Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 AA465934-205ENSMUST00000177533 308 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm26554-201ENSMUST00000180801 845 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm29337-201ENSMUST00000185425 284 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm38068-201ENSMUST00000192546 540 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Eif4e-202ENSMUST00000196990 856 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm43400-201ENSMUST00000197294 1254 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 4930526M16Rik-201ENSMUST00000197305 954 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm43467-201ENSMUST00000197441 437 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm8190-201ENSMUST00000199603 586 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm43867-201ENSMUST00000203860 525 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm19653-201ENSMUST00000204326 1039 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm18537-201ENSMUST00000205709 989 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm5324-201ENSMUST00000208115 476 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm44717-201ENSMUST00000208133 578 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm45883-201ENSMUST00000210131 853 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm7351-201ENSMUST00000210745 580 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm45607-201ENSMUST00000211143 678 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm41231-201ENSMUST00000211525 449 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 AC159622.2-201ENSMUST00000221592 983 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm9267-201ENSMUST00000222831 404 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 AC133598.3-204ENSMUST00000224260 767 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 AC114008.1-201ENSMUST00000226193 937 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 AC167013.4-201ENSMUST00000226712 317 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Psma4-201ENSMUST00000034848 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Vmn1r74-201ENSMUST00000050416 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Aph1c-201ENSMUST00000057261 715 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Olfr177-201ENSMUST00000072853 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm6902-201ENSMUST00000179072 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 AC132465.1-201ENSMUST00000219938 1307 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm39214-201ENSMUST00000210912 1542 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm40770-201ENSMUST00000220040 1502 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm26994-201ENSMUST00000182027 1571 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm7240-204ENSMUST00000222847 2239 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 G530011O06Rik-201ENSMUST00000154810 2380 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Kcnma1-204ENSMUST00000112423 3664 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Olfr49-202ENSMUST00000216214 5717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Atp2c1-202ENSMUST00000085133 4665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Zfp62-202ENSMUST00000109197 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 A930017M01Rik-201ENSMUST00000081361 2884 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Vmn2r109-201ENSMUST00000167093 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Fap-208ENSMUST00000174234 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm35629-201ENSMUST00000209684 2241 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Olfr104-ps-201ENSMUST00000178766 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm37780-201ENSMUST00000194117 1873 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 4930519E07Rik-201ENSMUST00000200907 1665 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Skint5-204ENSMUST00000171627 1611 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Olfr1138-202ENSMUST00000214573 1611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Tgif1-210ENSMUST00000172229 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Ctsr-201ENSMUST00000021889 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm42725-201ENSMUST00000199296 4193 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm136-201ENSMUST00000095129 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Cbll1-203ENSMUST00000101499 3900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm26340-201ENSMUST00000102365 99 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Pcnp-204ENSMUST00000122253 792 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm12827-201ENSMUST00000132690 660 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm12504-202ENSMUST00000148026 306 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Ttc39aos1-201ENSMUST00000150239 796 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Nudt12os-202ENSMUST00000152750 849 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm25550-201ENSMUST00000158079 128 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm8922-201ENSMUST00000170057 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm5871-201ENSMUST00000176461 718 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Mir5617-201ENSMUST00000176786 57 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm20617-202ENSMUST00000177332 758 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm5885-201ENSMUST00000178578 648 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm7713-201ENSMUST00000181201 1007 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Scgb1b21-202ENSMUST00000182901 278 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Olfr1025-ps1-201ENSMUST00000188749 921 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm29111-201ENSMUST00000188823 696 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 1810012K16Rik-201ENSMUST00000190830 547 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Nanog-ps2-201ENSMUST00000190988 529 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm28584-201ENSMUST00000191489 696 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm38138-201ENSMUST00000193274 696 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm7804-202ENSMUST00000194187 854 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm37991-201ENSMUST00000194297 696 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm4870-201ENSMUST00000198525 1251 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 1700001N15Rik-201ENSMUST00000199380 482 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm5554-201ENSMUST00000199726 1206 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm42579-201ENSMUST00000200512 734 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm43596-201ENSMUST00000202818 884 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 4833403J16Rik-201ENSMUST00000204490 1031 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm45700-201ENSMUST00000205866 347 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Olfr291-201ENSMUST00000211582 1159 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Asf1a-204ENSMUST00000219271 725 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 CT009527.2-201ENSMUST00000225386 606 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 1700028P14Rik-201ENSMUST00000035849 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Olfr771-201ENSMUST00000078914 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Ssxb5-201ENSMUST00000089370 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Acer3-201ENSMUST00000033020 11340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Wnk3-206ENSMUST00000184730 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Il1rapl1-203ENSMUST00000113966 9133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Vwa5a-201ENSMUST00000001544 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Ap5m1-208ENSMUST00000228238 3514 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Scn9a-207ENSMUST00000169900 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm43612-201ENSMUST00000196087 3207 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 F930017D23Rik-201ENSMUST00000099888 1836 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Olfr1406-202ENSMUST00000201132 2952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Olfr193-203ENSMUST00000208455 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Olfr911-ps1-202ENSMUST00000216496 3576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
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