Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Pcdh9-207ENSMUST00000195376 5096 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 Lair1-202ENSMUST00000086400 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 Olfr1006-202ENSMUST00000216084 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 Slamf6-201ENSMUST00000171330 2485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 AC116797.1-201ENSMUST00000223988 3955 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 Aspa-201ENSMUST00000021119 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 Heph-202ENSMUST00000079322 3904 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 Nlrp1b-202ENSMUST00000108514 3541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 Gm6853-202ENSMUST00000211360 4375 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 Gm44027-201ENSMUST00000203419 3480 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 Agbl2-202ENSMUST00000037219 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 4932411K12Rik-201ENSMUST00000190493 3156 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 Tmem156-204ENSMUST00000212080 1411 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 Map9-206ENSMUST00000195640 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 Muc15-203ENSMUST00000111017 3095 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 AC156569.1-201ENSMUST00000222020 3841 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 Zfp78-206ENSMUST00000208390 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 Gm10032-201ENSMUST00000071522 1887 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 Olfr1438-ps1-201ENSMUST00000208398 4761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 Zfp287-206ENSMUST00000185656 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 Gm13119-201ENSMUST00000094526 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 Igkv4-50-201ENSMUST00000103363 352 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 Olfr26-201ENSMUST00000104874 931 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 Gm8279-201ENSMUST00000112767 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 Gm8501-201ENSMUST00000117684 432 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 Gm15765-201ENSMUST00000118407 910 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 Gm7927-201ENSMUST00000118818 880 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 Gm14331-201ENSMUST00000120396 409 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 Olfr1379-ps1-201ENSMUST00000120726 1001 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 Gm15859-201ENSMUST00000132069 710 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 Fam229b-205ENSMUST00000135785 674 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 Gm14349-201ENSMUST00000137155 902 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 Snora47-201ENSMUST00000157483 138 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 Gm25374-201ENSMUST00000158158 101 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 G930045G22Rik-202ENSMUST00000161723 673 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 Gm20637-201ENSMUST00000175715 462 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 Obox6-ps1-201ENSMUST00000176658 1042 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 Gm3500-202ENSMUST00000178058 609 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 Gm26579-201ENSMUST00000181656 918 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 Trav1-202ENSMUST00000185651 329 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 Gm8367-201ENSMUST00000186145 887 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 Gm5260-201ENSMUST00000186157 949 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 Gm28586-201ENSMUST00000189857 456 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 Gm37358-201ENSMUST00000195492 479 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 Gm31887-201ENSMUST00000197661 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 Gm31211-201ENSMUST00000199170 253 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 Gm5554-201ENSMUST00000199726 1206 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 Gm7492-201ENSMUST00000201745 725 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 Olfr1476-ps1-201ENSMUST00000208572 367 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 Noxred1-201ENSMUST00000021423 1101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 1190001M18Rik-201ENSMUST00000215937 1270 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 Gm19212-201ENSMUST00000216642 862 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 AC163621.1-201ENSMUST00000220695 379 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 Lrrc72-203ENSMUST00000221155 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 Gm10037-203ENSMUST00000221620 636 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 AC166105.1-201ENSMUST00000227512 482 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 Snrpd1-201ENSMUST00000002551 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 Olfr1491-201ENSMUST00000052737 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 Olfr1342-201ENSMUST00000060562 1002 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 Rpl29-ps2-201ENSMUST00000086508 478 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 Rhox3h-201ENSMUST00000096457 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 Ccdc7a-201ENSMUST00000095158 1547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 Gm37311-201ENSMUST00000195541 2024 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 Vmn1r34-204ENSMUST00000226999 3048 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 Gm20342-201ENSMUST00000185480 9720 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 Olfr1443-203ENSMUST00000215134 3995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 D630030B08Rik-201ENSMUST00000202983 3479 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 Gm37781-201ENSMUST00000194773 3218 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 Casp1-201ENSMUST00000027015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 Olfr1250-203ENSMUST00000215730 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 AC117769.3-201ENSMUST00000225814 1664 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 Fam122b-202ENSMUST00000114838 3536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 Neto2-203ENSMUST00000209479 4936 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 Vmn2r117-201ENSMUST00000171996 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 Chd9-202ENSMUST00000109614 11565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 AC141438.1-201ENSMUST00000216055 3205 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 Pramel3-201ENSMUST00000113176 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 AC155710.1-201ENSMUST00000219913 1353 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 AC123629.1-201ENSMUST00000225669 1364 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 Zan-204ENSMUST00000164178 16451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 Slc22a27-202ENSMUST00000182102 1801 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 Gm44242-201ENSMUST00000204212 2721 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 Ezh1-201ENSMUST00000100417 3636 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 Cdc27-201ENSMUST00000093923 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 Gm4070-202ENSMUST00000176467 9007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 Gvin1-202ENSMUST00000183409 9005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 AW046200-203ENSMUST00000211787 2479 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 Gm33609-201ENSMUST00000198559 2694 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 Dnah2-202ENSMUST00000108659 13704 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 Obox7-201ENSMUST00000069740 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 Gm20750-201ENSMUST00000194274 3515 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 Olfr733-202ENSMUST00000214372 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 Gm43426-201ENSMUST00000197287 2597 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 Gm37482-201ENSMUST00000194899 2791 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 Snora35-201ENSMUST00000104579 128 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 Gm12308-201ENSMUST00000120440 389 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 Rhox3b-ps-201ENSMUST00000121045 868 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 Gm12596-201ENSMUST00000124589 673 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rd3lB2RV38 Gm12405-201ENSMUST00000141120 660 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.1 ms