Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Add3-201ENSMUST00000025999 4334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm32736-201ENSMUST00000200427 2701 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Olfr1252-202ENSMUST00000213196 3331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Cenpe-201ENSMUST00000062893 7910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Kcnma1-201ENSMUST00000065788 4524 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm11105-201ENSMUST00000112781 478 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm13013-201ENSMUST00000119087 523 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm11617-201ENSMUST00000119609 639 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Mgst1-205ENSMUST00000120939 913 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 4930412B13Rik-201ENSMUST00000149239 1276 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Sox5os3-202ENSMUST00000154167 765 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm22724-201ENSMUST00000158091 127 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm24395-201ENSMUST00000158139 125 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm16028-201ENSMUST00000162347 890 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm21772-201ENSMUST00000169213 478 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm9671-201ENSMUST00000171502 547 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm17126-201ENSMUST00000172276 523 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Mirt2-201ENSMUST00000175179 285 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 1700029M03Rik-202ENSMUST00000187517 357 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm32950-201ENSMUST00000193336 232 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Trav23-201ENSMUST00000199137 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 2200002A13Rik-201ENSMUST00000206633 709 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Olfr753-ps1-203ENSMUST00000208970 2764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm39336-201ENSMUST00000214933 260 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm3942-201ENSMUST00000218495 666 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 AC127242.4-201ENSMUST00000221242 470 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 AC164618.3-201ENSMUST00000224863 681 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 AC164302.1-201ENSMUST00000227036 433 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 AC170810.1-201ENSMUST00000228267 672 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 AC166574.7-201ENSMUST00000228502 704 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Mlip-201ENSMUST00000034910 1227 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Cd160-201ENSMUST00000047702 1121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Olfr1023-201ENSMUST00000056408 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Olfr1431-201ENSMUST00000072316 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Olfr1456-ps1-201ENSMUST00000087769 518 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Plcb4-202ENSMUST00000110109 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Morc2b-202ENSMUST00000131954 3857 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Slf1-201ENSMUST00000151524 3747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Toporsl-201ENSMUST00000029995 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm6145-206ENSMUST00000211251 2850 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Olfr351-203ENSMUST00000215137 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm43258-201ENSMUST00000200312 1950 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Olfr191-202ENSMUST00000215647 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 AC132384.12-201ENSMUST00000219608 4227 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Olfr828-202ENSMUST00000215380 1689 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 C030017G13Rik-201ENSMUST00000202959 2331 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Olfr537-ps1-202ENSMUST00000210949 2821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Trpm3-203ENSMUST00000087576 6740 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 A930004J17Rik-201ENSMUST00000192689 4610 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 4932415D10Rik-201ENSMUST00000171401 3163 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Akap11-202ENSMUST00000123853 9364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Glrx2-204ENSMUST00000129653 3515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Zfp974-201ENSMUST00000098639 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Vmn1r71-203ENSMUST00000227003 5048 ntAPPRIS P2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Vmn1r196-205ENSMUST00000228557 5790 ntAPPRIS P2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Fam35a-206ENSMUST00000228626 3100 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 9330178D15Rik-201ENSMUST00000196033 3451 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Utp14b-201ENSMUST00000053760 7393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Ppp1r1c-203ENSMUST00000111780 708 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Dynlt1-ps1-201ENSMUST00000117045 342 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm14606-201ENSMUST00000117078 1155 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm11911-201ENSMUST00000117938 1023 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Mrps36-ps2-201ENSMUST00000118658 309 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Pttg1-206ENSMUST00000121638 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm16135-201ENSMUST00000129470 568 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm14349-201ENSMUST00000137155 902 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 1700095A21Rik-201ENSMUST00000145269 1069 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm12301-201ENSMUST00000152963 523 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm22730-201ENSMUST00000158085 171 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm22636-201ENSMUST00000158142 275 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Tmem258-204ENSMUST00000166412 447 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Mir3097-201ENSMUST00000175356 67 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 1700003H04Rik-206ENSMUST00000180162 1086 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm27024-201ENSMUST00000182561 755 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm27209-201ENSMUST00000183834 898 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Rpap3-ps1-201ENSMUST00000190928 454 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm37838-201ENSMUST00000194464 312 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 4930562F17Rik-201ENSMUST00000195279 960 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm42619-201ENSMUST00000197564 1136 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Oaz3-204ENSMUST00000199678 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm4742-201ENSMUST00000200261 771 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm42581-201ENSMUST00000201774 966 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm43946-201ENSMUST00000204058 886 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Olfr65-202ENSMUST00000209528 1106 ntAPPRIS P2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 AC154595.2-201ENSMUST00000225067 310 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 1700003H04Rik-201ENSMUST00000047110 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Olfr1404-201ENSMUST00000056592 1034 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Spink14-201ENSMUST00000060328 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Olfr1337-201ENSMUST00000077247 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Ifitm6-201ENSMUST00000081924 663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Hlcs-209ENSMUST00000228910 4150 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Azin1-201ENSMUST00000065308 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Olfr1023-202ENSMUST00000213441 4740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm28278-201ENSMUST00000185603 1499 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm28279-201ENSMUST00000186248 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm28491-202ENSMUST00000186902 1493 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm29368-201ENSMUST00000187201 1489 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm28088-202ENSMUST00000187402 1493 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm28674-201ENSMUST00000187502 1493 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm28131-203ENSMUST00000187841 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms