Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Gm37349-201ENSMUST00000194205 624 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
P10404 Gm38079-201ENSMUST00000195603 154 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
P10404 Gm44058-201ENSMUST00000204335 467 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
P10404 Gm39158-201ENSMUST00000210178 856 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
P10404 Lnp1-201ENSMUST00000210579 671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
P10404 Gm45764-201ENSMUST00000213047 571 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
P10404 AC153971.2-201ENSMUST00000214553 777 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
P10404 CT025617.1-201ENSMUST00000216487 725 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
P10404 AC166263.1-201ENSMUST00000218586 238 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
P10404 Gm33467-201ENSMUST00000221885 652 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
P10404 Gm36756-201ENSMUST00000222011 1214 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
P10404 CT030260.1-201ENSMUST00000223243 442 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
P10404 AC121997.2-202ENSMUST00000227158 939 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
P10404 AC160930.1-201ENSMUST00000227194 337 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
P10404 AC140451.1-201ENSMUST00000227984 737 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
P10404 Tex36-201ENSMUST00000033275 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
P10404 Gm9762-201ENSMUST00000036976 444 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
P10404 Tas2r109-201ENSMUST00000067539 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
P10404 Olfr779-201ENSMUST00000069063 390 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
P10404 Fam47e-201ENSMUST00000082382 750 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
P10404 Gm24921-201ENSMUST00000083024 107 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
P10404 Gm37043-201ENSMUST00000194609 3105 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
P10404 Gucy1b2-201ENSMUST00000022501 2711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
P10404 Lum-201ENSMUST00000038160 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
P10404 Gm13102-201ENSMUST00000097799 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
P10404 Tmem236-201ENSMUST00000077517 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
P10404 Ank3-230ENSMUST00000182795 3557 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
P10404 Ctage5-209ENSMUST00000175912 2885 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
P10404 Nsd1-207ENSMUST00000224973 9905 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
P10404 Prelp-201ENSMUST00000048432 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
P10404 Crisp3-201ENSMUST00000026499 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
P10404 Ms4a13-202ENSMUST00000188464 1301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
P10404 Rasgef1b-210ENSMUST00000209346 3028 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
P10404 Olfr1362-201ENSMUST00000051874 3045 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
P10404 Pfkfb2-203ENSMUST00000169659 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
P10404 E330035G20Rik-202ENSMUST00000223323 3578 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
P10404 Mum1l1-201ENSMUST00000113041 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
P10404 Gm26648-201ENSMUST00000181925 5831 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
P10404 Ap2b1-202ENSMUST00000065692 3269 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
P10404 Olfr458-202ENSMUST00000216650 1799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
P10404 Atp13a5-201ENSMUST00000075806 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
P10404 Sorbs2-214ENSMUST00000134675 1692 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
P10404 Gm20939-201ENSMUST00000108007 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
P10404 1700017N19Rik-210ENSMUST00000218464 1597 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
P10404 1700024B05Rik-201ENSMUST00000064162 1576 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
P10404 Scn9a-203ENSMUST00000112354 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
P10404 Svs2-202ENSMUST00000109374 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
P10404 Gm37147-201ENSMUST00000193756 1498 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
P10404 Gpr87-203ENSMUST00000200095 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
P10404 Zdhhc11-201ENSMUST00000091493 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
P10404 Gm37107-201ENSMUST00000195326 2552 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
P10404 Gm15229-201ENSMUST00000146636 1398 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
P10404 Gm45322-201ENSMUST00000211642 1361 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
P10404 Abcc9-201ENSMUST00000073173 7433 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
P10404 Olfr1480-202ENSMUST00000207093 1819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
P10404 Gm12102-201ENSMUST00000118251 604 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
P10404 Gm14158-201ENSMUST00000118409 308 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
P10404 Gm11371-201ENSMUST00000120294 385 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
P10404 4930448K20Rik-201ENSMUST00000120570 998 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
P10404 Mrpl48-ps-201ENSMUST00000121413 636 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
P10404 Gm7973-201ENSMUST00000122107 488 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
P10404 Gm11916-201ENSMUST00000132759 650 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
P10404 Gm12590-201ENSMUST00000134226 404 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
P10404 Gm7546-201ENSMUST00000146119 966 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
P10404 Mllt3-207ENSMUST00000148059 422 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
P10404 Gm12971-201ENSMUST00000154720 511 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
P10404 Gm25505-201ENSMUST00000157220 246 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
P10404 Atxn3-205ENSMUST00000161011 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
P10404 Phf11d-203ENSMUST00000161031 1130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
P10404 Gm10552-202ENSMUST00000161763 717 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
P10404 Gm6401-202ENSMUST00000164232 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
P10404 Mir199b-201ENSMUST00000175066 110 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
P10404 Gm5272-201ENSMUST00000182730 982 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
P10404 Mir6951-201ENSMUST00000183910 75 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
P10404 Gm18185-201ENSMUST00000186725 667 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
P10404 Gm21256-202ENSMUST00000188881 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
P10404 Gm29276-201ENSMUST00000190453 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
P10404 Gm38022-201ENSMUST00000191762 403 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
P10404 Rpl23a-ps5-201ENSMUST00000194566 466 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
P10404 Gm38328-201ENSMUST00000195582 317 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
P10404 Trav13n-1-201ENSMUST00000198359 331 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
P10404 Rps4x-ps-201ENSMUST00000199852 793 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
P10404 1110060G06Rik-201ENSMUST00000200372 499 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
P10404 Gm9245-201ENSMUST00000200528 983 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
P10404 Olfr565-ps1-201ENSMUST00000209824 944 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
P10404 Gm19232-201ENSMUST00000211621 652 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
P10404 Olfr929-ps1-201ENSMUST00000216338 585 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
P10404 Gm18997-201ENSMUST00000216353 822 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
P10404 AC133948.2-201ENSMUST00000217850 378 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
P10404 Mrpl42-203ENSMUST00000218893 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
P10404 4930563J15Rik-202ENSMUST00000219752 560 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
P10404 AC134468.2-202ENSMUST00000222820 1120 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
P10404 AC158521.1-202ENSMUST00000224352 645 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
P10404 AC158521.1-201ENSMUST00000225295 660 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
P10404 AC133203.2-201ENSMUST00000226709 464 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
P10404 AC140209.1-204ENSMUST00000226736 739 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
P10404 AC122034.1-201ENSMUST00000227641 595 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
P10404 AC122459.3-201ENSMUST00000228508 1042 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
P10404 Icos-201ENSMUST00000027162 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
P10404 Olfr629-201ENSMUST00000051346 1122 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms