Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Gm28996-201ENSMUST00000190316 721 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 2610509F24Rik-201ENSMUST00000193035 838 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Ighv5-19-201ENSMUST00000193466 297 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm17952-201ENSMUST00000193914 747 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm8920-201ENSMUST00000196153 924 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm43928-201ENSMUST00000203737 409 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm31166-201ENSMUST00000209326 288 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 CT025611.1-201ENSMUST00000222537 906 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 AC154417.1-201ENSMUST00000223876 476 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 CT025686.1-201ENSMUST00000227592 438 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Vmn1r70-201ENSMUST00000055847 897 ntAPPRIS P2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Clec4b1-201ENSMUST00000077228 674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 n-R5s88-201ENSMUST00000083173 118 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Olfr467-201ENSMUST00000084756 927 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Olfr356-201ENSMUST00000095021 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Helz-203ENSMUST00000106746 13147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Vmn1r203-203ENSMUST00000228889 8213 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm8853-201ENSMUST00000198366 1344 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Olfr446-203ENSMUST00000215686 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Olfr446-204ENSMUST00000216199 4218 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm43361-201ENSMUST00000196562 4690 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Abi3bp-201ENSMUST00000048471 4687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 AC131687.1-201ENSMUST00000225931 5446 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Prom1-203ENSMUST00000087441 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Slc14a1-201ENSMUST00000091813 3665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm15448-202ENSMUST00000108619 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Ddx4-201ENSMUST00000075748 2762 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Tmprss11b-201ENSMUST00000038448 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Pls3-203ENSMUST00000114058 3032 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 AL591843.1-201ENSMUST00000223686 3082 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Pigb-201ENSMUST00000093819 2866 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Lrp2bp-203ENSMUST00000110381 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Ktn1-207ENSMUST00000186761 3902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Olfr1359-203ENSMUST00000214435 4425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm7240-204ENSMUST00000222847 2239 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Ssxb10-201ENSMUST00000103003 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Trbv12-2-201ENSMUST00000103269 385 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm11561-201ENSMUST00000117429 417 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm11270-201ENSMUST00000117685 471 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Olfr407-ps1-201ENSMUST00000117794 866 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm11447-201ENSMUST00000118983 858 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm14712-201ENSMUST00000120195 772 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm11852-201ENSMUST00000120806 222 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm13363-201ENSMUST00000122008 522 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm26069-201ENSMUST00000157497 277 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm22916-201ENSMUST00000157616 119 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm24692-201ENSMUST00000157761 146 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Vmn1r101-201ENSMUST00000164245 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Vmn1r119-201ENSMUST00000164683 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Vmn1r149-201ENSMUST00000165916 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm4187-201ENSMUST00000172551 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm4133-201ENSMUST00000172989 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm19560-201ENSMUST00000177510 514 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Tcrg-C4-201ENSMUST00000179181 985 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Rian-205ENSMUST00000182100 1017 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm4832-201ENSMUST00000182679 399 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Sbp-205ENSMUST00000183017 700 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm37336-202ENSMUST00000193705 468 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm3970-201ENSMUST00000198001 334 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm42640-201ENSMUST00000199792 1195 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm31861-201ENSMUST00000204563 672 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm44788-201ENSMUST00000207605 385 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm7499-201ENSMUST00000210423 813 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm7990-201ENSMUST00000212126 593 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm45733-201ENSMUST00000212988 437 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
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Pkp1P97350 Cyp2j13-201ENSMUST00000030305 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Hsf3-204ENSMUST00000164693 2076 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
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Pkp1P97350 Slc22a27-202ENSMUST00000182102 1801 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm42923-201ENSMUST00000198438 2896 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm3608-201ENSMUST00000086725 2858 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Olfr1062-203ENSMUST00000217481 3726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Lair1-203ENSMUST00000086401 2496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Celf2-201ENSMUST00000002176 7718 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Dnah17-202ENSMUST00000084803 14889 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 AC115289.2-201ENSMUST00000223836 2803 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Dmxl1-201ENSMUST00000041772 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Atp2b4-206ENSMUST00000143567 11725 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Eif2s2-205ENSMUST00000166171 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm38224-201ENSMUST00000191648 2100 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Rbms3-206ENSMUST00000111773 7908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Mcf2-203ENSMUST00000101531 3671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 AC132852.2-201ENSMUST00000216052 2794 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Utrn-201ENSMUST00000076817 12382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Mipol1-203ENSMUST00000130447 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Wdr17-202ENSMUST00000127511 4668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 AC112972.2-201ENSMUST00000228702 2210 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 B4galt4-202ENSMUST00000114708 734 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm7079-201ENSMUST00000119726 171 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Mcpt2-201ENSMUST00000015576 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm11528-201ENSMUST00000156822 914 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm22492-201ENSMUST00000157192 297 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm15740-201ENSMUST00000159703 1292 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Ulbp1-202ENSMUST00000177585 3815 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm24957-201ENSMUST00000179604 132 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Frmd8os-202ENSMUST00000187697 516 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 1700110C19Rik-202ENSMUST00000188715 717 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
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