Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Ank3-208ENSMUST00000182029 3825 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Atp8a1-207ENSMUST00000135930 8069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 9330182O14Rik-202ENSMUST00000228780 2053 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Prom1-201ENSMUST00000030973 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Gm25344-201ENSMUST00000104503 132 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Gm15186-201ENSMUST00000119345 563 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Gm15266-201ENSMUST00000119635 255 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Gm12807-201ENSMUST00000121546 962 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Gm11263-201ENSMUST00000121853 749 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 6430573P05Rik-201ENSMUST00000192562 508 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Gm29920-201ENSMUST00000206876 754 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Gm8168-201ENSMUST00000209631 948 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1345-ps1-201ENSMUST00000210627 244 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 AC164424.1-201ENSMUST00000221690 170 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 CT025630.2-201ENSMUST00000228293 487 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Olfr198-201ENSMUST00000064452 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Olfr395-201ENSMUST00000072991 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Zfp972-201ENSMUST00000081529 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Gm24460-201ENSMUST00000082731 106 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Gm23846-201ENSMUST00000083835 107 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Tmem100-201ENSMUST00000092788 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Eps15-204ENSMUST00000132165 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Clec7a-204ENSMUST00000195589 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Mnat1-201ENSMUST00000021523 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Wdfy4-201ENSMUST00000061753 9681 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Gfpt1-204ENSMUST00000113658 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Vmn1r86-204ENSMUST00000227700 5487 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Ehbp1-207ENSMUST00000180360 4971 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Rdx-203ENSMUST00000163153 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Arhgap12-212ENSMUST00000182559 4265 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 AC144772.2-201ENSMUST00000228830 2859 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Matr3-215ENSMUST00000190121 2638 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Olfr994-204ENSMUST00000217218 1460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Trim40-201ENSMUST00000087158 2117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Sorbs2-201ENSMUST00000067065 6337 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Gm3424-201ENSMUST00000164585 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Gm44417-201ENSMUST00000203298 3359 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Gm13340-201ENSMUST00000117219 1545 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Gm44116-201ENSMUST00000204269 1525 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Olfr180-203ENSMUST00000206168 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Olfr301-201ENSMUST00000174362 1937 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1264-202ENSMUST00000216616 4311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Gip-201ENSMUST00000103156 607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Igkv5-37-201ENSMUST00000103372 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Gm11914-201ENSMUST00000117094 507 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Gm15126-201ENSMUST00000118631 833 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Gm16216-201ENSMUST00000118970 1111 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Gm15791-201ENSMUST00000120365 319 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Gm11882-201ENSMUST00000121463 506 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Gm13745-201ENSMUST00000121994 527 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Gm16331-201ENSMUST00000144274 498 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Gm13662-201ENSMUST00000157059 712 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Cfap61-214ENSMUST00000167179 183 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Gm17044-201ENSMUST00000168549 828 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Gm25598-201ENSMUST00000179031 107 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Gm29563-201ENSMUST00000187249 496 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
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Hdac5Q9Z2V6 Krtdap-205ENSMUST00000189673 345 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Krtdap-206ENSMUST00000189962 323 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Gm37523-201ENSMUST00000194901 412 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Gm43357-201ENSMUST00000197132 342 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Igkv4-77-201ENSMUST00000199410 352 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Gm44465-201ENSMUST00000199536 114 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Gm42584-201ENSMUST00000201404 220 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 1700028E10Rik-204ENSMUST00000201853 767 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 4930434O05Rik-201ENSMUST00000203259 387 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
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Hdac5Q9Z2V6 Olfr1289-202ENSMUST00000207494 1014 ntAPPRIS P2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
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Hdac5Q9Z2V6 AC122539.1-201ENSMUST00000219925 329 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
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Hdac5Q9Z2V6 AC131033.1-201ENSMUST00000228223 279 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 1700102P08Rik-201ENSMUST00000035234 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1390-201ENSMUST00000062719 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 n-R5s86-201ENSMUST00000083215 119 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 4930567H17Rik-201ENSMUST00000092405 840 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Krtdap-201ENSMUST00000098559 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Stk26-202ENSMUST00000114887 3173 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Cxcr4-201ENSMUST00000052172 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Armcx3-201ENSMUST00000081834 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Olfr93-203ENSMUST00000219235 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Psg29-201ENSMUST00000075934 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Usp40-201ENSMUST00000040783 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Gm26656-201ENSMUST00000181825 2972 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Gm45182-201ENSMUST00000207579 2404 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Ptk6-201ENSMUST00000016511 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Gm13262-201ENSMUST00000149014 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Olfr655-204ENSMUST00000216750 2010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Rtel1-201ENSMUST00000048608 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Ide-201ENSMUST00000131070 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Gm5903-201ENSMUST00000121836 2325 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Gm13102-201ENSMUST00000097799 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Dip2b-203ENSMUST00000108971 8127 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Pfkfb2-204ENSMUST00000171479 3342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 AC124421.1-201ENSMUST00000219114 4154 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Pabpc4l-201ENSMUST00000166505 5218 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Dclk1-202ENSMUST00000070418 7012 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Arnt-205ENSMUST00000107161 4260 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 183 ms