Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 B230303O12Rik-201ENSMUST00000199119 3645 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 Tmsb15b1-201ENSMUST00000113071 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 Mgst1-205ENSMUST00000120939 913 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 Gm8761-201ENSMUST00000121507 955 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 Gm12094-201ENSMUST00000121781 472 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 Tctex1d1-203ENSMUST00000125417 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 Gm25962-201ENSMUST00000157173 168 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 Gm16161-201ENSMUST00000162239 290 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 Cabcoco1-202ENSMUST00000166919 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 Gm20069-201ENSMUST00000178938 545 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 Gm28701-201ENSMUST00000189778 1010 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 Gm18407-201ENSMUST00000192126 790 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 Gm44206-201ENSMUST00000203044 592 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 Gm44712-201ENSMUST00000206250 1076 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 AC165245.1-201ENSMUST00000214181 636 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 Olfr1084-201ENSMUST00000216851 961 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 Gm3785-201ENSMUST00000221000 202 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 AC154595.2-201ENSMUST00000225067 310 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 Tmed6-201ENSMUST00000034393 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 Olfr1023-201ENSMUST00000056408 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 Olfr1404-201ENSMUST00000056592 1034 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 Gm8412-201ENSMUST00000077493 440 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 Dock2-202ENSMUST00000101364 1616 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 Olfr508-201ENSMUST00000072914 1635 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 Gm43872-201ENSMUST00000203218 2213 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 Akap4-203ENSMUST00000115751 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 Gm43611-201ENSMUST00000196656 4352 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 Cx3cr1-202ENSMUST00000177637 3156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 Gm37100-201ENSMUST00000193344 1353 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 Gm15011-201ENSMUST00000117724 1480 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 Gm28278-201ENSMUST00000185603 1499 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 Gm28279-201ENSMUST00000186248 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 Gm28491-202ENSMUST00000186902 1493 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 Gm29368-201ENSMUST00000187201 1489 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 Gm28088-202ENSMUST00000187402 1493 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 Gm28674-201ENSMUST00000187502 1493 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 Gm28131-203ENSMUST00000187841 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 Gm28487-202ENSMUST00000187894 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 Gm29056-201ENSMUST00000187933 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 Gm29074-203ENSMUST00000188026 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 Gm28754-201ENSMUST00000188778 1493 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 Gm28520-202ENSMUST00000189379 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 Gm29275-202ENSMUST00000189475 1494 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 Gm28963-202ENSMUST00000189567 1493 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 Gm28519-203ENSMUST00000190126 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 Gm29207-202ENSMUST00000190931 1493 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 Gm28310-202ENSMUST00000191136 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 Gm29646-202ENSMUST00000191146 1493 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 Gm28762-203ENSMUST00000191259 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 Gm28691-202ENSMUST00000191561 1493 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 Gm38174-201ENSMUST00000191787 1494 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 Gm43330-201ENSMUST00000199706 2153 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 Zfp81-201ENSMUST00000054072 6639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 Abcd2-201ENSMUST00000069511 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 AC133498.1-201ENSMUST00000222871 2925 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 Gm43469-201ENSMUST00000196084 4634 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 Cab39l-201ENSMUST00000022553 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 Mdm4-ps-201ENSMUST00000121299 6514 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 Zfp748-202ENSMUST00000181892 5293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 Gm43088-201ENSMUST00000197530 2347 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 Trmt10a-201ENSMUST00000040321 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 Brinp3-201ENSMUST00000074622 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 Tspan7-202ENSMUST00000115526 7067 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 Gabra3-201ENSMUST00000055966 3662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 Gm43258-201ENSMUST00000200312 1950 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 Igsf10-203ENSMUST00000194546 8393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 Mcoln3-201ENSMUST00000039450 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 A330008L17Rik-202ENSMUST00000153366 2614 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 Vmn2r42-201ENSMUST00000086282 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 Gm5930-201ENSMUST00000111863 1746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 Gm8401-201ENSMUST00000120248 1739 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 Ghr-202ENSMUST00000110697 1213 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 Gm14606-201ENSMUST00000117078 1155 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 Gm7927-201ENSMUST00000118818 880 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 Gm13338-201ENSMUST00000120235 361 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 Fam229b-202ENSMUST00000124941 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 Crem-207ENSMUST00000126578 915 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 Gm16135-201ENSMUST00000129470 568 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 Saxo1os-201ENSMUST00000131790 628 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 1700095A21Rik-201ENSMUST00000145269 1069 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 Gm22724-201ENSMUST00000158091 127 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 Gm23408-201ENSMUST00000158523 265 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 Tmem258-204ENSMUST00000166412 447 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 Gm17063-201ENSMUST00000168135 456 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 Gm24957-201ENSMUST00000179604 132 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 1700003H04Rik-206ENSMUST00000180162 1086 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 Gm26969-201ENSMUST00000183203 648 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 Gm36939-201ENSMUST00000194889 439 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 Gm29745-201ENSMUST00000198005 687 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 Gm44243-201ENSMUST00000204323 692 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 Gm18413-201ENSMUST00000221573 655 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 1700003H04Rik-201ENSMUST00000047110 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 Olfr855-201ENSMUST00000061693 992 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 Olfr995-201ENSMUST00000099924 1113 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 Stag3-209ENSMUST00000162245 4123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 Gm5512-201ENSMUST00000218013 1353 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 Prom1-203ENSMUST00000087441 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 Gm43302-201ENSMUST00000050011 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 Sntg1-210ENSMUST00000191683 4510 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Atp2b3Q0VF55 Gm42892-201ENSMUST00000196227 3973 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.6 ms