Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbxo3-204ENSMUST00000111136 4211 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Clock-204ENSMUST00000202122 5508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr904-202ENSMUST00000216724 5197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp81-201ENSMUST00000054072 6639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr145-201ENSMUST00000086062 6796 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9268-201ENSMUST00000166914 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fundc2-201ENSMUST00000033541 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atf2-204ENSMUST00000112007 4195 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4933406B17Rik-201ENSMUST00000212602 4333 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15448-202ENSMUST00000108619 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r200-204ENSMUST00000227326 5449 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Defb47-201ENSMUST00000100492 359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ear-ps2-201ENSMUST00000100689 466 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Igkv6-15-201ENSMUST00000103393 347 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gp6-201ENSMUST00000108590 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14267-201ENSMUST00000119751 496 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22959-201ENSMUST00000122514 303 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12655-202ENSMUST00000133884 925 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Crem-216ENSMUST00000136961 807 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13189-201ENSMUST00000138462 252 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26765-201ENSMUST00000180844 692 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10030-203ENSMUST00000197321 3824 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem243-203ENSMUST00000198935 849 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44225-201ENSMUST00000203582 186 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44992-209ENSMUST00000209680 1083 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lgals2-201ENSMUST00000044584 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Defa36-201ENSMUST00000095424 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26994-201ENSMUST00000182027 1571 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5930-201ENSMUST00000111863 1746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8401-201ENSMUST00000120248 1739 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 9430098F02Rik-201ENSMUST00000180832 2986 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r39-208ENSMUST00000228919 2105 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16170-201ENSMUST00000156882 3754 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sdr16c6-202ENSMUST00000108383 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1179-202ENSMUST00000213157 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1423-202ENSMUST00000214472 5570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42544-201ENSMUST00000197868 3242 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdh6-201ENSMUST00000036439 8167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sspn-202ENSMUST00000111701 4512 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mettl4-201ENSMUST00000171284 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pja2-202ENSMUST00000024889 4345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm35028-201ENSMUST00000215400 2587 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn2r73-201ENSMUST00000077478 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ube4a-202ENSMUST00000117549 3415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1054-202ENSMUST00000213205 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24789-201ENSMUST00000104282 131 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22710-201ENSMUST00000116892 125 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6744-201ENSMUST00000119303 543 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700057H15Rik-201ENSMUST00000127913 595 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr377-ps1-201ENSMUST00000134011 1136 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700061J23Rik-201ENSMUST00000141678 537 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13062-201ENSMUST00000151337 562 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8362-202ENSMUST00000170673 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A730017C20Rik-206ENSMUST00000175830 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm3307-201ENSMUST00000176164 632 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trav12-2-201ENSMUST00000180972 426 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27039-201ENSMUST00000182438 962 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10603-203ENSMUST00000184875 508 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930519F24Rik-201ENSMUST00000185764 579 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8367-201ENSMUST00000186145 887 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A430093F15Rik-206ENSMUST00000189565 651 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
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