Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Srcap-206ENSMUST00000186954 9345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Mtm1-205ENSMUST00000114617 3338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Mtm1-202ENSMUST00000033700 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Slc12a1-201ENSMUST00000028630 4645 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Gm10744-201ENSMUST00000220184 2706 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Snapc4-201ENSMUST00000035427 4363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Zkscan5-202ENSMUST00000085671 3794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Zfp661-202ENSMUST00000110366 4912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Crnn-203ENSMUST00000195515 1863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Gm42967-201ENSMUST00000198647 2312 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Gp6-201ENSMUST00000108590 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Tpmt-202ENSMUST00000110118 881 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Gm15892-201ENSMUST00000152627 439 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Gm23032-201ENSMUST00000157995 107 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Gm26025-201ENSMUST00000158655 271 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Mir1930-201ENSMUST00000158799 84 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Gm22242-201ENSMUST00000175224 118 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Obox4-ps33-201ENSMUST00000176649 1139 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Pid1-206ENSMUST00000176822 1119 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 AA465934-205ENSMUST00000177533 308 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Obox4-ps15-201ENSMUST00000178057 1140 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Ap3s1-ps2-201ENSMUST00000178107 579 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Obox4-ps19-201ENSMUST00000178284 1140 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Obox4-ps20-201ENSMUST00000179591 1140 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Obox4-ps21-201ENSMUST00000179856 1140 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Gm28147-201ENSMUST00000187133 621 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Gm17981-201ENSMUST00000191109 739 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 4930568G15Rik-202ENSMUST00000195635 996 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Trav3n-2-201ENSMUST00000197693 334 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Gm8182-201ENSMUST00000197863 769 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Trav3d-2-201ENSMUST00000199874 334 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 E230029C05Rik-204ENSMUST00000208266 875 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Vmn2r-ps50-201ENSMUST00000209317 120 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 5830408C22Rik-203ENSMUST00000210596 326 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 AC131660.1-201ENSMUST00000215630 1062 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 AC151904.5-201ENSMUST00000218975 549 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 AC131745.1-201ENSMUST00000223660 330 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Gm21731-202ENSMUST00000223770 886 ntAPPRIS P1 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 AC165260.1-201ENSMUST00000224127 683 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 AC133958.1-201ENSMUST00000227085 961 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Olfr807-201ENSMUST00000059038 997 ntAPPRIS P1 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Defb46-201ENSMUST00000095436 174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Olfr994-201ENSMUST00000099925 945 ntAPPRIS P1 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Arhgap17-201ENSMUST00000098060 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Mast4-212ENSMUST00000171791 7647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Gm10636-201ENSMUST00000197639 2419 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Enox2-204ENSMUST00000114914 3936 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Gm42483-201ENSMUST00000197556 1742 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 2810414N06Rik-201ENSMUST00000186444 1381 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Tcf4-207ENSMUST00000114985 8577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Olfr969-202ENSMUST00000213266 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Fam114a1-201ENSMUST00000031080 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Pp2d1-201ENSMUST00000056198 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Alg8-201ENSMUST00000098300 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Olfr1352-201ENSMUST00000058991 4356 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Tpk1-203ENSMUST00000114644 2148 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Zkscan2-201ENSMUST00000042470 7831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Slc25a53-203ENSMUST00000113070 3140 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Elf5-201ENSMUST00000028609 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 AC155298.3-201ENSMUST00000225307 3220 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Gm42866-201ENSMUST00000195919 3304 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Brox-201ENSMUST00000057062 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Specc1-203ENSMUST00000108709 6843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Nolc1-201ENSMUST00000165017 3634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Liph-202ENSMUST00000074230 3703 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Stk26-202ENSMUST00000114887 3173 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 8030451A03Rik-203ENSMUST00000141428 2618 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Satb1-213ENSMUST00000169480 6194 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Gm37022-201ENSMUST00000192517 2254 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Clec7a-204ENSMUST00000195589 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Hnrnpa3-203ENSMUST00000111962 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 9330158H04Rik-206ENSMUST00000161161 3103 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Gm37043-201ENSMUST00000194609 3105 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Gbp11-201ENSMUST00000100960 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Tiam1-213ENSMUST00000163370 7255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Cep72-201ENSMUST00000036456 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Rorb-203ENSMUST00000112832 9293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Olfr183-201ENSMUST00000073320 2040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Igkv4-70-201ENSMUST00000103348 379 ntAPPRIS P1 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Gm26417-201ENSMUST00000104274 135 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Vma21-203ENSMUST00000114577 4652 ntTSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Rpl31-ps10-201ENSMUST00000116034 378 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Gm15203-201ENSMUST00000117668 455 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Gm12878-201ENSMUST00000118744 332 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Rpl31-ps12-201ENSMUST00000119957 375 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Gm7746-201ENSMUST00000120966 503 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Rps12-ps1-201ENSMUST00000121980 401 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Gm13738-201ENSMUST00000122437 469 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 4930405D11Rik-201ENSMUST00000132218 568 ntTSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Junos-206ENSMUST00000133772 635 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Gm7855-201ENSMUST00000137737 687 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Gm14218-201ENSMUST00000137802 595 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Gm11234-201ENSMUST00000141030 845 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Gm11551-201ENSMUST00000147438 410 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Gm14216-202ENSMUST00000155334 492 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Tmem29-211ENSMUST00000163233 1256 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Gm23619-201ENSMUST00000178411 94 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Gm25474-201ENSMUST00000179052 94 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Gm22047-201ENSMUST00000179176 94 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Gm21732-201ENSMUST00000179309 1083 ntAPPRIS P1 BASIC8.55□□□□□ -1.04
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