Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Gm29206-201ENSMUST00000189321 827 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm28482-201ENSMUST00000189350 452 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm6119-201ENSMUST00000193443 1206 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm38102-202ENSMUST00000196428 174 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm43848-201ENSMUST00000198060 1247 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm44411-201ENSMUST00000204172 349 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm45181-201ENSMUST00000207878 449 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm45673-201ENSMUST00000210293 358 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm45307-201ENSMUST00000211122 751 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm19219-201ENSMUST00000215863 724 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
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Gm28047Q3US59 AC157572.4-201ENSMUST00000228203 549 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 AC118250.1-201ENSMUST00000228569 875 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
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Gm28047Q3US59 Csn3-203ENSMUST00000113271 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Gm28047Q3US59 Ap2b1-202ENSMUST00000065692 3269 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Gm28047Q3US59 Crtam-203ENSMUST00000180872 4443 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Gm28047Q3US59 Aox3-201ENSMUST00000040999 4606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Cnpy1-205ENSMUST00000141601 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Gm28047Q3US59 Ddx24-201ENSMUST00000044923 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Nedd9-201ENSMUST00000021794 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm44889-203ENSMUST00000208346 1589 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Dennd1b-201ENSMUST00000094505 8073 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Nfib-202ENSMUST00000064770 8429 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Olfr720-202ENSMUST00000206298 4437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm20877-201ENSMUST00000100105 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
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