Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Pcdh15-211ENSMUST00000126920 6866 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ccndbp1Q3TVC7 Slc12a6-203ENSMUST00000110987 3722 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccndbp1Q3TVC7 Cep57l1-202ENSMUST00000105505 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44416-201ENSMUST00000204055 2066 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10826-201ENSMUST00000215366 3304 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9521-201ENSMUST00000206656 1516 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccndbp1Q3TVC7 Dnah2-201ENSMUST00000035539 13569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccndbp1Q3TVC7 AC163354.1-204ENSMUST00000222226 2033 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42685-201ENSMUST00000200378 2390 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6145-206ENSMUST00000211251 2850 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccndbp1Q3TVC7 CT033783.1-201ENSMUST00000220881 2884 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7969-201ENSMUST00000221347 2884 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccndbp1Q3TVC7 CT033783.2-201ENSMUST00000222807 2884 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccndbp1Q3TVC7 Cntnap2-202ENSMUST00000114641 9827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm40649-201ENSMUST00000219795 1457 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7903-202ENSMUST00000179953 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9930-201ENSMUST00000066742 3151 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccndbp1Q3TVC7 Sgms1-209ENSMUST00000142618 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccndbp1Q3TVC7 C920009B18Rik-202ENSMUST00000181223 4535 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccndbp1Q3TVC7 Zzz3-210ENSMUST00000200570 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgef9-203ENSMUST00000113878 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccndbp1Q3TVC7 Trav6-6-201ENSMUST00000103584 344 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccndbp1Q3TVC7 Trav6n-5-201ENSMUST00000103611 338 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12886-201ENSMUST00000106266 1149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14326-201ENSMUST00000108928 767 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccndbp1Q3TVC7 Rpl7a-ps9-201ENSMUST00000117118 777 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccndbp1Q3TVC7 Prelid3b-202ENSMUST00000117442 683 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm2030-201ENSMUST00000119590 1129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12731-201ENSMUST00000120932 268 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15473-201ENSMUST00000140746 1179 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccndbp1Q3TVC7 4930412B13Rik-201ENSMUST00000149239 1276 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12148-201ENSMUST00000153791 292 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccndbp1Q3TVC7 Crxos-205ENSMUST00000171280 571 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccndbp1Q3TVC7 Trav6d-7-201ENSMUST00000178650 358 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccndbp1Q3TVC7 Trav6n-7-201ENSMUST00000179607 358 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccndbp1Q3TVC7 B230110C06Rik-202ENSMUST00000181936 938 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20574-201ENSMUST00000182867 917 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccndbp1Q3TVC7 Scgb1b21-202ENSMUST00000182901 278 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccndbp1Q3TVC7 BE692007-201ENSMUST00000186054 954 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29640-201ENSMUST00000187972 278 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28179-202ENSMUST00000189029 327 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccndbp1Q3TVC7 A430093F15Rik-206ENSMUST00000189565 651 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28532-201ENSMUST00000190408 572 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18183-201ENSMUST00000191024 615 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37966-201ENSMUST00000193122 326 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm4332-201ENSMUST00000196114 346 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccndbp1Q3TVC7 Trav6d-6-201ENSMUST00000197754 344 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43803-202ENSMUST00000197765 580 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccndbp1Q3TVC7 Mark1-ps1-201ENSMUST00000198516 717 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42452-201ENSMUST00000199749 617 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42646-201ENSMUST00000202233 914 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43895-201ENSMUST00000203219 855 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm34701-202ENSMUST00000204685 360 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44730-201ENSMUST00000205902 716 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccndbp1Q3TVC7 5430437J10Rik-201ENSMUST00000211750 1234 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8863-201ENSMUST00000216630 926 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1084-201ENSMUST00000216851 961 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccndbp1Q3TVC7 Cyp3a61-ps1-201ENSMUST00000218470 592 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccndbp1Q3TVC7 CT009733.1-203ENSMUST00000224033 451 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gngt1-201ENSMUST00000031673 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccndbp1Q3TVC7 A530021J07Rik-201ENSMUST00000066005 414 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
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Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1465-201ENSMUST00000080142 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26203-201ENSMUST00000082911 114 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccndbp1Q3TVC7 n-R5s58-201ENSMUST00000093682 119 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
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Ccndbp1Q3TVC7 Tti1-202ENSMUST00000109522 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccndbp1Q3TVC7 Vmn2r-ps159-201ENSMUST00000074107 2716 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
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Ccndbp1Q3TVC7 Toporsl-201ENSMUST00000029995 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
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Ccndbp1Q3TVC7 Cabyr-204ENSMUST00000121018 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43062-201ENSMUST00000196302 1319 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccndbp1Q3TVC7 Sis-202ENSMUST00000167334 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccndbp1Q3TVC7 Serpina10-201ENSMUST00000044231 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccndbp1Q3TVC7 Creb5-212ENSMUST00000205120 7482 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20707-201ENSMUST00000176201 2516 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccndbp1Q3TVC7 Mmp13-201ENSMUST00000015394 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccndbp1Q3TVC7 Hyal4-201ENSMUST00000031691 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccndbp1Q3TVC7 4932435O22Rik-202ENSMUST00000148405 3406 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccndbp1Q3TVC7 Vmn1r51-209ENSMUST00000227911 4021 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccndbp1Q3TVC7 Cldn34b4-201ENSMUST00000101419 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm3931-201ENSMUST00000119038 455 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14998-201ENSMUST00000120502 495 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11472-201ENSMUST00000121305 556 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr408-ps1-201ENSMUST00000121710 941 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp286os-201ENSMUST00000128292 713 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15935-202ENSMUST00000141656 298 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccndbp1Q3TVC7 1700129C05Rik-202ENSMUST00000159858 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccndbp1Q3TVC7 Stk38l-201ENSMUST00000001675 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm4540-201ENSMUST00000170669 429 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccndbp1Q3TVC7 Klrb1a-202ENSMUST00000171306 989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccndbp1Q3TVC7 Odaph-201ENSMUST00000178614 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26765-201ENSMUST00000180844 692 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26863-201ENSMUST00000181144 624 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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