Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

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Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Gm28850-201ENSMUST00000189058 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Gm28300-202ENSMUST00000189170 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 1700031M16Rik-204ENSMUST00000189724 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Gm28690-202ENSMUST00000190325 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Gm28456-202ENSMUST00000190521 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Gm28834-202ENSMUST00000190714 537 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Gm28325-202ENSMUST00000191481 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Gm29132-202ENSMUST00000191588 622 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Gm30174-201ENSMUST00000191682 537 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Gm36261-201ENSMUST00000191807 537 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Gm37632-201ENSMUST00000191811 1142 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Gm35070-201ENSMUST00000192589 621 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Gm34550-202ENSMUST00000195186 537 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Gm30686-202ENSMUST00000195371 621 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Gm30353-202ENSMUST00000195486 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Gm36467-202ENSMUST00000195606 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Gm43090-201ENSMUST00000202459 314 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 AC163651.1-201ENSMUST00000222500 372 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Gm36262-201ENSMUST00000223274 499 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Ctag2-201ENSMUST00000033524 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 2700062C07Rik-201ENSMUST00000097646 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Gm42881-201ENSMUST00000198636 3344 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Gm10845-202ENSMUST00000228217 3389 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 AC153143.1-201ENSMUST00000222966 1340 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Gm2223-201ENSMUST00000112099 1350 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Dlg2-204ENSMUST00000107196 7490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 St18-208ENSMUST00000140079 5892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 AL606496.1-201ENSMUST00000220673 4472 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Scn1a-201ENSMUST00000077489 8116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Gm43873-201ENSMUST00000204505 3938 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Rab3b-202ENSMUST00000106650 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 AC139758.3-201ENSMUST00000226853 2704 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 BC067074-201ENSMUST00000078163 3546 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Olfr131-203ENSMUST00000215940 1614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Olfr888-202ENSMUST00000211851 2930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Olfr1381-202ENSMUST00000213256 4954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Gm13102-201ENSMUST00000097799 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Filip1l-203ENSMUST00000159816 4452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Vmn2r14-201ENSMUST00000170341 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 B3gnt5-203ENSMUST00000121344 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 4933402E13Rik-202ENSMUST00000178085 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Cxcr6-202ENSMUST00000216072 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Prrc2c-209ENSMUST00000182593 9022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Myct1-201ENSMUST00000051809 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Prom1-203ENSMUST00000087441 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Prox1-202ENSMUST00000175916 7913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Gm24340-201ENSMUST00000104208 97 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Gm25415-201ENSMUST00000104220 132 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Gm11533-201ENSMUST00000120287 477 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Gm12308-201ENSMUST00000120440 389 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Gng2-ps1-201ENSMUST00000120523 217 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Gm14237-201ENSMUST00000122080 430 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 n-R5s19-201ENSMUST00000122793 120 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 4930419G24Rik-201ENSMUST00000125494 1058 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Gm15245-201ENSMUST00000129410 1186 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Gm16347-201ENSMUST00000131707 622 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Gm15634-201ENSMUST00000147206 492 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Gm18191-201ENSMUST00000174624 824 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Mir6992-201ENSMUST00000183342 109 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 1810053B23Rik-202ENSMUST00000185364 590 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 9430002A10Rik-202ENSMUST00000185395 475 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 1700124L16Rik-202ENSMUST00000189308 546 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Gm29551-201ENSMUST00000190913 698 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 AC157822.1-201ENSMUST00000196643 80 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Trav3n-2-201ENSMUST00000197693 334 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Trav3d-2-201ENSMUST00000199874 334 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Gm42581-201ENSMUST00000201774 966 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Gm44134-201ENSMUST00000203064 661 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Gm44768-201ENSMUST00000205719 393 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Gm29791-201ENSMUST00000207144 380 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Gm44571-201ENSMUST00000208092 533 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Gm45734-201ENSMUST00000211916 411 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 AC153955.3-201ENSMUST00000216787 646 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 AC122901.2-201ENSMUST00000216926 285 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Olfr589-202ENSMUST00000218483 966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Asf1a-204ENSMUST00000219271 725 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 CT030194.2-201ENSMUST00000225752 379 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 AC132918.1-201ENSMUST00000227877 925 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 AC125464.1-201ENSMUST00000228013 512 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Olfr730-201ENSMUST00000051453 957 ntAPPRIS P2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Olfr250-201ENSMUST00000052085 996 ntAPPRIS P2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Olfr589-201ENSMUST00000061055 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Olfr181-201ENSMUST00000075361 1391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Hoxa13Q62424 Rabep1-207ENSMUST00000178245 2460 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Hoxa13Q62424 A530076I17Rik-202ENSMUST00000228352 1524 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
Hoxa13Q62424 Slc17a2-201ENSMUST00000006786 4629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Hoxa13Q62424 Vmn2r52-201ENSMUST00000164918 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Hoxa13Q62424 Atp13a5-203ENSMUST00000143373 3789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Hoxa13Q62424 Vmn2r3-202ENSMUST00000176328 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Hoxa13Q62424 Nebl-213ENSMUST00000177966 1690 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Hoxa13Q62424 Olfr76-203ENSMUST00000214676 3175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Hoxa13Q62424 Olfr539-202ENSMUST00000218865 11486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxa13Q62424 Psg21-202ENSMUST00000182128 2066 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxa13Q62424 Gm37033-201ENSMUST00000193199 7350 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxa13Q62424 C230038L03Rik-201ENSMUST00000129409 2632 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxa13Q62424 Gm4221-202ENSMUST00000181765 2988 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxa13Q62424 Gm13811-201ENSMUST00000117800 256 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxa13Q62424 Olfr408-ps1-201ENSMUST00000121710 941 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxa13Q62424 2010013B24Rik-201ENSMUST00000126922 747 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxa13Q62424 Mettl4-ps1-201ENSMUST00000127676 1272 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.2 ms