Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Jade3-202ENSMUST00000115384 4866 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Akap11-202ENSMUST00000123853 9364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Gli3-201ENSMUST00000110510 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Gm21051-201ENSMUST00000221757 1688 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Cx3cr1-203ENSMUST00000215016 4493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Mettl21e-201ENSMUST00000054801 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Gm8279-201ENSMUST00000112767 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Gm14606-201ENSMUST00000117078 1155 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Gm10319-202ENSMUST00000159439 846 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Gm28847-201ENSMUST00000186778 700 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Nts-201ENSMUST00000020040 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 9830132P13Rik-201ENSMUST00000198240 4187 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Fap-201ENSMUST00000000402 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 3000002C10Rik-203ENSMUST00000144161 3977 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 4933411O13Rik-201ENSMUST00000050665 1464 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Atf2-207ENSMUST00000112017 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Ripk1-203ENSMUST00000167374 6472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Gm33027-201ENSMUST00000206093 4664 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Dmtf1-207ENSMUST00000183973 2408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Adam34-202ENSMUST00000212185 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Gm37078-201ENSMUST00000193314 2009 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Bloc1s1-202ENSMUST00000131271 475 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Gm25389-201ENSMUST00000157340 286 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Mir6963-201ENSMUST00000183535 71 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Supt4b-201ENSMUST00000214434 351 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Tas2r129-201ENSMUST00000070991 965 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Mir194-1-201ENSMUST00000083647 67 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Defb25-201ENSMUST00000099203 293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Tnfaip3-202ENSMUST00000105527 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Olfr508-201ENSMUST00000072914 1635 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 AC116726.1-201ENSMUST00000215028 3497 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Arsk-201ENSMUST00000120573 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Lsamp-202ENSMUST00000099761 8794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 5830444B04Rik-204ENSMUST00000166921 2870 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Cep162-201ENSMUST00000093802 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Gm37364-201ENSMUST00000192533 3920 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Iqcb1-202ENSMUST00000114819 2797 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Gm42613-201ENSMUST00000199975 1931 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Cyp2c50-201ENSMUST00000068094 1643 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Myh10-202ENSMUST00000092984 7759 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Gm13033-201ENSMUST00000117591 1057 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Gm12701-201ENSMUST00000134206 659 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Vmn1r-ps66-201ENSMUST00000173436 612 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Olfr424-201ENSMUST00000053941 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Mrpl17-202ENSMUST00000124482 7300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Igsf1-201ENSMUST00000033442 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Glcci1-203ENSMUST00000161494 3248 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 E330034G19Rik-203ENSMUST00000161740 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Gm8401-201ENSMUST00000120248 1739 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Gm26707-201ENSMUST00000181552 3902 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Rnf2-204ENSMUST00000187048 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Akap4-203ENSMUST00000115751 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Cylc2-201ENSMUST00000041392 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 AC117570.1-201ENSMUST00000214015 1886 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Srcap-207ENSMUST00000187040 10654 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Nr3c1-204ENSMUST00000115571 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Gm44829-201ENSMUST00000208008 3193 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Cd200r3-204ENSMUST00000114612 731 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
NischQ80TM9 Cd200r3-210ENSMUST00000171779 1223 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
NischQ80TM9 D930016D06Rik-202ENSMUST00000181620 3805 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
NischQ80TM9 C030032O16Rik-201ENSMUST00000196427 716 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
NischQ80TM9 Gm6702-201ENSMUST00000208496 471 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
NischQ80TM9 AC132384.8-201ENSMUST00000218152 1204 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
NischQ80TM9 AC165347.1-201ENSMUST00000224089 1025 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
NischQ80TM9 Cd200r3-201ENSMUST00000048479 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
NischQ80TM9 Cd200r3-202ENSMUST00000077178 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
NischQ80TM9 Nxf2-201ENSMUST00000010085 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
NischQ80TM9 Tardbp-202ENSMUST00000084125 7477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
NischQ80TM9 Cd200r3-206ENSMUST00000114622 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
NischQ80TM9 Gm45250-201ENSMUST00000209414 3592 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
NischQ80TM9 AC105407.2-205ENSMUST00000224680 2733 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
NischQ80TM9 Gm42686-201ENSMUST00000199172 4108 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
NischQ80TM9 Atm-201ENSMUST00000118282 10006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
NischQ80TM9 Abca17-202ENSMUST00000121226 5317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
NischQ80TM9 Itih4-204ENSMUST00000168782 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
NischQ80TM9 Adcy10-201ENSMUST00000027852 5210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NischQ80TM9 Adarb2-201ENSMUST00000064473 6721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NischQ80TM9 Lgals8-208ENSMUST00000144283 1148 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
NischQ80TM9 Gm27754-201ENSMUST00000183340 126 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
NischQ80TM9 Gm27209-201ENSMUST00000183834 898 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
NischQ80TM9 Gm30928-202ENSMUST00000206881 271 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
NischQ80TM9 AC161114.1-201ENSMUST00000218223 474 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
NischQ80TM9 Olfr894-201ENSMUST00000093866 949 ntAPPRIS P2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
NischQ80TM9 Tenm1-201ENSMUST00000016294 8365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NischQ80TM9 Stard9-201ENSMUST00000070420 4874 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NischQ80TM9 Xpr1-201ENSMUST00000027741 7492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NischQ80TM9 Cnot4-202ENSMUST00000114989 3279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NischQ80TM9 Epha4-201ENSMUST00000027451 6328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NischQ80TM9 Zfp110-205ENSMUST00000168247 2499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
NischQ80TM9 Zfp965-202ENSMUST00000109042 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NischQ80TM9 Gm11759-201ENSMUST00000121742 464 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
NischQ80TM9 Zfp973-202ENSMUST00000121956 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NischQ80TM9 Gm15840-201ENSMUST00000122099 943 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
NischQ80TM9 Gm13147-201ENSMUST00000125785 585 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
NischQ80TM9 Gm11716-201ENSMUST00000154414 470 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NischQ80TM9 4933417A18Rik-201ENSMUST00000160279 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NischQ80TM9 Mir6400-201ENSMUST00000184870 92 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
NischQ80TM9 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
NischQ80TM9 Gm40787-201ENSMUST00000218056 317 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
NischQ80TM9 AC161383.1-201ENSMUST00000227356 527 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
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