Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Olfr1181-202ENSMUST00000102619 1240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 Igkv10-96-201ENSMUST00000103328 359 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 Igkv6-23-201ENSMUST00000103386 369 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 Foxp2-202ENSMUST00000115469 1293 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 Defa-ps11-201ENSMUST00000119719 299 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 Gm14267-201ENSMUST00000119751 496 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 Gm12618-201ENSMUST00000121754 483 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 Mpc1-203ENSMUST00000130559 603 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 Gm24767-201ENSMUST00000158509 95 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 Gm15257-201ENSMUST00000177680 883 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 Gm15252-201ENSMUST00000177750 883 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 Gm15256-201ENSMUST00000177793 883 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 Gm15260-201ENSMUST00000179402 883 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 Gm6055-201ENSMUST00000180532 378 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 Gm27030-201ENSMUST00000182551 464 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 Mir6973b-201ENSMUST00000184185 80 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 Gm28482-201ENSMUST00000189350 452 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 Gm37220-201ENSMUST00000195179 415 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 Gm44206-201ENSMUST00000203044 592 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 Gm44366-201ENSMUST00000204933 674 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 4921513I08Rik-201ENSMUST00000206993 866 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 Nxpe1-ps-203ENSMUST00000210879 822 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 Gm45734-201ENSMUST00000211916 411 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 AC154634.2-201ENSMUST00000225983 1184 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 Anxa13-202ENSMUST00000227274 1201 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 Fgb-201ENSMUST00000048246 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 Mmp12-202ENSMUST00000065079 1185 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 Olfr1337-201ENSMUST00000077247 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 Gm24200-201ENSMUST00000082955 157 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 Olfr1181-201ENSMUST00000099823 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 Cntn1-201ENSMUST00000000109 5646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 AC124569.3-201ENSMUST00000224860 1621 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 Gm43900-201ENSMUST00000204868 2669 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 Cxcr6-202ENSMUST00000216072 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 Mboat2-204ENSMUST00000221952 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 AC156031.1-201ENSMUST00000217288 2555 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 AC156569.1-201ENSMUST00000222020 3841 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 Gm35940-201ENSMUST00000213355 4797 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 Fbxw25-201ENSMUST00000163839 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 Neb-201ENSMUST00000028320 10298 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 Gm38335-201ENSMUST00000195727 1789 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 Vmn2r3-202ENSMUST00000176328 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 4930550C14Rik-203ENSMUST00000215668 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 Clca1-201ENSMUST00000029919 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 AC022775.1-201ENSMUST00000228163 2698 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 Olfr901-202ENSMUST00000216502 2639 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 Gm16751-201ENSMUST00000142212 1685 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 Fastkd1-201ENSMUST00000073152 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 Gm20826-202ENSMUST00000185348 4605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 AC112972.2-201ENSMUST00000228702 2210 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 Gm38257-201ENSMUST00000195881 2761 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 Gm44242-201ENSMUST00000204212 2721 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 Klrb1-201ENSMUST00000112110 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 Gm3033-201ENSMUST00000112792 438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 Smt3h1-ps-201ENSMUST00000117126 280 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 Gm15332-201ENSMUST00000118386 357 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 Gm16074-201ENSMUST00000119524 444 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 Olfr1021-ps1-201ENSMUST00000121914 1042 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 Gm14950-201ENSMUST00000149500 1155 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 1700091H14Rik-201ENSMUST00000167772 590 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 Crxos-205ENSMUST00000171280 571 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 Csnk2b-207ENSMUST00000174024 883 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 Gm2042-202ENSMUST00000180706 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 Scgb3a2-202ENSMUST00000187157 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 Gm34716-201ENSMUST00000194060 621 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 Ighv8-5-201ENSMUST00000194257 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 Gm38133-201ENSMUST00000195109 815 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 Gm30353-202ENSMUST00000195486 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 Gm44219-201ENSMUST00000203005 273 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 Gm18839-201ENSMUST00000204292 670 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 Fxyd1-207ENSMUST00000205778 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 Gm44970-201ENSMUST00000206318 314 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 Olfr65-202ENSMUST00000209528 1106 ntAPPRIS P2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 Gm18329-201ENSMUST00000215832 589 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 Gm19186-201ENSMUST00000219922 333 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 AC154755.1-201ENSMUST00000225244 537 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 AC159205.4-201ENSMUST00000225964 704 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 AC156016.5-201ENSMUST00000228742 355 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 Gm5612-201ENSMUST00000053326 375 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 Klrc3-201ENSMUST00000071149 715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 Olfr1198-201ENSMUST00000099814 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 C87977-203ENSMUST00000105755 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 Olfr328-204ENSMUST00000216725 2904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 Cdc27-201ENSMUST00000093923 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 Gm15713-201ENSMUST00000155900 1546 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 Sytl2-202ENSMUST00000107210 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 Gm15354-201ENSMUST00000132019 1772 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 Gm31218-201ENSMUST00000221181 1498 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 Naip5-201ENSMUST00000049789 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 Gm43627-201ENSMUST00000197119 2299 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 Phf6-203ENSMUST00000154864 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 Gm42819-201ENSMUST00000199630 5121 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 Olfr259-202ENSMUST00000213978 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 Il18r1-205ENSMUST00000193793 1652 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 Csrnp3-204ENSMUST00000122912 10672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 Gm4070-201ENSMUST00000106766 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 Gvin1-201ENSMUST00000006667 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 Pik3c2g-202ENSMUST00000087657 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83 ms