Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Hephl1-201ENSMUST00000159985 5261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm10373-201ENSMUST00000100683 668 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm12789-202ENSMUST00000106915 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Zfp971-201ENSMUST00000108925 923 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm7146-201ENSMUST00000116079 739 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm12099-201ENSMUST00000118660 750 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm11617-201ENSMUST00000119609 639 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Olfr334-ps1-201ENSMUST00000121252 892 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm12372-201ENSMUST00000121654 768 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm15840-201ENSMUST00000122099 943 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm5392-201ENSMUST00000122189 789 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm12631-201ENSMUST00000130576 637 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 1700091H14Rik-201ENSMUST00000167772 590 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 BC050972-202ENSMUST00000169153 467 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Stk-ps1-201ENSMUST00000173340 1074 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Mrgpra9-202ENSMUST00000179005 1090 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm21971-201ENSMUST00000180187 337 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm27153-201ENSMUST00000184492 407 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 1810053B23Rik-201ENSMUST00000185242 634 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm29124-201ENSMUST00000186576 452 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Eif4a2-224ENSMUST00000187168 1238 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm3351-201ENSMUST00000193454 505 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm42886-201ENSMUST00000199214 466 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 2310008N11Rik-204ENSMUST00000210955 457 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 AC154828.2-201ENSMUST00000220908 1070 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 AC154718.1-201ENSMUST00000226676 250 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Olfr148-201ENSMUST00000050807 1017 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm5612-201ENSMUST00000053326 375 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Dph3b-ps-201ENSMUST00000076359 246 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gml-201ENSMUST00000096400 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Zfp970-201ENSMUST00000099002 794 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm14391-201ENSMUST00000099028 473 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Olfr995-201ENSMUST00000099924 1113 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm14391-204ENSMUST00000109058 1854 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Csde1-214ENSMUST00000199240 3457 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Olfr957-202ENSMUST00000216177 1726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 AC144733.2-201ENSMUST00000222552 2292 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm17473-201ENSMUST00000180585 2216 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Hdac9-201ENSMUST00000110819 4413 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Serpinb6e-201ENSMUST00000110275 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Syt4-201ENSMUST00000025110 3901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Trp53inp1-201ENSMUST00000029865 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Enpp2-202ENSMUST00000167541 2664 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm6866-202ENSMUST00000206653 3081 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Kcnip4-208ENSMUST00000176978 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Olfr361-201ENSMUST00000100145 969 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm10378-201ENSMUST00000100696 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 9230009I02Rik-201ENSMUST00000101255 1148 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Olfr1181-202ENSMUST00000102619 1240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Mageb16-ps1-201ENSMUST00000117991 1127 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm15237-201ENSMUST00000122104 469 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm16346-201ENSMUST00000129158 937 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 4930583P06Rik-201ENSMUST00000136658 706 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Sumo2-207ENSMUST00000153892 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm7152-201ENSMUST00000163570 605 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 D630011A20Rik-201ENSMUST00000180858 500 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Vis1-201ENSMUST00000183957 201 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm27255-201ENSMUST00000184303 529 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Mir7674-201ENSMUST00000184964 63 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm37517-201ENSMUST00000194004 1289 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm36939-201ENSMUST00000194889 439 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm7181-201ENSMUST00000202197 434 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm7802-201ENSMUST00000216464 262 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 AC147615.1-201ENSMUST00000218914 441 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm18591-201ENSMUST00000220568 763 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 AC160105.1-201ENSMUST00000221931 682 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Lcn9-201ENSMUST00000023978 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 4930550C14Rik-201ENSMUST00000005262 1237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Olfr481-201ENSMUST00000067143 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Speer4a-201ENSMUST00000079447 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 mt-Nd2-201ENSMUST00000082396 1038 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm7995-201ENSMUST00000089789 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Olfr1181-201ENSMUST00000099823 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Rad21l-201ENSMUST00000096439 1650 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Shoc2-202ENSMUST00000169861 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm2381-201ENSMUST00000174558 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Pcdh15-211ENSMUST00000126920 6866 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Dennd6a-204ENSMUST00000224248 2775 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Zfp59-202ENSMUST00000205701 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Vmn1r34-203ENSMUST00000226910 2982 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm28432-201ENSMUST00000185237 1499 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm28081-201ENSMUST00000185321 1497 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm29473-201ENSMUST00000185588 1497 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm29662-201ENSMUST00000185620 1499 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm28082-201ENSMUST00000185683 1499 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm29061-201ENSMUST00000185900 1499 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm28679-201ENSMUST00000186013 1499 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm29565-202ENSMUST00000186260 1499 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm28338-202ENSMUST00000186269 1499 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm28668-202ENSMUST00000186549 1499 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm29321-201ENSMUST00000186727 1499 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm28135-201ENSMUST00000186847 1499 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm29158-201ENSMUST00000186883 1494 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm28291-202ENSMUST00000186921 1499 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm29393-201ENSMUST00000187002 1499 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm29219-201ENSMUST00000187224 1499 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm29547-201ENSMUST00000187258 1499 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm28260-201ENSMUST00000187337 1499 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm28225-201ENSMUST00000187730 1499 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm29569-202ENSMUST00000187955 1499 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms