Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Gm34165-201ENSMUST00000222012 1174 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 AV026068-220ENSMUST00000224153 1147 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 AC154642.1-201ENSMUST00000224173 740 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 AC141425.1-201ENSMUST00000224989 265 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Olfr799-201ENSMUST00000071126 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Defa17-201ENSMUST00000079528 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Gm22684-201ENSMUST00000082849 132 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Mup13-202ENSMUST00000098042 984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 9230109A22Rik-202ENSMUST00000228644 1853 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Map9-206ENSMUST00000195640 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
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Rpusd3Q14AI6 Ktn1-224ENSMUST00000191018 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 AC154612.1-202ENSMUST00000224806 1725 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Mboat2-204ENSMUST00000221952 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Slc44a1-205ENSMUST00000107651 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 AC156569.1-201ENSMUST00000222020 3841 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Pls3-202ENSMUST00000114057 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Gm26994-201ENSMUST00000182027 1571 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Gm38085-201ENSMUST00000195785 3062 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 E330034G19Rik-203ENSMUST00000161740 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Nlgn1-203ENSMUST00000191835 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Zbed4-ps1-201ENSMUST00000186734 3466 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Hgf-204ENSMUST00000199581 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Nlrp5-202ENSMUST00000086341 3471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Lgi1-206ENSMUST00000198045 1483 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 4930402H24Rik-203ENSMUST00000119422 3815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Gm5128-202ENSMUST00000180198 3836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Scp2-ps2-203ENSMUST00000216438 1370 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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Rpusd3Q14AI6 Fat1-203ENSMUST00000189017 14651 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 A330008L17Rik-202ENSMUST00000153366 2614 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 D630030B08Rik-201ENSMUST00000202983 3479 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Pramef8-202ENSMUST00000059790 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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Rpusd3Q14AI6 Gm25795-201ENSMUST00000104421 132 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Gm13818-201ENSMUST00000119441 511 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Gm12399-201ENSMUST00000121475 446 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Gm11184-201ENSMUST00000126437 268 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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Rpusd3Q14AI6 Gm28237-201ENSMUST00000186563 641 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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Rpusd3Q14AI6 Gm28777-201ENSMUST00000191402 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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Rpusd3Q14AI6 AC159622.2-201ENSMUST00000221592 983 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 AC123061.2-201ENSMUST00000226234 802 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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Rpusd3Q14AI6 C230085N15Rik-201ENSMUST00000194893 4327 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Pigb-201ENSMUST00000093819 2866 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Gm45493-201ENSMUST00000209494 3948 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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Rpusd3Q14AI6 AC154734.1-201ENSMUST00000219957 2141 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Vcam1-201ENSMUST00000029574 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Agbl2-202ENSMUST00000037219 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Platr23-201ENSMUST00000180797 2439 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 4930404I05Rik-201ENSMUST00000125902 2675 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Gm13544-201ENSMUST00000131189 2940 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Kat6b-ps2-201ENSMUST00000188339 1600 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Olfr1357-202ENSMUST00000203305 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Olfr1310-202ENSMUST00000213559 4897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Pcdh9-202ENSMUST00000192221 5161 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Gm38067-201ENSMUST00000192346 1911 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Gm37551-201ENSMUST00000195556 2861 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Igkv1-99-201ENSMUST00000103326 359 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Taf7l-202ENSMUST00000113223 1155 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Gm22952-201ENSMUST00000116720 120 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Gm22714-201ENSMUST00000116894 78 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 A730017C20Rik-203ENSMUST00000118510 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Gm14580-201ENSMUST00000119122 718 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Gm9005-201ENSMUST00000119908 607 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Gm15787-206ENSMUST00000141008 585 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Gm13291-201ENSMUST00000143527 655 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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