Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Wrn-201ENSMUST00000033990 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Nlrp9c-201ENSMUST00000041845 2631 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp101-201ENSMUST00000167107 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem45a-201ENSMUST00000023435 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Olfr1170-202ENSMUST00000214386 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp763-201ENSMUST00000087654 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Cnot1-202ENSMUST00000098473 8390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Igkv4-59-201ENSMUST00000103354 368 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
D13Ertd608eQ3UPR8 S100a1-202ENSMUST00000107340 577 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc5a12-202ENSMUST00000111026 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Crisp4-202ENSMUST00000115340 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm12131-201ENSMUST00000117479 359 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm11270-201ENSMUST00000117685 471 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm12713-201ENSMUST00000118404 764 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm9506-201ENSMUST00000118516 320 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm11624-201ENSMUST00000118579 1041 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm14783-201ENSMUST00000118900 663 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Hspa9-ps1-201ENSMUST00000119602 1933 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Xlr3e-ps-201ENSMUST00000119644 682 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Xlr3d-ps-201ENSMUST00000121687 658 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm11609-201ENSMUST00000121926 793 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Pard3bos2-201ENSMUST00000127498 770 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26106-201ENSMUST00000157254 228 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm5087-203ENSMUST00000161835 814 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm4202-201ENSMUST00000169025 733 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
D13Ertd608eQ3UPR8 1700022N22Rik-201ENSMUST00000180932 709 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Mir6992-201ENSMUST00000183342 109 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Ighv1-17-201ENSMUST00000194435 350 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm31258-201ENSMUST00000194532 3297 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Trav3n-2-201ENSMUST00000197693 334 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm43391-203ENSMUST00000198110 1001 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm44316-201ENSMUST00000199274 97 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm42951-201ENSMUST00000199688 684 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Trav3d-2-201ENSMUST00000199874 334 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Olfr396-ps1-202ENSMUST00000205791 633 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm5735-201ENSMUST00000207053 167 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm18559-201ENSMUST00000208249 604 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm45724-201ENSMUST00000213031 420 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm8672-201ENSMUST00000221200 332 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
D13Ertd608eQ3UPR8 AC115289.2-201ENSMUST00000223836 2803 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm5087-204ENSMUST00000225820 645 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
D13Ertd608eQ3UPR8 AC167013.4-201ENSMUST00000226712 317 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
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D13Ertd608eQ3UPR8 Nexn-201ENSMUST00000046045 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
D13Ertd608eQ3UPR8 S100pbp-201ENSMUST00000049081 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm7887-201ENSMUST00000056948 537 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Nlrp4a-201ENSMUST00000068767 4259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Pkhd1-201ENSMUST00000088448 12935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Usp46-202ENSMUST00000119154 4738 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Vmn1r6-205ENSMUST00000227631 7805 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Pum2-201ENSMUST00000020915 3587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Olfr9-201ENSMUST00000091996 2672 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
D13Ertd608eQ3UPR8 AC132852.1-201ENSMUST00000214683 2324 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
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D13Ertd608eQ3UPR8 Hmmr-201ENSMUST00000020579 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
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D13Ertd608eQ3UPR8 Ehf-202ENSMUST00000111174 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Vmn2r33-201ENSMUST00000165921 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
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D13Ertd608eQ3UPR8 Fcer1a-202ENSMUST00000193017 826 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
D13Ertd608eQ3UPR8 D3Ertd751e-212ENSMUST00000194346 744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
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D13Ertd608eQ3UPR8 AC108401.2-201ENSMUST00000220316 346 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
D13Ertd608eQ3UPR8 4930529N20Rik-201ENSMUST00000220538 639 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm32526-201ENSMUST00000221878 981 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
D13Ertd608eQ3UPR8 AC131033.1-201ENSMUST00000228223 279 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp993-201ENSMUST00000070932 387 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Cox11-202ENSMUST00000099960 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Wdr17-206ENSMUST00000144711 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm44027-201ENSMUST00000203419 3480 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Phc3-209ENSMUST00000168645 10976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp229-203ENSMUST00000182603 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Spata22-201ENSMUST00000117445 3200 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdh10-202ENSMUST00000166873 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
D13Ertd608eQ3UPR8 4930525G20Rik-201ENSMUST00000181912 2987 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm43842-201ENSMUST00000202890 2982 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Mecom-204ENSMUST00000166001 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrrn3-201ENSMUST00000043884 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Nsun6-201ENSMUST00000028034 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Lcor-202ENSMUST00000163929 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Pnpla8-202ENSMUST00000122902 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Vmn1r36-201ENSMUST00000226142 1770 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Olfr78-201ENSMUST00000060187 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Olfr610-203ENSMUST00000217627 1643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Ints6l-202ENSMUST00000101553 3201 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm43612-201ENSMUST00000196087 3207 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
D13Ertd608eQ3UPR8 A830019L24Rik-202ENSMUST00000198056 3165 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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