Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Gm44199-201ENSMUST00000205219 739 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Gm17994-201ENSMUST00000209260 533 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 AC156802.1-201ENSMUST00000223623 579 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Samt3-201ENSMUST00000047945 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Gsdmc-201ENSMUST00000110125 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Nuf2-202ENSMUST00000111368 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Ncf2-202ENSMUST00000186568 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Fam126b-207ENSMUST00000161600 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Gm43745-201ENSMUST00000198085 1883 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Nova1-201ENSMUST00000021438 7154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Zfp473-203ENSMUST00000120074 3624 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Zbbx-204ENSMUST00000107778 2467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Vmn2r105-201ENSMUST00000167382 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Plch1-202ENSMUST00000059973 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Dcdc2c-204ENSMUST00000189735 1434 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Gm45562-201ENSMUST00000210015 1537 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Fcrl6-201ENSMUST00000094303 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Enox2-209ENSMUST00000167659 3632 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Syt4-201ENSMUST00000025110 3901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Ogdh-201ENSMUST00000003461 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Fam26d-202ENSMUST00000218239 3075 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Slc39a12-201ENSMUST00000082290 2675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Gm43113-201ENSMUST00000199713 1754 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Ear-ps2-201ENSMUST00000100689 466 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Izumo3-201ENSMUST00000107108 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Swi5-204ENSMUST00000113400 522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Pigp-201ENSMUST00000113905 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Gm13451-201ENSMUST00000117649 592 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Atf1-ps-201ENSMUST00000120608 810 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Gm28610-201ENSMUST00000187716 406 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Gm8581-201ENSMUST00000188636 890 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Gm37381-202ENSMUST00000194643 657 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Gm30928-201ENSMUST00000205858 459 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Dlg2-216ENSMUST00000209170 1057 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Gm6145-203ENSMUST00000210557 835 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Gm18705-201ENSMUST00000215985 913 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 AC156576.3-201ENSMUST00000221940 452 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Olfr694-201ENSMUST00000052535 1123 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Olfr694-202ENSMUST00000082091 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Olfr1348-201ENSMUST00000086319 957 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Kcnj16-202ENSMUST00000106636 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Zfp870-202ENSMUST00000228075 5222 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Vmn1r15-201ENSMUST00000228297 2021 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Gm43857-201ENSMUST00000200343 3079 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Olfr221-205ENSMUST00000216907 2859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Colec10-201ENSMUST00000036737 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Vmn1r171-212ENSMUST00000228674 2488 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Mfap3-203ENSMUST00000108849 4827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 E330013P04Rik-201ENSMUST00000065383 2070 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Gm29438-201ENSMUST00000191298 2613 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Alpk1-206ENSMUST00000198955 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Vmn1r27-202ENSMUST00000226666 2969 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Nlrp5-201ENSMUST00000015866 3508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Gm44584-201ENSMUST00000208395 2880 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Gm25919-201ENSMUST00000104271 132 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm15048-201ENSMUST00000118201 954 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm15877-201ENSMUST00000121897 964 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm25489-201ENSMUST00000158727 141 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm8920-201ENSMUST00000196153 924 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm18850-201ENSMUST00000211578 388 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm18591-201ENSMUST00000220568 763 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm7768-201ENSMUST00000222988 597 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 AC131033.2-201ENSMUST00000228138 1011 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 AC154806.5-205ENSMUST00000228828 411 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm5229-201ENSMUST00000039375 354 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm24525-201ENSMUST00000082917 151 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Vmn1r39-201ENSMUST00000226217 2258 ntAPPRIS P2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Vmn1r39-204ENSMUST00000227555 2297 ntAPPRIS P2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Vmn1r39-205ENSMUST00000228008 2283 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm8141-201ENSMUST00000190856 1723 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Mfap1a-201ENSMUST00000089926 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Cep57l1-202ENSMUST00000105505 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm3608-201ENSMUST00000086725 2858 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm42397-205ENSMUST00000208692 1449 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Hspa13-201ENSMUST00000046283 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm37078-201ENSMUST00000193314 2009 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 AC118639.1-203ENSMUST00000228425 2016 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Prom1-206ENSMUST00000171543 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Olfr590-ps1-201ENSMUST00000118801 898 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm13593-201ENSMUST00000121329 692 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Olfr118-201ENSMUST00000122036 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm14808-201ENSMUST00000129259 361 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm23774-201ENSMUST00000158990 131 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Cldn34a-201ENSMUST00000164764 636 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 1110046J04Rik-203ENSMUST00000181800 777 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm27193-201ENSMUST00000184217 586 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm29072-201ENSMUST00000191149 678 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm37591-201ENSMUST00000193283 650 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm37716-201ENSMUST00000193553 947 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Rhox7-ps2-201ENSMUST00000197804 322 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm34081-201ENSMUST00000221332 690 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 1700028P14Rik-201ENSMUST00000035849 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Clec4b1-201ENSMUST00000077228 674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 n-R5s215-201ENSMUST00000082480 104 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Focad-201ENSMUST00000097992 5791 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 BC065397-203ENSMUST00000134066 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Fchsd2-202ENSMUST00000098250 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Rbm41-201ENSMUST00000033810 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 AC114585.1-201ENSMUST00000228080 3680 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Lcp1-209ENSMUST00000145303 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
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