Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Gm20817-201ENSMUST00000191123 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 Gm21865-202ENSMUST00000191443 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 Gm21258-202ENSMUST00000191553 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 Gm29866-201ENSMUST00000191675 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 Gm31571-201ENSMUST00000192521 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 Gm30737-201ENSMUST00000192683 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 Gm21366-201ENSMUST00000192892 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 Gm35134-201ENSMUST00000194086 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 Gm42707-202ENSMUST00000196668 618 ntTSL 3 BASIC8.3□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 Gm43091-201ENSMUST00000198157 423 ntTSL 3 BASIC8.3□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 Gm43794-201ENSMUST00000200971 692 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 Gm5317-201ENSMUST00000204445 847 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 Gm44665-201ENSMUST00000205381 251 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 Gm44946-201ENSMUST00000208425 572 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 Gm18585-201ENSMUST00000215197 556 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 AC153957.1-201ENSMUST00000215235 229 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 AC079680.1-202ENSMUST00000219835 654 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 Ear14-202ENSMUST00000228064 948 ntAPPRIS P1 BASIC8.3□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 AC157572.4-201ENSMUST00000228203 549 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 Orm1-201ENSMUST00000030044 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 Rpl36a-ps1-201ENSMUST00000081987 449 ntAPPRIS P1 BASIC8.3□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 Macrod2os2-201ENSMUST00000143227 3566 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 Spc25-201ENSMUST00000005365 1352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 Trpm3-202ENSMUST00000074770 6710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 Adamts6-203ENSMUST00000224208 6480 ntAPPRIS P1 BASIC8.3□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 Nlrp1c-ps-202ENSMUST00000174668 3422 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 Vmn1r8-202ENSMUST00000227706 1563 ntAPPRIS P1 BASIC8.3□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 Olfr1199-202ENSMUST00000124021 2967 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.3□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 Rasgrp3-202ENSMUST00000164192 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 Gm37755-201ENSMUST00000195880 2179 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 Gm12667-201ENSMUST00000118299 1332 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 AC139750.1-201ENSMUST00000223962 1300 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 Gm14418-201ENSMUST00000108955 1415 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 Gm26806-201ENSMUST00000180403 1519 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 Zfp955b-201ENSMUST00000099414 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 Gm37278-201ENSMUST00000191619 2872 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 Mdga2-210ENSMUST00000222167 2871 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 Mdga2-213ENSMUST00000223141 2850 ntTSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 AL607131.1-201ENSMUST00000222575 1835 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 Olfr432-203ENSMUST00000213381 4533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 Ccdc191-203ENSMUST00000132859 3779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 Cfap57-202ENSMUST00000081921 3750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 Rnf219-201ENSMUST00000022716 3420 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC8.29□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 Gm10373-201ENSMUST00000100683 668 ntTSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 Gm24790-201ENSMUST00000104285 132 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 Gm12886-201ENSMUST00000106266 1149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 Gm15125-201ENSMUST00000116185 800 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 Gm4596-201ENSMUST00000117197 442 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 Gm13176-201ENSMUST00000117910 477 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 Gm14158-201ENSMUST00000118409 308 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 Xlr4d-ps-201ENSMUST00000118894 646 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 Mir1898-201ENSMUST00000122643 83 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 Gm12707-201ENSMUST00000155789 489 ntTSL 3 BASIC8.29□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 Gm22555-201ENSMUST00000157801 62 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 Snrpe-201ENSMUST00000164096 669 ntTSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 Samd15-201ENSMUST00000169669 1194 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 Gm20691-201ENSMUST00000176889 333 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 Gtpbp4-ps2-201ENSMUST00000184058 256 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 Gm29337-201ENSMUST00000185425 284 ntTSL 3 BASIC8.29□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 Scgb1b17-201ENSMUST00000187081 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 1810041H14Rik-202ENSMUST00000187218 434 ntTSL 3 BASIC8.29□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 Scgb1b10-201ENSMUST00000187257 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 Gm28661-201ENSMUST00000188231 681 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 Scgb1b15-201ENSMUST00000189118 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 Gm29784-201ENSMUST00000196217 406 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 Gm43538-201ENSMUST00000200416 849 ntTSL 3 BASIC8.29□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 Gm44386-201ENSMUST00000204288 429 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 AC127581.1-201ENSMUST00000214084 771 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 Olfr923-204ENSMUST00000219798 1068 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 AC117797.2-201ENSMUST00000224419 531 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 CT030254.1-201ENSMUST00000225450 1078 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 Gsta4-201ENSMUST00000034903 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 Fxyd4-201ENSMUST00000005114 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 Olfr923-201ENSMUST00000051238 1068 ntAPPRIS P1 BASIC8.29□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 Olfr820-201ENSMUST00000059244 1061 ntAPPRIS P1 BASIC8.29□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 Vmn1r12-201ENSMUST00000073384 924 ntAPPRIS P2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 Olfr1454-201ENSMUST00000073732 924 ntAPPRIS P1 BASIC8.29□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 Gm23423-201ENSMUST00000082782 106 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 Fbxw23-202ENSMUST00000198480 1388 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 Zranb3-203ENSMUST00000112538 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 Rag2-202ENSMUST00000111227 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 Rs1-201ENSMUST00000033650 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 AC135119.1-204ENSMUST00000228036 2663 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 Gm8765-201ENSMUST00000099518 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 Gm906-201ENSMUST00000099521 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 Bbx-205ENSMUST00000114488 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 Scn8a-205ENSMUST00000108910 11232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 Fancd2-208ENSMUST00000204827 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 Hsf2-201ENSMUST00000079833 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 Sh2d1b2-202ENSMUST00000162752 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 Olfr1054-202ENSMUST00000213205 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 Grm8-202ENSMUST00000115323 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 Olfr615-203ENSMUST00000215673 3469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 Nemf-201ENSMUST00000021368 4732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 Igsf10-203ENSMUST00000194546 8393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 St18-212ENSMUST00000151281 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 Cnpy1-205ENSMUST00000141601 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 D030034A15Rik-201ENSMUST00000215835 3953 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 AC155234.1-201ENSMUST00000225610 2823 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
VgfQ0VGU4 Olfr462-203ENSMUST00000213928 5598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.6 ms