188552 722 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm21524-201ENSMUST00000190499 696 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm21715-201ENSMUST00000191056 694 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Ighv3-2-201ENSMUST00000191842 349 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37381-202ENSMUST00000194643 657 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Slamf7-205ENSMUST00000194791 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm18427-201ENSMUST00000195422 515 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43779-201ENSMUST00000196691 829 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Ass-ps1-201ENSMUST00000197717 761 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43132-201ENSMUST00000199106 792 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 S100a14-203ENSMUST00000199538 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8479-201ENSMUST00000203825 718 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1434-203ENSMUST00000208197 1229 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45241-201ENSMUST00000211237 634 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 AC165256.1-201ENSMUST00000216687 670 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 AC142113.2-201ENSMUST00000217425 748 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm33489-201ENSMUST00000223171 673 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 AC114008.1-201ENSMUST00000226193 937 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 AC164597.1-201ENSMUST00000226538 514 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 AC167013.4-201ENSMUST00000226712 317 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Sprr2j-ps-201ENSMUST00000029533 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Platr26-201ENSMUST00000079720 641 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Rpl29-ps2-201ENSMUST00000086508 478 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr201-201ENSMUST00000099656 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Rabgap1-203ENSMUST00000112920 4847 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Zscan4c-201ENSMUST00000131379 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44144-201ENSMUST00000203683 1960 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Pirb-201ENSMUST00000078451 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr670-202ENSMUST00000214216 3729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp182-201ENSMUST00000040628 2487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Wrn-202ENSMUST00000033991 6262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 AC160966.1-202ENSMUST00000216860 1318 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Rnd3-201ENSMUST00000017288 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Fchsd2-202ENSMUST00000098250 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Pramel3-201ENSMUST00000113176 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 1700001G01Rik-201ENSMUST00000125117 1562 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 CT009754.3-201ENSMUST00000220739 3661 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 AC127281.1-201ENSMUST00000221075 3667 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr402-202ENSMUST00000216722 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43612-201ENSMUST00000196087 3207 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn1r196-204ENSMUST00000228382 6525 ntAPPRIS P2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Pold3-209ENSMUST00000208670 1716 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 AC123629.1-201ENSMUST00000225669 1364 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Celf2-201ENSMUST00000002176 7718 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 AC165273.1-201ENSMUST00000222780 2452 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44209-201ENSMUST00000204556 4153 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Izumo3-201ENSMUST00000107108 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Klra3-202ENSMUST00000111998 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Ap3s1-ps1-201ENSMUST00000117113 579 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12683-201ENSMUST00000117528 415 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Hspe1-ps5-201ENSMUST00000118080 297 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15421-202ENSMUST00000118224 399 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11445-201ENSMUST00000119101 532 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15801-201ENSMUST00000120920 522 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12322-201ENSMUST00000121605 389 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Defb28-201ENSMUST00000121912 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13837-201ENSMUST00000126326 337 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13029-201ENSMUST00000137283 594 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15935-202ENSMUST00000141656 298 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11264-201ENSMUST00000143755 2969 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14640-201ENSMUST00000145800 437 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15634-201ENSMUST00000147206 492 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12409-201ENSMUST00000147231 646 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gtsf1-209ENSMUST00000153930 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm22588-201ENSMUST00000157510 140 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8783-201ENSMUST00000159764 522 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn1r-ps60-201ENSMUST00000173467 852 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn1r-ps141-201ENSMUST00000176293 753 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Ap3s1-ps2-201ENSMUST00000178107 579 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm498-203ENSMUST00000179036 990 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm27160-201ENSMUST00000184837 199 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 C030007H22Rik-201ENSMUST00000186258 591 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms