Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 AC115289.2-201ENSMUST00000223836 2803 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Foxp2-201ENSMUST00000031545 5647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 AC116726.1-201ENSMUST00000215028 3497 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm39321-201ENSMUST00000216597 2075 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r17-203ENSMUST00000228156 2090 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm2223-201ENSMUST00000112099 1350 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Dsc1-201ENSMUST00000038710 3775 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Ireb2-201ENSMUST00000034843 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Brinp3-201ENSMUST00000074622 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Dleu2-207ENSMUST00000182756 3530 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm37959-201ENSMUST00000191700 2897 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 S100a9-202ENSMUST00000117167 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm6427-201ENSMUST00000118721 979 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm12850-201ENSMUST00000119210 436 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Astx4d-201ENSMUST00000123136 1149 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Astx3-201ENSMUST00000123508 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 1700093J21Rik-201ENSMUST00000143671 648 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm24435-201ENSMUST00000157886 110 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm23995-201ENSMUST00000158060 129 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm8032-201ENSMUST00000171009 574 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm18343-201ENSMUST00000172802 604 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Astx4a-201ENSMUST00000177683 1149 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Astx1c-201ENSMUST00000177724 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Astx4c-201ENSMUST00000178390 1149 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Astx1b-201ENSMUST00000178608 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Astx2-201ENSMUST00000179135 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Astx4b-201ENSMUST00000179359 1149 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Astx1a-201ENSMUST00000179529 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Astx5-201ENSMUST00000179723 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Astx6-201ENSMUST00000180281 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm27208-201ENSMUST00000184323 604 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm27679-201ENSMUST00000184612 84 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Mir6989-201ENSMUST00000184812 65 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm29409-202ENSMUST00000189623 901 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm19002-201ENSMUST00000192649 1012 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm29745-201ENSMUST00000198005 687 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm44788-201ENSMUST00000207605 385 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 4933430N04Rik-202ENSMUST00000208031 1146 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm45405-201ENSMUST00000211544 609 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 AC154851.1-201ENSMUST00000221591 655 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 AC073562.1-201ENSMUST00000222117 401 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 AC117797.1-201ENSMUST00000223977 695 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 1700013H16Rik-201ENSMUST00000067940 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 S100a9-201ENSMUST00000069960 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 4933411G06Rik-201ENSMUST00000075909 1022 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Mir143-201ENSMUST00000083511 63 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 BC061195-201ENSMUST00000088133 577 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 1700003E24Rik-201ENSMUST00000088134 577 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm20775-201ENSMUST00000100115 1851 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Ktn1-223ENSMUST00000190999 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Ugt2b35-201ENSMUST00000031186 3359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Fgb-201ENSMUST00000048246 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Asah2-201ENSMUST00000096119 4682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm42540-201ENSMUST00000200319 2008 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1033-203ENSMUST00000214546 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm43359-201ENSMUST00000197944 2200 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm37738-201ENSMUST00000192396 4716 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Psg27-201ENSMUST00000094794 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Dock7-214ENSMUST00000205650 6297 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 AC124569.3-201ENSMUST00000224860 1621 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm45311-201ENSMUST00000211086 1330 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 4930554C24Rik-203ENSMUST00000216802 1346 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Ehf-203ENSMUST00000111176 3696 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm21292-201ENSMUST00000171947 1563 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm40987-202ENSMUST00000221856 1588 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm37142-201ENSMUST00000193718 3110 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm13428-201ENSMUST00000117540 365 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Usp17le-ps-201ENSMUST00000117954 957 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm13473-201ENSMUST00000119289 367 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm22959-201ENSMUST00000122514 303 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm14343-201ENSMUST00000154524 731 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
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Ctdnep1Q3TP92 Tcrg-C4-201ENSMUST00000179181 985 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 1700110C19Rik-202ENSMUST00000188715 717 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
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Ctdnep1Q3TP92 Gm34716-201ENSMUST00000194060 621 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm30353-202ENSMUST00000195486 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm31306-201ENSMUST00000197517 508 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm43055-201ENSMUST00000198859 879 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 AC153567.1-201ENSMUST00000218424 1263 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm34165-201ENSMUST00000222012 1174 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 AC160114.2-201ENSMUST00000223021 300 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 AC154323.1-201ENSMUST00000228329 1231 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r67-201ENSMUST00000055964 999 ntAPPRIS P2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Rps11-ps4-201ENSMUST00000062226 474 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Ints6l-202ENSMUST00000101553 3201 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Jade3-201ENSMUST00000043693 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Tbl1xr1-201ENSMUST00000063988 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Fbxw27-208ENSMUST00000212725 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Olfr994-204ENSMUST00000217218 1460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Aadacl3-201ENSMUST00000105749 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm38137-201ENSMUST00000193735 1401 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm38322-201ENSMUST00000194074 2300 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Armc4-201ENSMUST00000081275 3477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 AC122357.3-201ENSMUST00000221260 2293 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Skil-201ENSMUST00000029194 6717 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm3424-201ENSMUST00000164585 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Fmn1-202ENSMUST00000099576 11817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
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