Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Gm18717-201ENSMUST00000192744 1241 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Trim12aQ99PQ1 Gm37770-201ENSMUST00000192855 772 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Trim12aQ99PQ1 Gm8860-201ENSMUST00000193160 445 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Trim12aQ99PQ1 Gm7626-201ENSMUST00000195801 353 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Trim12aQ99PQ1 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
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Trim12aQ99PQ1 Trdv3-201ENSMUST00000198551 309 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Trim12aQ99PQ1 Gm18290-201ENSMUST00000202900 844 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Trim12aQ99PQ1 Gm19653-201ENSMUST00000204326 1039 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Trim12aQ99PQ1 Gm19039-201ENSMUST00000204363 575 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Trim12aQ99PQ1 Gm39129-201ENSMUST00000207553 806 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
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Trim12aQ99PQ1 AC107757.1-201ENSMUST00000226780 357 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
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Trim12aQ99PQ1 Ifi204-201ENSMUST00000111214 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
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Trim12aQ99PQ1 B230118H07Rik-208ENSMUST00000160037 1139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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Trim12aQ99PQ1 Slf1-201ENSMUST00000151524 3747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
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Trim12aQ99PQ1 Gm15901-201ENSMUST00000117663 941 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
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Trim12aQ99PQ1 Gm8855-201ENSMUST00000118888 878 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
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Trim12aQ99PQ1 4930586N03Rik-201ENSMUST00000122940 881 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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