Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Gm17690-201ENSMUST00000180958 3467 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Prom1-206ENSMUST00000171543 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 4933409F18Rik-202ENSMUST00000222026 1584 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Vmn2r-ps139-201ENSMUST00000190764 2057 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Hspa13-202ENSMUST00000114244 2674 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Xcr1-201ENSMUST00000182350 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Gm18493-201ENSMUST00000192084 1612 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Olfr1381-202ENSMUST00000213256 4954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Gm42873-201ENSMUST00000196110 1726 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Olfr1155-202ENSMUST00000214641 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 4930544L04Rik-202ENSMUST00000211181 3204 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Ankrd55-205ENSMUST00000223871 3209 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Zfhx4-203ENSMUST00000175866 11287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Nlrp1b-204ENSMUST00000108516 4134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Sorbs2-214ENSMUST00000134675 1692 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 4930519E07Rik-201ENSMUST00000200907 1665 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Rnf145-202ENSMUST00000101327 4214 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Gm10373-201ENSMUST00000100683 668 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Gm23440-201ENSMUST00000104299 130 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 B4galt4-203ENSMUST00000114710 837 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Gm15161-201ENSMUST00000117340 387 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Gm15040-201ENSMUST00000118561 1241 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Mrps36-ps2-201ENSMUST00000118658 309 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Gm15971-201ENSMUST00000119372 211 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Pttg1-206ENSMUST00000121638 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Gm25047-201ENSMUST00000122667 104 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Gstm2-201ENSMUST00000012348 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Gm13029-201ENSMUST00000137283 594 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 4933430M04Rik-201ENSMUST00000152726 744 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Gm22214-201ENSMUST00000157563 172 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Gm23896-201ENSMUST00000158109 130 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Gm24733-201ENSMUST00000158863 253 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Dab2-209ENSMUST00000161040 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Gm4207-201ENSMUST00000173144 960 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Gm20490-201ENSMUST00000173622 198 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Gm20480-201ENSMUST00000173953 250 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Mir7082-201ENSMUST00000183526 92 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Gm8641-201ENSMUST00000186995 826 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Gm7135-201ENSMUST00000187538 675 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Gm28209-201ENSMUST00000187956 775 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 1700025B11Rik-201ENSMUST00000190233 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Csf2-201ENSMUST00000019060 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Gm18407-201ENSMUST00000192126 790 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Gm6631-201ENSMUST00000193699 559 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Snurf-201ENSMUST00000194059 216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Gm43765-201ENSMUST00000196303 893 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Gm44382-201ENSMUST00000198683 122 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Gm43222-201ENSMUST00000199013 603 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Gm42109-202ENSMUST00000200893 664 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Gm45343-201ENSMUST00000210452 828 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Cx3cl1-205ENSMUST00000211947 377 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Olfr1084-201ENSMUST00000216851 961 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 AC167202.1-201ENSMUST00000219027 331 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 AC153357.1-201ENSMUST00000219190 482 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Gm35890-201ENSMUST00000221195 564 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 AC073562.1-201ENSMUST00000222117 401 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 AC132881.2-201ENSMUST00000225474 709 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 AC137871.3-201ENSMUST00000226628 225 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Olfr1336-201ENSMUST00000056120 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Tas2r117-201ENSMUST00000068302 1158 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Il15ra-213ENSMUST00000135341 1545 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Slamf6-201ENSMUST00000171330 2485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Zzz3-210ENSMUST00000200570 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Ncoa4-201ENSMUST00000111994 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 9330111N05Rik-201ENSMUST00000180409 1407 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Oas2-202ENSMUST00000081491 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Cab39l-201ENSMUST00000022553 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Pramel5-202ENSMUST00000105752 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 4933406F09Rik-204ENSMUST00000181409 2078 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 F830112A20Rik-201ENSMUST00000194249 3552 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Vmn2r3-202ENSMUST00000176328 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 F830016B08Rik-201ENSMUST00000171297 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Tmem74-201ENSMUST00000067469 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 4932435O22Rik-202ENSMUST00000148405 3406 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Lilra6-201ENSMUST00000038176 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Zdhhc17-201ENSMUST00000041723 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Olfr994-204ENSMUST00000217218 1460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Synj2bp-203ENSMUST00000163402 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Spata1-206ENSMUST00000197980 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Gm37332-201ENSMUST00000195853 2844 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Gm14326-201ENSMUST00000108928 767 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Agxt2-203ENSMUST00000110541 1222 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Gm15715-201ENSMUST00000118032 283 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Gm7927-201ENSMUST00000118818 880 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Gm14842-201ENSMUST00000119577 269 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Gm11990-201ENSMUST00000121505 897 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Gm15875-201ENSMUST00000152264 273 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Gm14343-201ENSMUST00000154524 731 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Gm6904-201ENSMUST00000168702 898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Speer4c-202ENSMUST00000179506 480 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Gm29356-201ENSMUST00000186935 373 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Gm37502-201ENSMUST00000192981 356 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Gm37358-201ENSMUST00000195492 479 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Gm18445-201ENSMUST00000195502 774 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Gm42880-201ENSMUST00000198028 459 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Gm31211-201ENSMUST00000199170 253 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Gm5990-201ENSMUST00000203126 746 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Gm44312-201ENSMUST00000203536 469 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Gm38584-201ENSMUST00000207361 517 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Tespa1-202ENSMUST00000217702 1102 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms