Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Gm31063-201ENSMUST00000222636 580 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Gm13078-201ENSMUST00000078695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Olfr1217-201ENSMUST00000099799 1105 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Pja2-203ENSMUST00000172733 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Plxna4os2-201ENSMUST00000152538 2044 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 A330015K06Rik-202ENSMUST00000195685 2196 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Cfap57-202ENSMUST00000081921 3750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Gm29666-201ENSMUST00000189185 8038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Neb-201ENSMUST00000028320 10298 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Gm4954-201ENSMUST00000135069 1601 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Gm18508-201ENSMUST00000215790 1642 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Fat1-205ENSMUST00000191428 14814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Fam35a-206ENSMUST00000228626 3100 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Dclre1a-204ENSMUST00000182276 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 CT033783.1-201ENSMUST00000220881 2884 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Gm7969-201ENSMUST00000221347 2884 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 CT033783.2-201ENSMUST00000222807 2884 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 C230099D08Rik-201ENSMUST00000215772 2727 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Itih4-204ENSMUST00000168782 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Gm5415-201ENSMUST00000171322 3609 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Traf3ip1Q149C2 A530053G22Rik-205ENSMUST00000205153 1448 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Traf3ip1Q149C2 AC153962.3-202ENSMUST00000217778 1412 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Traf3ip1Q149C2 Spata6-203ENSMUST00000084354 2239 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Traf3ip1Q149C2 Nlgn1-203ENSMUST00000191835 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Traf3ip1Q149C2 Ccl9-201ENSMUST00000019266 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Traf3ip1Q149C2 Mup6-202ENSMUST00000107520 540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Traf3ip1Q149C2 Gm13013-201ENSMUST00000119087 523 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Traf3ip1Q149C2 Gm16531-201ENSMUST00000180658 967 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Traf3ip1Q149C2 Gm2042-202ENSMUST00000180706 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Traf3ip1Q149C2 Gm43743-202ENSMUST00000198353 491 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Traf3ip1Q149C2 Pomp-203ENSMUST00000201376 383 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Traf3ip1Q149C2 1300002E11Rik-206ENSMUST00000209728 701 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Traf3ip1Q149C2 Gm33242-201ENSMUST00000212130 1057 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Traf3ip1Q149C2 AC108846.4-201ENSMUST00000216783 341 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Traf3ip1Q149C2 AC126554.2-201ENSMUST00000223259 400 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Traf3ip1Q149C2 Defb42-201ENSMUST00000067990 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Traf3ip1Q149C2 Clec4b1-201ENSMUST00000077228 674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Traf3ip1Q149C2 Mir298-201ENSMUST00000083476 82 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Traf3ip1Q149C2 1700034E13Rik-201ENSMUST00000091904 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Traf3ip1Q149C2 Gm38224-201ENSMUST00000191648 2100 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Traf3ip1Q149C2 Prcp-201ENSMUST00000076052 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Traf3ip1Q149C2 Gm8872-201ENSMUST00000197475 1341 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Traf3ip1Q149C2 Olfr259-204ENSMUST00000216088 4023 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Traf3ip1Q149C2 Olfr510-202ENSMUST00000213979 2898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Traf3ip1Q149C2 Tmc1-201ENSMUST00000039500 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Traf3ip1Q149C2 Gm42397-206ENSMUST00000208808 1358 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Traf3ip1Q149C2 Tbpl2-201ENSMUST00000080453 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Traf3ip1Q149C2 Wdr64-202ENSMUST00000171939 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Traf3ip1Q149C2 Olfr1392-206ENSMUST00000215861 3670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Traf3ip1Q149C2 Naip2-201ENSMUST00000067975 4709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Traf3ip1Q149C2 Filip1l-201ENSMUST00000099667 1576 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Traf3ip1Q149C2 Homer1-202ENSMUST00000079086 4287 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Traf3ip1Q149C2 AC122769.3-201ENSMUST00000227739 3245 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Traf3ip1Q149C2 Gm42715-201ENSMUST00000189629 12746 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Traf3ip1Q149C2 Olfr972-202ENSMUST00000215303 1641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Traf3ip1Q149C2 Mir680-1-201ENSMUST00000102257 109 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Traf3ip1Q149C2 Trbv13-3-201ENSMUST00000103271 340 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Traf3ip1Q149C2 Igkv16-104-201ENSMUST00000103323 378 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Traf3ip1Q149C2 Gm22499-201ENSMUST00000104501 135 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Traf3ip1Q149C2 Gm5073-201ENSMUST00000118222 820 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Traf3ip1Q149C2 Gm12244-201ENSMUST00000119500 291 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Traf3ip1Q149C2 Gm15959-201ENSMUST00000121724 368 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Traf3ip1Q149C2 Gm14216-201ENSMUST00000136046 409 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Traf3ip1Q149C2 Gm25227-201ENSMUST00000158204 112 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Traf3ip1Q149C2 Gm24731-201ENSMUST00000158227 131 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Traf3ip1Q149C2 Gm8837-201ENSMUST00000161037 1107 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Traf3ip1Q149C2 Clec4a2-204ENSMUST00000161365 918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r91-201ENSMUST00000165330 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Traf3ip1Q149C2 Gm15056-202ENSMUST00000167686 314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r9-201ENSMUST00000171186 1051 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Traf3ip1Q149C2 Mir6921-201ENSMUST00000183719 80 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Traf3ip1Q149C2 Frmd8os-202ENSMUST00000187697 516 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Traf3ip1Q149C2 AV026068-209ENSMUST00000189143 517 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Traf3ip1Q149C2 Gm37223-206ENSMUST00000195070 699 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Traf3ip1Q149C2 Rrh-205ENSMUST00000196902 1250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Traf3ip1Q149C2 Gm31306-201ENSMUST00000197517 508 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Traf3ip1Q149C2 Gm43616-201ENSMUST00000199347 409 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Traf3ip1Q149C2 Gm42646-201ENSMUST00000202233 914 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Traf3ip1Q149C2 Gm4510-201ENSMUST00000218265 427 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Traf3ip1Q149C2 AC154417.1-201ENSMUST00000223876 476 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r67-201ENSMUST00000055964 999 ntAPPRIS P2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Traf3ip1Q149C2 Mir143-201ENSMUST00000083511 63 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Traf3ip1Q149C2 Slfn8-206ENSMUST00000215239 2930 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Traf3ip1Q149C2 Gm37078-201ENSMUST00000193314 2009 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Traf3ip1Q149C2 Pik3c2g-202ENSMUST00000087657 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Traf3ip1Q149C2 Gm46136-202ENSMUST00000217053 6329 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Traf3ip1Q149C2 Gm38062-201ENSMUST00000192541 1856 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Traf3ip1Q149C2 Gm45632-201ENSMUST00000211532 1888 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Traf3ip1Q149C2 Rspry1-205ENSMUST00000211983 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Traf3ip1Q149C2 Olfr432-202ENSMUST00000213211 4435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Traf3ip1Q149C2 Olfr1359-203ENSMUST00000214435 4425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Traf3ip1Q149C2 Sgip1-202ENSMUST00000072481 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Traf3ip1Q149C2 Cc2d2b-205ENSMUST00000224596 4762 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Traf3ip1Q149C2 Gm156-202ENSMUST00000118532 2000 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Traf3ip1Q149C2 Zp3r-203ENSMUST00000142416 1835 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Traf3ip1Q149C2 Pus10-201ENSMUST00000020520 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Traf3ip1Q149C2 Xpo7-203ENSMUST00000226448 3663 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Traf3ip1Q149C2 Slc10a5-201ENSMUST00000078748 3923 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Traf3ip1Q149C2 Cavin4-201ENSMUST00000030033 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Traf3ip1Q149C2 Gm44777-202ENSMUST00000206492 1889 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88 ms