Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

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Length 1,664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Rps4x-201ENSMUST00000033683 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gab3-203ENSMUST00000114109 2093 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm36186-201ENSMUST00000200820 2052 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Clec12a-201ENSMUST00000065289 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm42544-201ENSMUST00000197868 3242 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm44829-201ENSMUST00000208008 3193 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Olfr651-203ENSMUST00000216904 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm14367-201ENSMUST00000119214 1497 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Btbd35f9-201ENSMUST00000178219 1497 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Btbd35f22-201ENSMUST00000178747 1497 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Btbd35f30-201ENSMUST00000179069 1497 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Btbd35f25-201ENSMUST00000179086 1497 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Btbd35f6-201ENSMUST00000179466 1497 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Btbd35f29-201ENSMUST00000179532 1497 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Btbd35f8-201ENSMUST00000180004 1497 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Btbd35f26-201ENSMUST00000180197 1497 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Birc6-223ENSMUST00000183224 14562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Ttf1-201ENSMUST00000100237 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm14601-201ENSMUST00000120892 236 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm22355-201ENSMUST00000175531 96 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm21842-202ENSMUST00000185311 174 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm29285-201ENSMUST00000185500 174 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm21801-202ENSMUST00000185537 174 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm28312-201ENSMUST00000185976 174 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm29213-201ENSMUST00000186199 174 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm21428-201ENSMUST00000186550 174 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm29370-201ENSMUST00000186581 174 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm28604-201ENSMUST00000186629 484 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm21633-202ENSMUST00000186630 174 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm28890-201ENSMUST00000186686 173 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm28092-201ENSMUST00000186709 174 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm28566-201ENSMUST00000186714 484 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm21572-202ENSMUST00000186850 174 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm21916-202ENSMUST00000187044 174 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm29839-201ENSMUST00000187045 174 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm28442-201ENSMUST00000187052 174 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm21780-202ENSMUST00000187110 174 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm29656-201ENSMUST00000187236 174 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm21821-202ENSMUST00000187288 175 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm28886-201ENSMUST00000187350 174 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm21599-202ENSMUST00000187381 174 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm28128-201ENSMUST00000187403 174 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm21450-201ENSMUST00000187408 174 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm28194-201ENSMUST00000187412 484 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm28689-201ENSMUST00000187441 174 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm28851-201ENSMUST00000187800 174 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm28886-202ENSMUST00000187889 484 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm28554-201ENSMUST00000187964 174 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm28984-201ENSMUST00000188202 174 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm21529-202ENSMUST00000188473 174 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm28604-202ENSMUST00000188638 174 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm21588-202ENSMUST00000188721 174 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm21539-202ENSMUST00000188764 174 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm28216-201ENSMUST00000188785 174 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm29645-201ENSMUST00000189117 174 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm28554-202ENSMUST00000189175 484 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm21413-201ENSMUST00000189224 174 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm21723-202ENSMUST00000189444 174 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm36782-201ENSMUST00000189459 174 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm21419-201ENSMUST00000189495 173 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm28566-202ENSMUST00000189532 174 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm29213-202ENSMUST00000189703 484 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm21626-202ENSMUST00000189751 174 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm28851-202ENSMUST00000189757 484 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm28656-201ENSMUST00000190017 174 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm28461-201ENSMUST00000190023 484 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm21562-202ENSMUST00000190314 174 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm28517-201ENSMUST00000190343 174 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm29531-201ENSMUST00000190569 174 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm21914-202ENSMUST00000190577 174 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm20978-201ENSMUST00000190688 174 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm20963-201ENSMUST00000190880 174 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm29316-201ENSMUST00000190953 174 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm29351-201ENSMUST00000191052 174 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm29466-201ENSMUST00000191077 174 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm20987-201ENSMUST00000191165 174 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm28194-202ENSMUST00000191217 174 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm28461-202ENSMUST00000191406 174 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm37927-201ENSMUST00000192238 174 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm37544-201ENSMUST00000192803 174 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm37635-201ENSMUST00000193129 174 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm21809-202ENSMUST00000194072 174 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm2429-201ENSMUST00000194635 586 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 BC037156-201ENSMUST00000196993 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm18325-201ENSMUST00000203228 835 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm30262-201ENSMUST00000219137 791 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Rpl29-ps2-202ENSMUST00000220540 1165 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 AC142227.2-201ENSMUST00000220675 400 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Rpl29-ps2-203ENSMUST00000222043 1036 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 AC160980.2-201ENSMUST00000225131 949 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 AC156016.5-201ENSMUST00000228742 355 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Trappc1-201ENSMUST00000060956 628 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Mfap3-203ENSMUST00000108849 4827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Olfr62-203ENSMUST00000217013 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Trpm6-201ENSMUST00000040489 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Nmd3-201ENSMUST00000029358 9135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Crb1-204ENSMUST00000198445 6135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gabpb2-202ENSMUST00000098873 8272 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Clasp1-204ENSMUST00000178710 7566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm46136-202ENSMUST00000217053 6329 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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