Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm9285-201ENSMUST00000177691 697 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm5345-201ENSMUST00000183076 1014 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm29395-201ENSMUST00000188551 1049 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Scgb1b1-ps-201ENSMUST00000189264 268 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm28665-201ENSMUST00000189269 670 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm29409-202ENSMUST00000189623 901 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm29527-201ENSMUST00000190722 622 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 4930590H14Rik-201ENSMUST00000193999 551 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Mark1-ps1-201ENSMUST00000198516 717 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm32585-201ENSMUST00000198586 764 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm20052-204ENSMUST00000202443 648 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm44538-201ENSMUST00000205615 348 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Pttg1-202ENSMUST00000020687 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm44654-201ENSMUST00000208052 329 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm5338-201ENSMUST00000209530 639 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm29154-209ENSMUST00000213614 878 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm7435-201ENSMUST00000214039 486 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 AC165349.1-201ENSMUST00000217896 424 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm33308-202ENSMUST00000218566 652 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm9973-202ENSMUST00000220926 166 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Olfr109-201ENSMUST00000031086 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Tsx-201ENSMUST00000033691 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Olfr720-201ENSMUST00000035250 1023 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Olfr827-201ENSMUST00000058123 1058 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Ccr1l1-201ENSMUST00000071404 1166 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Olfr1276-201ENSMUST00000073322 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Olfr933-201ENSMUST00000075680 1003 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 mt-Tr-201ENSMUST00000082412 68 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Mef2c-228ENSMUST00000199450 2862 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Zfa-ps-202ENSMUST00000180673 3420 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Vmn1r22-206ENSMUST00000228905 2394 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Fam196b-201ENSMUST00000093192 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Dthd1-201ENSMUST00000170704 2427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm29730-201ENSMUST00000192986 1396 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Clca4a-201ENSMUST00000029923 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm21284-201ENSMUST00000205532 3736 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 AC135119.1-204ENSMUST00000228036 2663 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm6982-201ENSMUST00000118752 1560 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm21663-201ENSMUST00000196214 2864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm10735-201ENSMUST00000099162 2943 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Olfr1122-202ENSMUST00000215371 5036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Tgfbr1-203ENSMUST00000107725 1713 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Olfr48-202ENSMUST00000214428 3848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Hus1-201ENSMUST00000020683 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Dpcr1-201ENSMUST00000095467 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm20716-201ENSMUST00000138667 5288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Ptprd-220ENSMUST00000174831 4518 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Olfr1226-205ENSMUST00000216445 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm13881-201ENSMUST00000149025 3716 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Olfr1327-ps1-201ENSMUST00000117953 835 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Rps12-ps19-201ENSMUST00000119773 400 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Top3b-203ENSMUST00000119787 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Nlk-ps1-201ENSMUST00000120843 1230 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm12540-201ENSMUST00000121938 319 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm14974-201ENSMUST00000139112 804 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm11963-201ENSMUST00000149826 500 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm23228-201ENSMUST00000157296 270 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm24198-201ENSMUST00000157812 108 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Olfr733-201ENSMUST00000163469 994 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Atp2b4-208ENSMUST00000167348 243 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm20432-201ENSMUST00000173716 250 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm23968-201ENSMUST00000175047 125 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 7630403G23Rik-201ENSMUST00000184229 1084 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Nanog-ps2-201ENSMUST00000190988 529 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm28675-201ENSMUST00000191096 675 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm19777-201ENSMUST00000191940 358 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm7299-201ENSMUST00000194441 581 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm9504-201ENSMUST00000196322 468 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 1700094M23Rik-201ENSMUST00000197695 695 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm43227-201ENSMUST00000202239 677 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm9367-201ENSMUST00000205703 546 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm20074-201ENSMUST00000208144 484 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm2225-201ENSMUST00000209570 377 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
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Spocd1B1ASB6 Gm20751-201ENSMUST00000210260 1270 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Erc2-213ENSMUST00000211684 1074 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm45732-201ENSMUST00000212460 586 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm7413-201ENSMUST00000219498 462 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Olfr923-204ENSMUST00000219798 1068 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 A330049N07Rik-202ENSMUST00000219920 587 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 AC159622.2-201ENSMUST00000221592 983 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm18620-201ENSMUST00000222295 324 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 AC122290.1-201ENSMUST00000225631 1078 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 AC135086.1-201ENSMUST00000228621 817 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Olfr923-201ENSMUST00000051238 1068 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Olfr1020-201ENSMUST00000055840 1079 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Spink14-201ENSMUST00000060328 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Olfr866-201ENSMUST00000062248 1077 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Pomp-202ENSMUST00000201120 3850 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 1810046K07Rik-201ENSMUST00000039959 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Itih2-201ENSMUST00000042290 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Zfp266-201ENSMUST00000068296 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm1698-201ENSMUST00000136749 2313 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Ncr1-202ENSMUST00000126417 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Virma-203ENSMUST00000108307 6571 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Celf2-226ENSMUST00000183209 3852 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm44186-201ENSMUST00000204118 2752 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm44620-201ENSMUST00000209183 2887 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Mdga2-210ENSMUST00000222167 2871 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Mdga2-213ENSMUST00000223141 2850 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
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