Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 AC158388.2-201ENSMUST00000223665 1314 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
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Atg4aQ8C9S8 A230107N01Rik-201ENSMUST00000180894 2348 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Atg4aQ8C9S8 Zbed6-201ENSMUST00000190574 5007 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Atg4aQ8C9S8 4921539E11Rik-203ENSMUST00000168664 2356 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
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Atg4aQ8C9S8 G930045G22Rik-201ENSMUST00000101402 480 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Atg4aQ8C9S8 Ssxb10-201ENSMUST00000103003 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
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Atg4aQ8C9S8 Gm23280-201ENSMUST00000157905 139 ntBASIC7□□□□□ -1.29
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Atg4aQ8C9S8 AC155929.4-201ENSMUST00000218493 491 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
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Atg4aQ8C9S8 Atp2c1-202ENSMUST00000085133 4665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Atg4aQ8C9S8 Gm42827-201ENSMUST00000197058 1515 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Atg4aQ8C9S8 Sspo-202ENSMUST00000169350 15571 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
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Atg4aQ8C9S8 Csde1-214ENSMUST00000199240 3457 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
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Atg4aQ8C9S8 Pum2-203ENSMUST00000111123 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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Atg4aQ8C9S8 Senp8-206ENSMUST00000216329 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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Atg4aQ8C9S8 Mir546-201ENSMUST00000102105 121 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Atg4aQ8C9S8 Igkv15-103-201ENSMUST00000103324 375 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Atg4aQ8C9S8 Mup19-202ENSMUST00000107477 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Atg4aQ8C9S8 Gm14106-201ENSMUST00000119382 438 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Atg4aQ8C9S8 Gm7079-201ENSMUST00000119726 171 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Atg4aQ8C9S8 Gm14267-201ENSMUST00000119751 496 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Atg4aQ8C9S8 Gm5405-201ENSMUST00000120478 609 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Atg4aQ8C9S8 Gm15335-201ENSMUST00000122442 411 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Atg4aQ8C9S8 Apol7d-203ENSMUST00000126516 1193 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Atg4aQ8C9S8 Gm24363-201ENSMUST00000158440 311 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Atg4aQ8C9S8 Gm6205-201ENSMUST00000165424 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Atg4aQ8C9S8 Phf11b-201ENSMUST00000166121 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
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