Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 2700049A03Rik-201ENSMUST00000045907 4507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr328-204ENSMUST00000216725 2904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Cyld-206ENSMUST00000209559 4476 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44235-201ENSMUST00000204312 3058 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 5430401H09Rik-202ENSMUST00000218836 2620 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22370-201ENSMUST00000102422 83 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Magea6-202ENSMUST00000112562 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5073-201ENSMUST00000118222 820 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11987-201ENSMUST00000118524 381 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Atf1-ps-201ENSMUST00000120608 810 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15848-203ENSMUST00000136015 482 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6872-201ENSMUST00000165001 700 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37184-201ENSMUST00000194720 650 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 AC123705.4-203ENSMUST00000221566 380 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Magea6-201ENSMUST00000076986 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 CT025686.2-201ENSMUST00000227898 3315 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Rxfp1-201ENSMUST00000078527 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Gmeb1-207ENSMUST00000168553 6523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Fam35a-206ENSMUST00000228626 3100 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Map2-205ENSMUST00000114015 5440 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Serpinb9-202ENSMUST00000063191 3472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Csnk1g1-201ENSMUST00000034949 7208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Golga1-202ENSMUST00000112850 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 AC154734.1-201ENSMUST00000219957 2141 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Gng12-201ENSMUST00000043148 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r37-202ENSMUST00000226311 1305 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn2r22-201ENSMUST00000170808 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26603-201ENSMUST00000181380 2861 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Cdc27-201ENSMUST00000093923 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr361-201ENSMUST00000100145 969 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22499-201ENSMUST00000104501 135 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14220-201ENSMUST00000118114 449 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Mup-ps16-201ENSMUST00000120085 596 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7580-201ENSMUST00000132826 497 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Klra8-201ENSMUST00000014476 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22867-201ENSMUST00000157499 109 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3216-201ENSMUST00000166927 486 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3141-201ENSMUST00000168726 499 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr102-201ENSMUST00000169373 1027 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 1700010L04Rik-203ENSMUST00000179662 1015 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm18865-201ENSMUST00000193011 1171 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37982-201ENSMUST00000193076 561 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42716-201ENSMUST00000196003 680 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43945-201ENSMUST00000203595 754 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
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Ccdc88cQ6VGS5 Olfr527-202ENSMUST00000214143 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38224-201ENSMUST00000191648 2100 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37254-201ENSMUST00000193542 3901 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Filip1l-203ENSMUST00000159816 4452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45250-201ENSMUST00000209414 3592 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Adam21-201ENSMUST00000008582 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
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Ccdc88cQ6VGS5 Nedd9-201ENSMUST00000021794 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
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Ccdc88cQ6VGS5 AC158232.1-201ENSMUST00000217882 2071 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Prrc2c-209ENSMUST00000182593 9022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Ppig-202ENSMUST00000090858 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm15741-201ENSMUST00000119401 754 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Mettl5os-201ENSMUST00000129114 667 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16135-201ENSMUST00000129470 568 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem216-205ENSMUST00000145210 774 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
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Ccdc88cQ6VGS5 Focad-201ENSMUST00000097992 5791 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37738-201ENSMUST00000192396 4716 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Fam205c-201ENSMUST00000055944 1655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Wdr64-202ENSMUST00000171939 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6882-202ENSMUST00000207192 2365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Lgi1-207ENSMUST00000198518 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm46136-202ENSMUST00000217053 6329 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 AC120347.2-201ENSMUST00000222224 2015 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr62-203ENSMUST00000217013 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm19272-201ENSMUST00000184133 1753 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Muc15-201ENSMUST00000090332 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Trim24-202ENSMUST00000120238 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Sgip1-202ENSMUST00000072481 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 LOC102637012-201ENSMUST00000217248 2562 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Cyp2c65-201ENSMUST00000087236 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5405-201ENSMUST00000120478 609 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Rps11-ps2-201ENSMUST00000121547 456 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23233-201ENSMUST00000157301 137 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22650-201ENSMUST00000175138 105 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28943-201ENSMUST00000186187 615 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28736-201ENSMUST00000186257 615 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29401-201ENSMUST00000186690 615 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29178-204ENSMUST00000186784 615 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28589-201ENSMUST00000186991 615 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
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