Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0S4

Ttc21a, Tetratricopeptide repeat protein 21A, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21aQ8C0S4 Vmn2r103-201ENSMUST00000172203 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 Ect2-203ENSMUST00000108300 4086 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 Gm26740-202ENSMUST00000181532 1531 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 Vmn2r34-201ENSMUST00000173459 3616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 Olfr1215-202ENSMUST00000214809 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 Gm11617-201ENSMUST00000119609 639 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 Gm13261-201ENSMUST00000137351 1020 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 Tbata-207ENSMUST00000140456 953 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 Gm23662-201ENSMUST00000158046 111 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 Gm25363-201ENSMUST00000158850 245 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 Gm6205-201ENSMUST00000165424 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 Gm26972-201ENSMUST00000183218 344 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 Gm8419-201ENSMUST00000189886 412 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 Rpap3-ps1-201ENSMUST00000190928 454 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 Ighv8-5-201ENSMUST00000194257 358 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 Trav23-201ENSMUST00000199137 347 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 Gm42646-201ENSMUST00000202233 914 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 AC132232.1-201ENSMUST00000214667 1019 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 Gm9269-201ENSMUST00000221661 578 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 AC152394.2-202ENSMUST00000228503 1064 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 Vmn1r70-201ENSMUST00000055847 897 ntAPPRIS P2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 n-R5s36-201ENSMUST00000082998 119 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 Yae1d1-201ENSMUST00000099735 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 Gm2080-201ENSMUST00000211299 1573 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 Gm12703-201ENSMUST00000145411 2039 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 Dock2-203ENSMUST00000101365 3785 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 Gm16513-202ENSMUST00000201663 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 Sh3d19-201ENSMUST00000107664 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 Serpinb6e-201ENSMUST00000110275 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 Gm34004-201ENSMUST00000215460 2837 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 Prom1-216ENSMUST00000197750 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 Ube4a-201ENSMUST00000117506 6039 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 Elf1-204ENSMUST00000227192 3765 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 Ncoa7-212ENSMUST00000217644 2256 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 Fam205c-201ENSMUST00000055944 1655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 Tatdn1-201ENSMUST00000110155 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 Vmn1r171-202ENSMUST00000226128 3063 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 Pcdh11x-203ENSMUST00000113364 4454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 Gabra6-203ENSMUST00000155218 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 Olfr1302-202ENSMUST00000214708 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 Gm45632-201ENSMUST00000211532 1888 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 Filip1l-201ENSMUST00000099667 1576 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 Vmn1r6-206ENSMUST00000227847 8073 ntAPPRIS P2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 Omd-202ENSMUST00000221170 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 Hydin-201ENSMUST00000043141 15783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 Gm12901-201ENSMUST00000118690 532 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 Gm15238-201ENSMUST00000119938 1296 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 Gm15775-201ENSMUST00000159796 538 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 Gm17024-201ENSMUST00000165676 634 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 Gm24103-201ENSMUST00000174930 77 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 Gm22650-201ENSMUST00000175138 105 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 Gm4742-201ENSMUST00000200261 771 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 Olfr628-202ENSMUST00000218266 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 Gm18409-202ENSMUST00000220105 529 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 Gm46401-201ENSMUST00000221291 1089 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 Olfr148-201ENSMUST00000050807 1017 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 Clec4b1-201ENSMUST00000077228 674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 Olfr243-201ENSMUST00000098194 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 Olfr1039-201ENSMUST00000099910 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 Gm15448-202ENSMUST00000108619 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 Olfr527-202ENSMUST00000214143 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 Igsf10-203ENSMUST00000194546 8393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 Gm30948-201ENSMUST00000195683 4827 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 Vmn2r22-201ENSMUST00000170808 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 Olfr384-202ENSMUST00000214228 2576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 Mecom-204ENSMUST00000166001 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 Gm10693-202ENSMUST00000205904 4007 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 Speer4a-201ENSMUST00000079447 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 Gm37033-201ENSMUST00000193199 7350 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 Qser1-201ENSMUST00000117237 8973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 Zfp568-202ENSMUST00000146074 6867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 Olfr571-203ENSMUST00000215773 5153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 Gm37897-201ENSMUST00000192613 3561 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 Olfr1348-209ENSMUST00000213549 2714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 Tex38-201ENSMUST00000106521 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 Mup12-201ENSMUST00000117932 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 B230112J18Rik-201ENSMUST00000128473 602 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 5330429C05Rik-201ENSMUST00000154615 487 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 Vmn1r91-201ENSMUST00000165330 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 Mdrl-201ENSMUST00000180483 1020 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 Gm45082-201ENSMUST00000206082 601 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 Gm18591-201ENSMUST00000220568 763 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 AC124426.2-201ENSMUST00000220886 404 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 Gm18940-201ENSMUST00000222518 871 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 Olfr568-201ENSMUST00000098216 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 Plxna4os2-201ENSMUST00000152538 2044 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 Stag3-209ENSMUST00000162245 4123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 Clcn5-201ENSMUST00000004428 8390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 Ing3-201ENSMUST00000031680 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 Ect2-202ENSMUST00000108298 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 Gramd1b-204ENSMUST00000121357 7334 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 Gm42397-206ENSMUST00000208808 1358 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 Ipo5-201ENSMUST00000032898 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 AC156031.1-201ENSMUST00000217288 2555 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 Vmn1r34-207ENSMUST00000228647 2979 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 Gm4954-201ENSMUST00000135069 1601 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 Gm15011-201ENSMUST00000117724 1480 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 Nedd4-207ENSMUST00000184333 4034 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc21aQ8C0S4 Gm12768-201ENSMUST00000120055 759 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms