Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Zfp605-201ENSMUST00000086686 2085 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
H2-M1F7CXU4 Xpo7-202ENSMUST00000167242 15121 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
H2-M1F7CXU4 Gm23739-201ENSMUST00000102295 108 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
H2-M1F7CXU4 Sec61g-202ENSMUST00000109642 691 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
H2-M1F7CXU4 Gm11821-201ENSMUST00000117335 979 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
H2-M1F7CXU4 Gm12610-201ENSMUST00000139272 581 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
H2-M1F7CXU4 Gm23082-201ENSMUST00000157852 133 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
H2-M1F7CXU4 Gm16164-201ENSMUST00000160078 468 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
H2-M1F7CXU4 BC050972-202ENSMUST00000169153 467 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
H2-M1F7CXU4 Gm17198-201ENSMUST00000171792 1154 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
H2-M1F7CXU4 Gm22655-201ENSMUST00000174949 96 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
H2-M1F7CXU4 1700006E09Rik-203ENSMUST00000176722 608 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
H2-M1F7CXU4 Gm3650-201ENSMUST00000180600 747 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
H2-M1F7CXU4 Gm27252-201ENSMUST00000183782 689 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
H2-M1F7CXU4 Mir6361-201ENSMUST00000185079 101 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
H2-M1F7CXU4 9430002A10Rik-202ENSMUST00000185395 475 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
H2-M1F7CXU4 Gm38303-201ENSMUST00000192603 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
H2-M1F7CXU4 Gm37256-201ENSMUST00000193034 566 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
H2-M1F7CXU4 Gm6631-201ENSMUST00000193699 559 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
H2-M1F7CXU4 Gm37758-201ENSMUST00000194275 629 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
H2-M1F7CXU4 Gm38413-201ENSMUST00000197852 348 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
H2-M1F7CXU4 Gm42880-201ENSMUST00000198028 459 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
H2-M1F7CXU4 Gm43688-201ENSMUST00000202249 310 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
H2-M1F7CXU4 9530003J23Rik-201ENSMUST00000020392 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
H2-M1F7CXU4 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
H2-M1F7CXU4 Gm10688-201ENSMUST00000214985 520 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
H2-M1F7CXU4 Gm7802-201ENSMUST00000216464 262 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
H2-M1F7CXU4 Gm18940-201ENSMUST00000222518 871 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
H2-M1F7CXU4 Gm34557-201ENSMUST00000223115 375 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
H2-M1F7CXU4 CT009515.3-201ENSMUST00000226509 671 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
H2-M1F7CXU4 Sntn-201ENSMUST00000061045 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
H2-M1F7CXU4 Gm11516-201ENSMUST00000118450 1582 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
H2-M1F7CXU4 Rnf32-201ENSMUST00000001247 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
H2-M1F7CXU4 P2ry13-201ENSMUST00000040622 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
H2-M1F7CXU4 Stra6l-202ENSMUST00000107782 4009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
H2-M1F7CXU4 AC121997.2-201ENSMUST00000228095 2294 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
H2-M1F7CXU4 Il18r1-205ENSMUST00000193793 1652 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
H2-M1F7CXU4 Galnt13-201ENSMUST00000068595 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
H2-M1F7CXU4 1700019D03Rik-203ENSMUST00000114493 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
H2-M1F7CXU4 Gm3106-201ENSMUST00000179743 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
H2-M1F7CXU4 Gm38137-201ENSMUST00000193735 1401 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
H2-M1F7CXU4 Olfr1217-204ENSMUST00000216592 3992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
H2-M1F7CXU4 Gm37717-201ENSMUST00000192647 3027 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
H2-M1F7CXU4 Gm43302-201ENSMUST00000050011 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M1F7CXU4 Olfr698-202ENSMUST00000214306 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M1F7CXU4 AC152944.1-201ENSMUST00000220160 3101 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M1F7CXU4 Chd9-201ENSMUST00000048665 12008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M1F7CXU4 Gm9408-201ENSMUST00000197375 1505 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M1F7CXU4 Gm40987-202ENSMUST00000221856 1588 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M1F7CXU4 Dgkk-201ENSMUST00000067410 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M1F7CXU4 Gm42697-201ENSMUST00000198992 4092 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M1F7CXU4 Ccdc110-201ENSMUST00000095326 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M1F7CXU4 Cdh8-201ENSMUST00000093249 3790 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M1F7CXU4 Gm42671-201ENSMUST00000198013 1604 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M1F7CXU4 Vmn2r3-202ENSMUST00000176328 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M1F7CXU4 Tmem45a-201ENSMUST00000023435 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M1F7CXU4 Gm6461-201ENSMUST00000120015 633 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M1F7CXU4 Olfr1004-ps1-201ENSMUST00000120361 580 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M1F7CXU4 Gm14925-201ENSMUST00000120611 438 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M1F7CXU4 Olfr1379-ps1-201ENSMUST00000120726 1001 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M1F7CXU4 Gm13998-201ENSMUST00000120952 335 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M1F7CXU4 Gm24382-201ENSMUST00000122698 107 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M1F7CXU4 Gm8988-201ENSMUST00000155015 1240 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M1F7CXU4 Gm24687-201ENSMUST00000157758 241 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M1F7CXU4 Gm22361-201ENSMUST00000158435 176 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M1F7CXU4 Gm3594-201ENSMUST00000169152 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M1F7CXU4 Gypc-201ENSMUST00000172434 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M1F7CXU4 Gm15257-201ENSMUST00000177680 883 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M1F7CXU4 Gm15252-201ENSMUST00000177750 883 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M1F7CXU4 Gm15256-201ENSMUST00000177793 883 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M1F7CXU4 Gm15260-201ENSMUST00000179402 883 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M1F7CXU4 Mir7685-201ENSMUST00000183555 62 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M1F7CXU4 Gm10603-203ENSMUST00000184875 508 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M1F7CXU4 Gm28358-201ENSMUST00000187860 636 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M1F7CXU4 Gm7266-201ENSMUST00000187999 405 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M1F7CXU4 Gm29289-201ENSMUST00000188358 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M1F7CXU4 Gm28357-201ENSMUST00000190256 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M1F7CXU4 Gm37375-201ENSMUST00000193859 387 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M1F7CXU4 Gm37385-201ENSMUST00000195223 387 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M1F7CXU4 Gm7166-201ENSMUST00000199715 303 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M1F7CXU4 Gm43798-201ENSMUST00000202056 394 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M1F7CXU4 Gm5110-201ENSMUST00000203122 1063 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M1F7CXU4 Mitf-208ENSMUST00000203938 1074 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M1F7CXU4 2200002A13Rik-201ENSMUST00000206633 709 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M1F7CXU4 Gm8291-201ENSMUST00000209635 1261 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M1F7CXU4 Cx3cl1-205ENSMUST00000211947 377 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M1F7CXU4 AC159896.3-201ENSMUST00000215904 3835 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M1F7CXU4 Gm18863-201ENSMUST00000217004 1299 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M1F7CXU4 A330049N07Rik-202ENSMUST00000219920 587 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M1F7CXU4 Gm9088-201ENSMUST00000220237 508 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M1F7CXU4 Gm18405-201ENSMUST00000220743 511 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M1F7CXU4 AC166574.3-201ENSMUST00000226725 367 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M1F7CXU4 AC120375.2-202ENSMUST00000228722 397 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M1F7CXU4 Ctag2-201ENSMUST00000033524 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M1F7CXU4 Olfr98-201ENSMUST00000080759 1039 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M1F7CXU4 Gm24041-201ENSMUST00000083115 156 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M1F7CXU4 Fam183b-202ENSMUST00000094156 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M1F7CXU4 Olfr1133-201ENSMUST00000099855 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M1F7CXU4 Vmn1r8-203ENSMUST00000228690 1699 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M1F7CXU4 Gm26606-201ENSMUST00000181292 2439 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms