Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Slc12a1-202ENSMUST00000110494 4740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Olfr115-202ENSMUST00000221552 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Olfr115-203ENSMUST00000223366 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm340-201ENSMUST00000172371 3729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Trmt10a-206ENSMUST00000162864 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm15638-201ENSMUST00000128159 2062 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Son-205ENSMUST00000122302 2449 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm884-202ENSMUST00000167262 4576 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm37896-201ENSMUST00000195611 2791 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Cfap57-201ENSMUST00000071972 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Kif24-202ENSMUST00000108055 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 1810018F18Rik-203ENSMUST00000189764 1325 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Actrt1-201ENSMUST00000059466 1339 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Zfand6-201ENSMUST00000069537 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r181-208ENSMUST00000228842 4491 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Adgrg6-203ENSMUST00000208429 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Akap13-201ENSMUST00000166315 12543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm7903-202ENSMUST00000179953 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm36380-201ENSMUST00000210339 4379 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm15754-201ENSMUST00000119191 478 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm14472-201ENSMUST00000119815 282 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm12026-201ENSMUST00000120961 1024 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm13274-202ENSMUST00000137624 271 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Lcp1-209ENSMUST00000145303 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm16430-202ENSMUST00000178145 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm16405-202ENSMUST00000180150 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Mir6539-201ENSMUST00000183732 110 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm27159-201ENSMUST00000185132 432 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 AL607142.1-201ENSMUST00000226560 78 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Fpr-rs6-201ENSMUST00000095636 1020 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 AC152946.1-201ENSMUST00000218446 3474 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Ppp1r1c-202ENSMUST00000090760 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Lrif1-201ENSMUST00000098750 3103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Dab2-201ENSMUST00000078019 3793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Pfkfb3-214ENSMUST00000179584 4756 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Fam227a-203ENSMUST00000109648 5187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Akap11-202ENSMUST00000123853 9364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm37685-201ENSMUST00000193507 2177 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 A130010J15Rik-203ENSMUST00000160822 3793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 AC164297.2-201ENSMUST00000224388 1508 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Nlrp1c-ps-202ENSMUST00000174668 3422 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Cep162-201ENSMUST00000093802 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Klrc1-201ENSMUST00000032270 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Nrg1-203ENSMUST00000207470 5415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Cd200r3-206ENSMUST00000114622 1339 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 A330087D11Rik-201ENSMUST00000187265 1334 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm37553-201ENSMUST00000194135 1602 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Qser1-201ENSMUST00000117237 8973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Trav12n-1-201ENSMUST00000103587 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm7079-201ENSMUST00000119726 171 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Crem-206ENSMUST00000124747 973 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm11672-201ENSMUST00000140380 645 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm25655-201ENSMUST00000158465 290 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Clca3b-201ENSMUST00000159989 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm26537-201ENSMUST00000181474 652 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Trav12d-1-202ENSMUST00000183652 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm28683-201ENSMUST00000187134 615 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm28840-205ENSMUST00000189320 615 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 2010016I18Rik-203ENSMUST00000189683 841 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm28835-203ENSMUST00000190062 615 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm19585-202ENSMUST00000191539 327 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm38250-201ENSMUST00000192691 766 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm43768-201ENSMUST00000198380 1258 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm31747-201ENSMUST00000204638 3086 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm9278-201ENSMUST00000205508 553 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm35454-202ENSMUST00000214817 1101 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm31931-201ENSMUST00000219666 222 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm19169-201ENSMUST00000220109 1246 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 E430024I08Rik-208ENSMUST00000223312 1573 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 AC154846.2-201ENSMUST00000228805 424 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Amot-201ENSMUST00000112835 6519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 4930550L24Rik-202ENSMUST00000118305 1684 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Akt3-201ENSMUST00000019843 1511 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Cdh9-202ENSMUST00000228307 3539 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm42613-201ENSMUST00000199975 1931 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Tnfaip3-202ENSMUST00000105527 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Patj-204ENSMUST00000107029 4342 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Olfr54-203ENSMUST00000217480 5048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Cntrl-203ENSMUST00000113032 7085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 AC121960.2-201ENSMUST00000227349 3446 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Nlrp4g-201ENSMUST00000067621 2030 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Pcdh17-201ENSMUST00000071370 11451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r38-201ENSMUST00000108554 3663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Med12l-202ENSMUST00000040325 10159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 S100pbp-201ENSMUST00000049081 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Trpm8-202ENSMUST00000113114 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Zp3r-203ENSMUST00000142416 1835 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Dnah9-201ENSMUST00000080665 13798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Fhl4-201ENSMUST00000059383 3402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm23750-201ENSMUST00000104222 132 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm15971-201ENSMUST00000119372 211 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm13488-201ENSMUST00000120419 179 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r175-201ENSMUST00000166141 915 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r170-201ENSMUST00000170166 915 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm28075-201ENSMUST00000189179 354 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Ighv1-21-1-201ENSMUST00000195790 351 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Csn2-209ENSMUST00000199624 890 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm6070-201ENSMUST00000207275 419 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
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