Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Vmn2r44-201ENSMUST00000166499 3660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Nqo2-202ENSMUST00000058978 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 BB019430-202ENSMUST00000218015 1320 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Kcnma1-209ENSMUST00000179097 4596 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Cfhr2-201ENSMUST00000094489 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Ncoa4-201ENSMUST00000111994 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Bche-201ENSMUST00000029367 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Ino80d-206ENSMUST00000172416 13438 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Olfr358-201ENSMUST00000100146 1059 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Igkv9-120-201ENSMUST00000103316 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Olfr407-ps1-201ENSMUST00000117794 866 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm13455-201ENSMUST00000118767 517 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm11976-201ENSMUST00000119236 295 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 M6pr-ps-201ENSMUST00000120481 830 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Rps12-ps20-201ENSMUST00000121168 402 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm6031-201ENSMUST00000121314 1054 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 1700041M05Rik-201ENSMUST00000130055 306 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm15122-201ENSMUST00000135434 462 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Trim30e-ps1-201ENSMUST00000147064 1890 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm25057-201ENSMUST00000157366 88 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm25660-201ENSMUST00000158470 104 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Cfhr3-201ENSMUST00000170441 1022 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Rps12-ps23-201ENSMUST00000179414 402 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm26509-201ENSMUST00000180947 948 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm5260-201ENSMUST00000186157 949 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm28586-201ENSMUST00000189857 456 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 1700031M16Rik-205ENSMUST00000189907 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm8860-201ENSMUST00000193160 445 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm38084-201ENSMUST00000193488 437 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm37865-201ENSMUST00000194996 437 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Rpl9-ps8-201ENSMUST00000198343 562 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm44226-201ENSMUST00000205203 1195 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm7439-201ENSMUST00000214053 835 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 AC123064.2-201ENSMUST00000217758 193 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm19189-201ENSMUST00000221689 754 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm9293-201ENSMUST00000223096 306 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 AC103672.3-201ENSMUST00000227649 3243 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 AC137902.1-201ENSMUST00000228184 102 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Klrb1a-201ENSMUST00000032512 1274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 1700007K09Rik-201ENSMUST00000033146 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Olfr812-201ENSMUST00000057775 1043 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm24032-201ENSMUST00000083932 159 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Trmt2b-201ENSMUST00000087540 822 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Akr1c14-202ENSMUST00000118717 3183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm10825-201ENSMUST00000180537 4478 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm26581-201ENSMUST00000181953 4479 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Vmn1r193-204ENSMUST00000228303 6653 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Olfr491-203ENSMUST00000214605 2136 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Sntg1-204ENSMUST00000132064 4165 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Kat6b-ps1-201ENSMUST00000187624 3433 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Vmn1r9-202ENSMUST00000227399 6778 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Pum2-203ENSMUST00000111123 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Slc22a22-202ENSMUST00000110196 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm37255-201ENSMUST00000193302 3060 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Hrh2-202ENSMUST00000209846 4074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Vmn1r37-204ENSMUST00000226974 1770 ntAPPRIS P2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Slc22a29-205ENSMUST00000222533 1473 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Olfr1155-202ENSMUST00000214641 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm44889-203ENSMUST00000208346 1589 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Eppin-201ENSMUST00000103100 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Igkv6-14-201ENSMUST00000103394 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm26144-201ENSMUST00000104475 132 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm42674-201ENSMUST00000107330 446 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm13033-201ENSMUST00000117591 1057 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm10241-201ENSMUST00000117664 286 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm11920-201ENSMUST00000118491 563 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm12506-201ENSMUST00000123620 806 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm13807-201ENSMUST00000137073 1295 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 4930412B13Rik-201ENSMUST00000149239 1276 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm12867-201ENSMUST00000151216 457 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
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Sh3bp1P55194 1700101I11Rik-201ENSMUST00000181594 896 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Olr1-203ENSMUST00000182784 570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
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Sh3bp1P55194 Mir6244-201ENSMUST00000184156 117 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm28985-201ENSMUST00000189261 356 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm412-201ENSMUST00000193360 948 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm38237-201ENSMUST00000193366 376 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm37716-201ENSMUST00000193553 947 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm20926-201ENSMUST00000194457 696 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Nxpe1-ps-203ENSMUST00000210879 822 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm32005-201ENSMUST00000212446 959 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Scoc-209ENSMUST00000212905 798 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Tmem45b-204ENSMUST00000217007 783 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 4933433N18Rik-201ENSMUST00000222134 1220 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 AC170086.2-201ENSMUST00000224733 803 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Olfr1145-201ENSMUST00000079711 945 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm23623-201ENSMUST00000082461 107 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm10205-201ENSMUST00000087431 234 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Olfr1145-202ENSMUST00000090707 978 ntAPPRIS P2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Krtap14-201ENSMUST00000099562 216 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Cyld-206ENSMUST00000209559 4476 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Ccdc7a-201ENSMUST00000095158 1547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Mfap1a-201ENSMUST00000089926 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm38414-201ENSMUST00000209819 1488 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Nsun6-201ENSMUST00000028034 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
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