Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 AC132384.3-201ENSMUST00000219709 472 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 2310030G06Rik-201ENSMUST00000034564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 1700028P14Rik-201ENSMUST00000035849 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 Spink14-201ENSMUST00000060328 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 Gm8526-201ENSMUST00000079153 475 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 Fat1-205ENSMUST00000191428 14814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 CT033783.1-201ENSMUST00000220881 2884 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 Gm7969-201ENSMUST00000221347 2884 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 CT033783.2-201ENSMUST00000222807 2884 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 Gm45671-201ENSMUST00000210229 3920 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 Olfr373-203ENSMUST00000215198 3923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 Syt4-201ENSMUST00000025110 3901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 Fam35a-206ENSMUST00000228626 3100 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 A730017C20Rik-205ENSMUST00000165666 1911 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 Gm45562-201ENSMUST00000210015 1537 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 Gm19272-201ENSMUST00000184133 1753 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 Gm36099-201ENSMUST00000221946 1798 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 Npy2r-202ENSMUST00000098997 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 Epyc-202ENSMUST00000105285 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 Gm20707-201ENSMUST00000176201 2516 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 Mcf2-201ENSMUST00000033478 3659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 Ms4a18-201ENSMUST00000177684 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 Abi3bp-201ENSMUST00000048471 4687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 Atp8b5-202ENSMUST00000102953 2609 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 Klrb1f-201ENSMUST00000032257 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 Gm11242-201ENSMUST00000120103 2457 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 Gm44220-201ENSMUST00000203784 2487 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 Copg2-201ENSMUST00000048774 3961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 Ppp2r3a-201ENSMUST00000066773 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 AC151530.1-203ENSMUST00000223343 2591 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 Zbed4-ps2-201ENSMUST00000187003 3448 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 Cept1-201ENSMUST00000039153 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 Olfr1204-202ENSMUST00000213283 6935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 Gm37703-201ENSMUST00000192292 1784 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 Gm18066-201ENSMUST00000210904 1774 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 Gm42520-201ENSMUST00000199642 1502 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 Trbv12-2-201ENSMUST00000103269 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 Izumo3-201ENSMUST00000107108 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 Prdx2-rs3-201ENSMUST00000117259 594 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 Gm12099-201ENSMUST00000118660 750 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 Gm15691-201ENSMUST00000138626 849 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 Gm11528-201ENSMUST00000156822 914 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 Gm22867-201ENSMUST00000157499 109 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 1700091H14Rik-201ENSMUST00000167772 590 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 Gypc-201ENSMUST00000172434 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 Gm20453-201ENSMUST00000173968 226 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 Mir5125-201ENSMUST00000175240 79 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 Gm4845-201ENSMUST00000179202 562 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 S100a2-201ENSMUST00000179550 315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 Gm26765-201ENSMUST00000180844 692 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 Eloc-206ENSMUST00000186948 641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 Ighv3-2-201ENSMUST00000191842 349 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 A730094K22Rik-201ENSMUST00000193867 740 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 Gm37381-202ENSMUST00000194643 657 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 Gm7166-201ENSMUST00000199715 303 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 Gm43084-201ENSMUST00000200696 947 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 Gm8930-201ENSMUST00000201693 768 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 Gm36840-201ENSMUST00000202688 250 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 Gm44162-201ENSMUST00000203543 544 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 Gm45156-201ENSMUST00000207255 439 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 Olfr1476-ps1-201ENSMUST00000208572 367 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 A330049N07Rik-202ENSMUST00000219920 587 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 AC124709.3-201ENSMUST00000227294 171 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 Gm5830-201ENSMUST00000049117 443 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 Olfr1126-201ENSMUST00000071355 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 Dph3b-ps-201ENSMUST00000076359 246 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 Fpr-rs6-201ENSMUST00000095636 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 Gm37435-201ENSMUST00000192078 3947 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 Arsk-201ENSMUST00000120573 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 Gm14496-201ENSMUST00000071760 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 Slfn8-206ENSMUST00000215239 2930 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 Emsy-202ENSMUST00000205276 7693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 Olfr1295-203ENSMUST00000217772 5539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 Zbed6-201ENSMUST00000190574 5007 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 Mpp5-201ENSMUST00000082024 5470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 Wdr64-202ENSMUST00000171939 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 Cd96-201ENSMUST00000023336 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 Vmn1r52-208ENSMUST00000228665 3226 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 Klf7-202ENSMUST00000114086 7662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 Zfp867-201ENSMUST00000057799 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 Olfr1348-209ENSMUST00000213549 2714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 Cep55-201ENSMUST00000096096 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 Gm16751-201ENSMUST00000142212 1685 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 Gm5415-201ENSMUST00000171322 3609 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 Naip6-201ENSMUST00000042220 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 Ccdc7a-205ENSMUST00000214889 5544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 Psd3-205ENSMUST00000098696 11316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 Gm16270-201ENSMUST00000160327 3238 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 Olfr303-205ENSMUST00000216409 4106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 Taf13-204ENSMUST00000143054 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 Oprk1-204ENSMUST00000160777 4675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 CT025604.1-201ENSMUST00000221111 3436 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 C630031E19Rik-201ENSMUST00000218114 3059 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 AC120375.1-201ENSMUST00000227034 3612 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 Ear1-201ENSMUST00000100691 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 Ighv1-39-201ENSMUST00000103515 351 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 Gm12790-201ENSMUST00000106916 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 Gm15877-201ENSMUST00000121897 964 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 Olfr213-201ENSMUST00000121958 984 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Cldn18P56857 Smyd1-204ENSMUST00000129630 376 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms