Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

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Length 539 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Gm3182-201ENSMUST00000167902 1753 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Olfr202-203ENSMUST00000217485 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Olfr901-202ENSMUST00000216502 2639 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Vmn2r63-201ENSMUST00000163803 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Gm37894-201ENSMUST00000195416 2599 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Mir449c-201ENSMUST00000102192 109 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Sec61g-202ENSMUST00000109642 691 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Dynlt1-ps1-201ENSMUST00000117045 342 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Klrc1-203ENSMUST00000118447 684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Gm14783-201ENSMUST00000118900 663 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Gm13493-201ENSMUST00000120318 493 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Gm14970-201ENSMUST00000122289 355 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Fam229b-202ENSMUST00000124941 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 2310044K18Rik-201ENSMUST00000125131 618 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Gm14349-201ENSMUST00000137155 902 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 4933411O13Rik-203ENSMUST00000146849 607 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Etfbkmt-207ENSMUST00000147934 1092 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 4930412B13Rik-201ENSMUST00000149239 1276 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Fpr2-202ENSMUST00000149944 883 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 2610001J05Rik-202ENSMUST00000155856 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Pantr1-203ENSMUST00000176154 514 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Gm6472-201ENSMUST00000178147 651 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Gm5430-201ENSMUST00000182525 915 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Gm28364-201ENSMUST00000187908 334 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Gm37609-201ENSMUST00000191778 678 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Gm37838-201ENSMUST00000194464 312 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Gm19739-201ENSMUST00000195941 153 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Gm40263-201ENSMUST00000197468 580 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Gm43222-201ENSMUST00000199013 603 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Gm32158-201ENSMUST00000200135 404 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Gm44225-201ENSMUST00000203582 186 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Olfr1509-203ENSMUST00000206100 1161 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Gm4265-201ENSMUST00000206701 674 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Gm20586-201ENSMUST00000210122 547 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Gm44992-214ENSMUST00000210787 1079 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Gm39336-201ENSMUST00000214933 260 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 AC156832.1-201ENSMUST00000217609 811 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Mrpl42-203ENSMUST00000218893 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Olfr218-201ENSMUST00000057548 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Gm13078-201ENSMUST00000078695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Gm1604b-201ENSMUST00000089120 357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Olfr810-201ENSMUST00000091986 1006 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 BC080695-202ENSMUST00000105774 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Tank-205ENSMUST00000112502 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Tank-201ENSMUST00000078074 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Olfr1377-202ENSMUST00000213291 2441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Tceal1-201ENSMUST00000055104 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Il1rl2-204ENSMUST00000194296 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Gm26984-201ENSMUST00000182345 3510 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Gm13102-201ENSMUST00000097799 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Homez-201ENSMUST00000081162 5609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Vmn1r51-209ENSMUST00000227911 4021 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Nxt2-204ENSMUST00000112916 2532 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 AC160028.2-201ENSMUST00000218937 2519 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Zfp607b-202ENSMUST00000120004 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Vmn1r37-204ENSMUST00000226974 1770 ntAPPRIS P2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Abcc9-201ENSMUST00000073173 7433 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Slf1-201ENSMUST00000151524 3747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Serpinb1c-201ENSMUST00000021834 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 B3gnt5-203ENSMUST00000121344 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Mup3-202ENSMUST00000107472 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 1600025M17Rik-201ENSMUST00000138262 666 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Gm15279-201ENSMUST00000155593 288 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Gm23467-201ENSMUST00000157127 159 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Gm24719-201ENSMUST00000157520 110 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Gm25432-201ENSMUST00000158284 66 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
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Snx27Q3UHD6 Gm3127-201ENSMUST00000167839 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Pkib-211ENSMUST00000177473 525 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Prp2-202ENSMUST00000178961 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 1700120G07Rik-202ENSMUST00000190881 885 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Ighv1-45-201ENSMUST00000193677 352 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Oaz3-204ENSMUST00000199678 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Gm43794-201ENSMUST00000200971 692 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Gm44137-201ENSMUST00000203670 367 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Olfr1439-ps1-201ENSMUST00000207089 824 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Spcs2-206ENSMUST00000208465 736 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Gm46223-201ENSMUST00000215196 675 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Gm5229-201ENSMUST00000039375 354 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Olfr231-201ENSMUST00000063030 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Olfr884-201ENSMUST00000077732 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Tas2r113-201ENSMUST00000079035 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Snora44-201ENSMUST00000082670 129 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Xpo1-204ENSMUST00000109551 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Gm18880-201ENSMUST00000223333 1541 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Zfp850-202ENSMUST00000180024 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Gm43169-201ENSMUST00000199544 4734 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Nr6a1-210ENSMUST00000168098 5877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Snx27Q3UHD6 Akap11-202ENSMUST00000123853 9364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Snx27Q3UHD6 Kcnmb2-202ENSMUST00000119970 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Snx27Q3UHD6 Adam21-201ENSMUST00000008582 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Snx27Q3UHD6 Gm17690-201ENSMUST00000180958 3467 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Snx27Q3UHD6 Gramd1c-203ENSMUST00000179565 3159 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Snx27Q3UHD6 Gm10693-202ENSMUST00000205904 4007 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Snx27Q3UHD6 Emcn-202ENSMUST00000122064 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Snx27Q3UHD6 Gm38412-201ENSMUST00000199205 3895 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Snx27Q3UHD6 Hdac9-201ENSMUST00000110819 4413 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Snx27Q3UHD6 Nr3c1-204ENSMUST00000115571 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Snx27Q3UHD6 Gm14895-201ENSMUST00000121858 1361 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
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