Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Gm45169-201ENSMUST00000205717 639 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Olfr1360-203ENSMUST00000216083 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Nqo2-201ENSMUST00000021843 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 AC124420.1-201ENSMUST00000219779 791 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Gm3772-201ENSMUST00000221404 1887 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Samt3-201ENSMUST00000047945 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Tlr1-201ENSMUST00000059349 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Magea6-201ENSMUST00000076986 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Akr1c19-201ENSMUST00000081326 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Olfr9-201ENSMUST00000091996 2672 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Zfp708-202ENSMUST00000109743 2536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Olfr401-202ENSMUST00000213754 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Olfr1220-203ENSMUST00000213288 4223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 AC158232.1-201ENSMUST00000217882 2071 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Gm2016-201ENSMUST00000110147 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 AC154576.1-202ENSMUST00000223966 3320 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Gm45406-201ENSMUST00000210161 1637 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Gm28687-201ENSMUST00000187203 1494 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Gm29373-201ENSMUST00000190660 1494 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Ipo11-205ENSMUST00000186033 4147 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Ms4a13-202ENSMUST00000188464 1301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Ints6l-202ENSMUST00000101553 3201 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 AC154734.1-201ENSMUST00000219957 2141 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Slfn8-206ENSMUST00000215239 2930 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Zfp143-205ENSMUST00000211798 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Gm33336-201ENSMUST00000219656 1676 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Dopey1-218ENSMUST00000190957 9187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Gm46136-202ENSMUST00000217053 6329 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Arhgap12-202ENSMUST00000077128 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Clec4e-201ENSMUST00000032239 2518 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Pirt-201ENSMUST00000123434 4200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Nemf-201ENSMUST00000021368 4732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Gm43502-201ENSMUST00000200263 2596 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Piga-202ENSMUST00000112255 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Zfp59-202ENSMUST00000205701 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Atg9aQ68FE2 Gm22499-201ENSMUST00000104501 135 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Atg9aQ68FE2 Gm14521-201ENSMUST00000119545 350 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Atg9aQ68FE2 Gm13533-201ENSMUST00000121104 177 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Atg9aQ68FE2 Gm16139-201ENSMUST00000160015 420 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Atg9aQ68FE2 Ear-ps5-201ENSMUST00000164700 463 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Atg9aQ68FE2 Mir7008-201ENSMUST00000184398 63 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Atg9aQ68FE2 5033404E19Rik-201ENSMUST00000192616 630 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Atg9aQ68FE2 Gm42652-201ENSMUST00000199073 614 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Atg9aQ68FE2 Gm45525-201ENSMUST00000210800 389 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Atg9aQ68FE2 Gm29521-203ENSMUST00000216148 805 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Atg9aQ68FE2 Gm31698-203ENSMUST00000217115 690 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Atg9aQ68FE2 Gm19168-201ENSMUST00000218804 1091 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Atg9aQ68FE2 AC154636.1-201ENSMUST00000223226 126 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Atg9aQ68FE2 AC164618.3-201ENSMUST00000224863 681 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Atg9aQ68FE2 AC124408.2-201ENSMUST00000228168 645 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Atg9aQ68FE2 Fcer1a-201ENSMUST00000049706 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Atg9aQ68FE2 n-R5s36-201ENSMUST00000082998 119 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Atg9aQ68FE2 Gm16513-202ENSMUST00000201663 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Atg9aQ68FE2 Atf7-210ENSMUST00000184616 7147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Atg9aQ68FE2 Med12-201ENSMUST00000087948 6809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Atg9aQ68FE2 Gm8980-201ENSMUST00000140232 2197 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Atg9aQ68FE2 Sgip1-202ENSMUST00000072481 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Atg9aQ68FE2 Il18r1-202ENSMUST00000108044 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Atg9aQ68FE2 Lcp1-209ENSMUST00000145303 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Atg9aQ68FE2 Gm38026-201ENSMUST00000193284 3880 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Atg9aQ68FE2 Olfr1085-202ENSMUST00000213279 5191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Atg9aQ68FE2 Xpnpep3-203ENSMUST00000163754 5383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Atg9aQ68FE2 Rc3h2-202ENSMUST00000112934 8948 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Atg9aQ68FE2 4930544L04Rik-202ENSMUST00000211181 3204 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Atg9aQ68FE2 Ube4a-201ENSMUST00000117506 6039 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Atg9aQ68FE2 Gm39139-202ENSMUST00000212621 5878 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Atg9aQ68FE2 Ing3-201ENSMUST00000031680 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Atg9aQ68FE2 Gm9894-201ENSMUST00000171257 2904 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Atg9aQ68FE2 CT025686.2-201ENSMUST00000227898 3315 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Atg9aQ68FE2 Tdo2-204ENSMUST00000193879 1616 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Atg9aQ68FE2 2700049A03Rik-201ENSMUST00000045907 4507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Atg9aQ68FE2 Gm37132-201ENSMUST00000195553 2238 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Atg9aQ68FE2 Gm29438-201ENSMUST00000191298 2613 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Atg9aQ68FE2 Gm3636-201ENSMUST00000100904 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Atg9aQ68FE2 Gm3173-201ENSMUST00000112776 519 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Atg9aQ68FE2 Mageb16-ps1-201ENSMUST00000117991 1127 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Atg9aQ68FE2 Oosp3-202ENSMUST00000119053 621 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Atg9aQ68FE2 Gm7079-201ENSMUST00000119726 171 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Atg9aQ68FE2 Spdya-203ENSMUST00000144142 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Atg9aQ68FE2 Gm26069-201ENSMUST00000157497 277 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Atg9aQ68FE2 Gm26172-201ENSMUST00000158421 134 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Atg9aQ68FE2 Gm3173-202ENSMUST00000164603 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Atg9aQ68FE2 Gm3264-201ENSMUST00000166410 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Atg9aQ68FE2 Gm8108-201ENSMUST00000167397 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Atg9aQ68FE2 Gm3005-201ENSMUST00000178060 444 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Atg9aQ68FE2 Gm3488-201ENSMUST00000178220 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Atg9aQ68FE2 Gm3317-201ENSMUST00000179659 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Atg9aQ68FE2 1110046J04Rik-203ENSMUST00000181800 777 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Atg9aQ68FE2 Gm27193-201ENSMUST00000184217 586 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Atg9aQ68FE2 Gm28507-201ENSMUST00000189737 703 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Atg9aQ68FE2 Gm37308-201ENSMUST00000194684 100 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Atg9aQ68FE2 Gm5110-201ENSMUST00000203122 1063 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Atg9aQ68FE2 Gm8039-201ENSMUST00000204758 712 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Atg9aQ68FE2 Gm45820-201ENSMUST00000212068 362 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Atg9aQ68FE2 Gm7990-201ENSMUST00000212126 593 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Atg9aQ68FE2 AC122332.1-201ENSMUST00000214384 285 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Atg9aQ68FE2 Gm19174-201ENSMUST00000216944 956 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Atg9aQ68FE2 Spata9-201ENSMUST00000022081 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Atg9aQ68FE2 Gm9202-201ENSMUST00000223036 437 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Atg9aQ68FE2 AC192333.6-201ENSMUST00000224565 725 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.4 ms