Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm20480-201ENSMUST00000173953 250 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Gm22355-201ENSMUST00000175531 96 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Gm26909-201ENSMUST00000181668 627 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Rian-205ENSMUST00000182100 1017 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Trav12d-1-202ENSMUST00000183652 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Gm38250-201ENSMUST00000192691 766 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Gm45196-201ENSMUST00000206751 825 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Gm17992-201ENSMUST00000207346 1072 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 AC153961.2-201ENSMUST00000218877 164 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Gm7550-201ENSMUST00000223334 282 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Gm5087-204ENSMUST00000225820 645 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Vmn1r216-201ENSMUST00000080253 1059 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Gm23737-201ENSMUST00000082547 159 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Pja2-203ENSMUST00000172733 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Gm26523-201ENSMUST00000180713 1658 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Gm44956-201ENSMUST00000208277 2887 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Mmp20-201ENSMUST00000034487 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 2900079G21Rik-204ENSMUST00000163302 2764 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 4933405O20Rik-201ENSMUST00000119710 1341 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Tbx22-204ENSMUST00000168403 1715 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Epyc-202ENSMUST00000105285 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Clec4e-201ENSMUST00000032239 2518 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Zfp397-201ENSMUST00000060762 5472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Stra6l-202ENSMUST00000107782 4009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Gm37342-201ENSMUST00000194588 4965 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Dock2-203ENSMUST00000101365 3785 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Olfr1175-ps-201ENSMUST00000214207 5552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 CT009765.1-201ENSMUST00000219088 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Rdh11-203ENSMUST00000161204 3262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Tnik-211ENSMUST00000161964 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Ctage5-202ENSMUST00000069430 2869 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 AC138765.2-202ENSMUST00000228418 3435 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Nlrp1b-204ENSMUST00000108516 4134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Creb5-212ENSMUST00000205120 7482 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Mecom-204ENSMUST00000166001 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Gm7155-201ENSMUST00000121143 1671 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Gm5662-201ENSMUST00000101168 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Bbx-201ENSMUST00000066037 4523 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
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Hoxd10P28359 Igkv12-38-201ENSMUST00000103371 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Gin1-202ENSMUST00000112842 1037 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Sspnos-201ENSMUST00000139089 826 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
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Hoxd10P28359 Gm22569-201ENSMUST00000175545 124 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 1700003H04Rik-203ENSMUST00000178485 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Rps12-ps24-201ENSMUST00000182321 381 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Mir6337-201ENSMUST00000184194 105 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Gm2950-201ENSMUST00000185530 520 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 AV026068-202ENSMUST00000185793 486 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Gm44494-201ENSMUST00000196760 129 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Gm43516-201ENSMUST00000196891 322 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
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Hoxd10P28359 Ghrl-201ENSMUST00000064993 527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
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Hoxd10P28359 Dclre1c-201ENSMUST00000061852 7075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Gm10280-201ENSMUST00000212238 2006 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
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Hoxd10P28359 Gm44220-201ENSMUST00000203784 2487 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Zfp791-202ENSMUST00000211109 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Gm6337-201ENSMUST00000168088 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Tpte-201ENSMUST00000077194 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Vmn1r176-204ENSMUST00000227129 2955 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Vmn1r176-207ENSMUST00000228793 2959 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Lcp1-206ENSMUST00000131802 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Golga1-202ENSMUST00000112850 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Heph-203ENSMUST00000113838 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Dennd4c-204ENSMUST00000142837 5870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 AC131687.1-201ENSMUST00000225931 5446 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Gm6125-201ENSMUST00000217983 3472 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 AC155941.4-201ENSMUST00000219731 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 AC153132.1-201ENSMUST00000222625 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Oprk1-203ENSMUST00000160339 2481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Gm43425-201ENSMUST00000201793 3291 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Arl5b-201ENSMUST00000017562 6933 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Cc2d2b-205ENSMUST00000224596 4762 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Gm7670-201ENSMUST00000121272 641 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Gm13531-201ENSMUST00000121893 543 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Gm14012-201ENSMUST00000136025 677 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Gm14022-201ENSMUST00000143857 691 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 AC122858.3-202ENSMUST00000161721 433 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Gm5087-203ENSMUST00000161835 814 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Gm17142-201ENSMUST00000164933 645 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Gm8032-201ENSMUST00000171009 574 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Mrgpra9-202ENSMUST00000179005 1090 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
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