Protein–RNA interactions for Protein: F6VAN0

Atf6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6F6VAN0 Gm3678-201ENSMUST00000218888 492 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 AC079644.1-201ENSMUST00000220586 405 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 Gm20474-202ENSMUST00000220772 462 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 Mylf-ps-201ENSMUST00000222174 421 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 AC108947.1-201ENSMUST00000224274 1000 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 AC150560.3-201ENSMUST00000227442 455 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 Cypt4-201ENSMUST00000053956 629 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 Bglap3-201ENSMUST00000075523 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 Sval3-201ENSMUST00000080742 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 n-R5s97-201ENSMUST00000082585 113 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 Gm31181-201ENSMUST00000217731 2283 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 Gm13928-201ENSMUST00000120326 1732 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 Mapk10-201ENSMUST00000086854 6630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 Zfp239-201ENSMUST00000079405 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 Kcnj6-203ENSMUST00000165538 3637 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 Gm42994-201ENSMUST00000195964 2549 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 Zfp78-203ENSMUST00000207314 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 Ikzf3-201ENSMUST00000103141 3658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 Rgs22-203ENSMUST00000172831 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 1810064F22Rik-203ENSMUST00000188595 2307 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 Pcmtd2-202ENSMUST00000108754 3499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 Gm45030-201ENSMUST00000207575 1774 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 Hrasls-201ENSMUST00000089824 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 Spam1-202ENSMUST00000202331 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 Rps15a-207ENSMUST00000172457 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 Gm31049-201ENSMUST00000201516 1302 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 AC121094.1-201ENSMUST00000224766 1345 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 Gm38082-201ENSMUST00000192800 6882 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 Mpdz-202ENSMUST00000107258 7241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 Gm15930-201ENSMUST00000156603 2037 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 Olfr645-201ENSMUST00000057104 3677 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 Gm29379-201ENSMUST00000186305 2166 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 Gm28276-201ENSMUST00000188508 2166 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 Gm28201-201ENSMUST00000189989 2166 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 Gm20749-201ENSMUST00000186319 3492 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 Fbxw27-208ENSMUST00000212725 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 Oxgr1-201ENSMUST00000058213 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 Olfr1360-203ENSMUST00000216083 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 Ptbp3-212ENSMUST00000174586 6640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 Luzp1-201ENSMUST00000001116 7246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 Tmem232-202ENSMUST00000086722 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 Olfr550-202ENSMUST00000216524 4957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 Stc1-201ENSMUST00000014957 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 Gm39139-202ENSMUST00000212621 5878 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 Olfr1293-ps-201ENSMUST00000102551 888 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 Gm23485-201ENSMUST00000104181 155 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 Gm13771-201ENSMUST00000117988 238 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 Rbpsuh-ps1-201ENSMUST00000119456 1006 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 Gm13815-201ENSMUST00000119963 412 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 Gm14728-201ENSMUST00000122196 492 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 Olfr1027-ps1-201ENSMUST00000122338 875 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 Gm16180-201ENSMUST00000128662 312 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 Usp46os1-201ENSMUST00000129275 508 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 Gm15787-206ENSMUST00000141008 585 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 Gm13775-201ENSMUST00000153865 751 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 Gm23031-201ENSMUST00000157998 119 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 Gm7418-201ENSMUST00000162120 801 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 Gm17085-201ENSMUST00000165425 502 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 Gm21638-201ENSMUST00000179473 836 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 Gm9274-201ENSMUST00000182505 984 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 Prl8a8-201ENSMUST00000018389 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 Gm8883-202ENSMUST00000188258 545 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 Gm20937-202ENSMUST00000189084 811 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 Gm20736-203ENSMUST00000190282 836 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 1700020G17Rik-203ENSMUST00000191286 723 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 Gm18865-201ENSMUST00000193011 1171 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 Gm35801-201ENSMUST00000193927 479 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 Gm6077-201ENSMUST00000196008 499 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 Gm43357-201ENSMUST00000197132 342 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 Iglc3-201ENSMUST00000200235 452 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 Gm43505-201ENSMUST00000200579 139 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 Gm44472-201ENSMUST00000204922 943 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 Gm35021-202ENSMUST00000210289 961 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 Olfr291-201ENSMUST00000211582 1159 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 CU024910.1-201ENSMUST00000214310 418 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 Gm7495-201ENSMUST00000215099 426 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 Olfr1543-ps1-201ENSMUST00000217448 908 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 AC164550.1-201ENSMUST00000217821 1066 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 3830406C13Rik-217ENSMUST00000225773 417 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 3300002A11Rik-201ENSMUST00000046994 654 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 4930550C14Rik-201ENSMUST00000005262 1237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 Vmn1r215-201ENSMUST00000072972 1048 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 Olfr961-201ENSMUST00000076548 949 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 Olfr850-201ENSMUST00000077347 948 ntAPPRIS P2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 Olfr1261-201ENSMUST00000077785 921 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 n-R5s169-201ENSMUST00000083110 120 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 Gm7731-201ENSMUST00000091759 470 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 Olfr390-201ENSMUST00000092919 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 Vmn1r87-201ENSMUST00000094827 888 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 Itch-201ENSMUST00000029126 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 Olfr972-203ENSMUST00000216167 1522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 Dsg1b-201ENSMUST00000076737 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 Rabgap1l-202ENSMUST00000028052 6338 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 Adamts6-203ENSMUST00000224208 6480 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 Crisp2-201ENSMUST00000024724 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 Olfr92-202ENSMUST00000214994 2073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 Gm42614-201ENSMUST00000198724 1554 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 Olfr615-203ENSMUST00000215673 3469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 Zfp799-205ENSMUST00000202988 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atf6F6VAN0 AC154642.2-201ENSMUST00000223657 2485 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms