Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Pecam1-204ENSMUST00000106796 3441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Gm24578-201ENSMUST00000103970 129 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Gm13023-202ENSMUST00000105770 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Gm12884-201ENSMUST00000120371 325 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Gm5834-201ENSMUST00000126680 1026 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Etfbkmt-207ENSMUST00000147934 1092 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Gm5699-201ENSMUST00000152491 723 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Gm28075-201ENSMUST00000189179 354 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Gm29345-201ENSMUST00000189213 399 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Gm18150-201ENSMUST00000195341 645 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Rps27-206ENSMUST00000197361 329 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Mir409-201ENSMUST00000198153 79 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Gm15754-202ENSMUST00000202846 758 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Gm44622-201ENSMUST00000209128 1033 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 AC132384.3-201ENSMUST00000219709 472 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Olfr205-201ENSMUST00000074125 990 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Mir193a-201ENSMUST00000083461 66 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Tlr11-202ENSMUST00000185091 3207 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Gm1720-201ENSMUST00000135086 1503 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Gm15713-201ENSMUST00000155900 1546 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Gm37142-201ENSMUST00000193718 3110 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Robo2-210ENSMUST00000226478 8059 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Gm7108-201ENSMUST00000118038 3407 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Gm43027-201ENSMUST00000202906 3691 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Ubtfl1-203ENSMUST00000169398 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 CT010514.1-201ENSMUST00000214088 2969 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Med23-202ENSMUST00000092646 5098 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Gm10258-201ENSMUST00000091270 2123 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 1700071M16Rik-203ENSMUST00000169733 2504 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Gm17529-201ENSMUST00000180738 3093 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Gm42736-201ENSMUST00000200723 1353 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Gm8750-201ENSMUST00000173278 1537 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Skiv2l2-201ENSMUST00000022281 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Olfr11-202ENSMUST00000205631 3265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Ctage5-202ENSMUST00000069430 2869 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Gm23031-201ENSMUST00000157998 119 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Gm3216-201ENSMUST00000166927 486 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Gm3141-201ENSMUST00000168726 499 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Gm9376-201ENSMUST00000171107 729 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Gm27679-201ENSMUST00000184612 84 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Gm37774-201ENSMUST00000194401 245 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Gm42459-201ENSMUST00000199679 742 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Gm39119-201ENSMUST00000208466 951 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 4930542C16Rik-203ENSMUST00000212108 1207 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 4930567H12Rik-202ENSMUST00000212512 766 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 CU062626.1-201ENSMUST00000225248 505 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Sprr2d-201ENSMUST00000047477 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Olfr730-201ENSMUST00000051453 957 ntAPPRIS P2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Olfr1431-201ENSMUST00000072316 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Mdm4-202ENSMUST00000067429 3490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Gm35835-201ENSMUST00000214447 4589 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Gdpd4-201ENSMUST00000041860 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Gm12919-201ENSMUST00000119855 1594 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 4921539E11Rik-201ENSMUST00000030245 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 4933405O20Rik-201ENSMUST00000119710 1341 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Atp2b1-201ENSMUST00000020107 7130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Gm37429-201ENSMUST00000193807 1799 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Gm37420-201ENSMUST00000195332 2912 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Cps1-201ENSMUST00000027144 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 AC117769.3-201ENSMUST00000225814 1664 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 AC159195.2-201ENSMUST00000223670 3757 ntBASIC4.71□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Gm12874-201ENSMUST00000117190 913 ntBASIC4.71□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Gm13866-201ENSMUST00000118901 968 ntBASIC4.71□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Gm12186-201ENSMUST00000119050 945 ntBASIC4.71□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Gm14845-201ENSMUST00000121259 306 ntBASIC4.71□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Tmc5-204ENSMUST00000121744 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Gm15075-201ENSMUST00000122187 477 ntBASIC4.71□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Saxo1os-201ENSMUST00000131790 628 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Gm14349-201ENSMUST00000137155 902 ntBASIC4.71□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Gm24745-201ENSMUST00000157840 85 ntBASIC4.71□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Skint1-204ENSMUST00000162158 1260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Vmn1r-ps78-201ENSMUST00000178185 924 ntBASIC4.71□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Vmn1r-ps76-201ENSMUST00000179492 924 ntBASIC4.71□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Gm21399-201ENSMUST00000180210 597 ntBASIC4.71□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Gm28493-201ENSMUST00000188427 604 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Rrh-208ENSMUST00000200079 1106 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Gm29778-201ENSMUST00000201667 466 ntBASIC4.71□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Lrrc72-201ENSMUST00000020853 660 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Lrrc72-203ENSMUST00000221155 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Rnase12-202ENSMUST00000227764 673 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Dnah2-201ENSMUST00000035539 13569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Rnase12-201ENSMUST00000089798 545 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Gm29461-201ENSMUST00000189232 4176 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Ctage5-223ENSMUST00000219140 4194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Nrg1-203ENSMUST00000207470 5415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Vmn1r90-203ENSMUST00000226510 6674 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.71□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Zfp473-203ENSMUST00000120074 3624 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Rian-209ENSMUST00000182406 3476 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Tshr-204ENSMUST00000221216 1638 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Gm19368-201ENSMUST00000221258 4424 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Mgat4a-205ENSMUST00000151952 7251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Gm4841-201ENSMUST00000090260 2838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Gm10309-201ENSMUST00000095186 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Dclk1-208ENSMUST00000198437 4315 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Cse1l-210ENSMUST00000168599 2748 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Clock-205ENSMUST00000202651 9744 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Gm17167-201ENSMUST00000169242 5054 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Gm43328-201ENSMUST00000198544 1434 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Sfmbt2-201ENSMUST00000041105 7874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
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