Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Nmrk1-201ENSMUST00000042392 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Atg16l1Q8C0J2 Dopey1-201ENSMUST00000034987 8933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Atg16l1Q8C0J2 Gm42725-201ENSMUST00000199296 4193 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Atg16l1Q8C0J2 Gbp3-203ENSMUST00000106222 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Atg16l1Q8C0J2 Rd3l-203ENSMUST00000189759 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Atg16l1Q8C0J2 Gm43025-201ENSMUST00000201764 1886 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Atg16l1Q8C0J2 Cse1l-210ENSMUST00000168599 2748 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Atg16l1Q8C0J2 Tlr1-201ENSMUST00000059349 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Atg16l1Q8C0J2 Olfr329-ps-203ENSMUST00000219448 4052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Atg16l1Q8C0J2 Gm3106-201ENSMUST00000179743 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Atg16l1Q8C0J2 March1-205ENSMUST00000110255 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Atg16l1Q8C0J2 Ythdc1-201ENSMUST00000038384 2960 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Atg16l1Q8C0J2 Lipk-203ENSMUST00000225505 2083 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Atg16l1Q8C0J2 Gm45493-201ENSMUST00000209494 3948 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Atg16l1Q8C0J2 3110067C02Rik-201ENSMUST00000120793 2117 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Atg16l1Q8C0J2 Vmn1r31-205ENSMUST00000228586 2115 ntAPPRIS P2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Atg16l1Q8C0J2 Olfr922-202ENSMUST00000213164 4028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Atg16l1Q8C0J2 Gm44530-201ENSMUST00000207920 3559 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Atg16l1Q8C0J2 Slc14a1-201ENSMUST00000091813 3665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Atg16l1Q8C0J2 Gm26143-201ENSMUST00000104480 108 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Atg16l1Q8C0J2 Gm25344-201ENSMUST00000104503 132 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Atg16l1Q8C0J2 Olfr612-201ENSMUST00000104879 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Atg16l1Q8C0J2 S100a1-202ENSMUST00000107340 577 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Atg16l1Q8C0J2 Gm16073-201ENSMUST00000116032 517 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Atg16l1Q8C0J2 Gm13739-201ENSMUST00000118020 530 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Atg16l1Q8C0J2 Gm14267-201ENSMUST00000119751 496 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
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Atg16l1Q8C0J2 Gm16249-201ENSMUST00000124055 1258 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Atg16l1Q8C0J2 Olfr75-ps1-201ENSMUST00000135477 938 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Atg16l1Q8C0J2 Gm13982-201ENSMUST00000138372 755 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Atg16l1Q8C0J2 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Atg16l1Q8C0J2 Gm7613-201ENSMUST00000139070 487 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Atg16l1Q8C0J2 Gm12610-201ENSMUST00000139272 581 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Atg16l1Q8C0J2 Gm23279-201ENSMUST00000157912 97 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Atg16l1Q8C0J2 Gm27252-201ENSMUST00000183782 689 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Atg16l1Q8C0J2 Gm29337-201ENSMUST00000185425 284 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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Atg16l1Q8C0J2 Gm38413-201ENSMUST00000197852 348 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Atg16l1Q8C0J2 Gm38562-201ENSMUST00000199398 1126 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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Atg16l1Q8C0J2 Gm31897-202ENSMUST00000206231 604 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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Atg16l1Q8C0J2 Tpt1-ps4-201ENSMUST00000210908 503 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Atg16l1Q8C0J2 4930542C16Rik-203ENSMUST00000212108 1207 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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Atg16l1Q8C0J2 Morn2-201ENSMUST00000061703 644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Atg16l1Q8C0J2 Zfp982-201ENSMUST00000063704 1244 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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Atg16l1Q8C0J2 Mir412-201ENSMUST00000083636 80 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Atg16l1Q8C0J2 Timd2-204ENSMUST00000169584 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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Atg16l1Q8C0J2 Ostn-201ENSMUST00000066852 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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Atg16l1Q8C0J2 Bbox1-201ENSMUST00000046233 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Atg16l1Q8C0J2 Gm43282-201ENSMUST00000201848 2157 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Atg16l1Q8C0J2 Gm7240-204ENSMUST00000222847 2239 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Atg16l1Q8C0J2 Prom1-207ENSMUST00000177946 3534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Atg16l1Q8C0J2 Olfr1138-202ENSMUST00000214573 1611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Atg16l1Q8C0J2 Zfp955b-201ENSMUST00000099414 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Atg16l1Q8C0J2 Slc22a29-201ENSMUST00000113298 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Atg16l1Q8C0J2 Ehf-201ENSMUST00000090475 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Atg16l1Q8C0J2 Gm19084-201ENSMUST00000222939 1762 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Atg16l1Q8C0J2 Lingo2-203ENSMUST00000108122 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Atg16l1Q8C0J2 Ptprd-204ENSMUST00000102834 8084 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Atg16l1Q8C0J2 Gm37082-201ENSMUST00000192629 1927 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Atg16l1Q8C0J2 Serpinb9e-201ENSMUST00000071873 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Atg16l1Q8C0J2 Trim30b-201ENSMUST00000106831 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Atg16l1Q8C0J2 Cbx5-201ENSMUST00000108813 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Atg16l1Q8C0J2 Izumo3-201ENSMUST00000107108 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Atg16l1Q8C0J2 Gm7927-201ENSMUST00000118818 880 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Atg16l1Q8C0J2 Dnajc5b-203ENSMUST00000118968 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Atg16l1Q8C0J2 Gm7058-201ENSMUST00000119209 902 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Atg16l1Q8C0J2 Gm8312-201ENSMUST00000119380 618 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Atg16l1Q8C0J2 Gm12262-201ENSMUST00000119915 305 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Atg16l1Q8C0J2 Gm23888-201ENSMUST00000122690 253 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Atg16l1Q8C0J2 Gm22915-201ENSMUST00000157615 136 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Atg16l1Q8C0J2 Gm25432-201ENSMUST00000158284 66 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Atg16l1Q8C0J2 Wfdc15b-203ENSMUST00000164567 497 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Atg16l1Q8C0J2 Ms4a2-202ENSMUST00000164792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Atg16l1Q8C0J2 Gm22923-201ENSMUST00000174952 110 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Atg16l1Q8C0J2 Obox6-ps1-201ENSMUST00000176658 1042 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Atg16l1Q8C0J2 Olr1-203ENSMUST00000182784 570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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