Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Gm24430-201ENSMUST00000104077 104 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm11501-201ENSMUST00000118039 581 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Mgst1-204ENSMUST00000120302 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm15349-201ENSMUST00000121154 204 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 6430710C18Rik-202ENSMUST00000125746 509 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm12526-201ENSMUST00000154462 615 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Six3os1-204ENSMUST00000161688 567 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm17140-201ENSMUST00000169163 627 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Halr1-203ENSMUST00000189071 511 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm37187-201ENSMUST00000193425 341 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Ighv5-5-201ENSMUST00000193826 329 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Trbv9-201ENSMUST00000194494 290 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm43383-201ENSMUST00000195981 469 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm43007-201ENSMUST00000197618 291 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm43743-202ENSMUST00000198353 491 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm43171-201ENSMUST00000199882 291 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm43098-201ENSMUST00000199989 1297 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm44147-201ENSMUST00000204658 94 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 E230032D23Rik-201ENSMUST00000207189 848 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm2516-201ENSMUST00000210011 954 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm18193-201ENSMUST00000210017 772 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm36368-201ENSMUST00000212026 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Olfr114-202ENSMUST00000214871 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm31763-203ENSMUST00000219739 1025 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 AC158392.2-201ENSMUST00000225402 969 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 AC123656.1-201ENSMUST00000227121 581 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 AC139197.1-201ENSMUST00000228332 813 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 9530002B09Rik-201ENSMUST00000024032 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Rpl37a-201ENSMUST00000059980 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Pifo-202ENSMUST00000066319 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Scimp-201ENSMUST00000074572 617 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm24150-201ENSMUST00000082759 104 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Bglap2-201ENSMUST00000098956 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Kcnc2-202ENSMUST00000218445 4033 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 CT030181.1-201ENSMUST00000089534 3549 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Vmn2r96-201ENSMUST00000165692 2343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm45358-201ENSMUST00000209492 2305 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Sytl5-201ENSMUST00000067529 2301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 AC134577.3-201ENSMUST00000226490 3000 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Kcnj16-206ENSMUST00000180023 3701 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm14245-201ENSMUST00000118939 1843 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 AC098728.1-202ENSMUST00000226656 2198 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm18409-201ENSMUST00000218988 2506 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 B020004C17Rik-201ENSMUST00000178161 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Gm28047Q3US59 Ndnf-201ENSMUST00000054351 10101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Nyap2-203ENSMUST00000123285 7501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Unc13c-202ENSMUST00000184666 8796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm29198-201ENSMUST00000190102 1512 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Atp2b4-202ENSMUST00000112264 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Tcf7l2-213ENSMUST00000111662 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Zfp935-202ENSMUST00000221747 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm21846-201ENSMUST00000179257 3073 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm45117-201ENSMUST00000207250 1774 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 AA792892-202ENSMUST00000202253 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm29194-201ENSMUST00000189250 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Adgb-204ENSMUST00000172530 5215 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
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Gm28047Q3US59 Gm10825-201ENSMUST00000180537 4478 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm26581-201ENSMUST00000181953 4479 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 AC153729.1-201ENSMUST00000214055 2562 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Olfr770-203ENSMUST00000204250 1644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Tnik-206ENSMUST00000160518 3996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
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Gm28047Q3US59 Gm24385-201ENSMUST00000122694 350 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm11657-201ENSMUST00000137175 337 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm16196-201ENSMUST00000137730 464 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm22793-201ENSMUST00000157227 330 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm25363-201ENSMUST00000158850 245 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm17046-201ENSMUST00000168078 850 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Trav12d-3-201ENSMUST00000177703 347 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm15256-201ENSMUST00000177793 883 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Rian-203ENSMUST00000181527 989 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Rpl31-ps8-201ENSMUST00000181935 378 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm27167-201ENSMUST00000183752 511 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Mir7033-201ENSMUST00000184259 81 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Mir6769b-201ENSMUST00000184793 60 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 2310046K23Rik-201ENSMUST00000193521 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Cfhr2-202ENSMUST00000194186 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm20926-201ENSMUST00000194457 696 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Ighv1-21-201ENSMUST00000194856 351 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Rpl31-206ENSMUST00000195123 356 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm43203-201ENSMUST00000200130 558 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm42799-201ENSMUST00000201331 328 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm43004-201ENSMUST00000201872 703 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm44265-201ENSMUST00000203631 465 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm44603-201ENSMUST00000206820 367 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm45608-201ENSMUST00000210948 389 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 E330011O21Rik-208ENSMUST00000211650 1225 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
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