Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Lrmda-203ENSMUST00000159777 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm7152-201ENSMUST00000163570 605 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm17333-201ENSMUST00000169531 378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
VdrP48281 Klrc1-204ENSMUST00000169545 676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
VdrP48281 Astx4a-201ENSMUST00000177683 1149 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
VdrP48281 Astx1c-201ENSMUST00000177724 1150 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
VdrP48281 Astx4c-201ENSMUST00000178390 1149 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
VdrP48281 Astx1b-201ENSMUST00000178608 1150 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
VdrP48281 Astx2-201ENSMUST00000179135 1150 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
VdrP48281 Astx4b-201ENSMUST00000179359 1149 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
VdrP48281 Astx1a-201ENSMUST00000179529 1150 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
VdrP48281 Astx5-201ENSMUST00000179723 1150 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
VdrP48281 Platr2-201ENSMUST00000180834 521 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm26959-201ENSMUST00000182376 978 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm5147-201ENSMUST00000185999 794 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm9451-201ENSMUST00000188491 604 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
VdrP48281 1700001D01Rik-201ENSMUST00000188654 565 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm18969-201ENSMUST00000189423 730 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm28153-201ENSMUST00000189853 629 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm18775-201ENSMUST00000190763 586 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm2367-201ENSMUST00000192374 472 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
VdrP48281 1700052H01Rik-202ENSMUST00000196973 429 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm31230-201ENSMUST00000199725 785 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm2762-203ENSMUST00000201658 1234 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
VdrP48281 1810049I09Rik-201ENSMUST00000205499 453 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm44724-203ENSMUST00000208430 998 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm32052-201ENSMUST00000212073 799 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
VdrP48281 CT485606.3-201ENSMUST00000215810 624 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
VdrP48281 Akr1c21-201ENSMUST00000021628 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm6477-201ENSMUST00000217098 764 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm40646-201ENSMUST00000218243 490 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
VdrP48281 AC141642.1-201ENSMUST00000220598 229 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
VdrP48281 AC117202.1-201ENSMUST00000227007 445 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
VdrP48281 AC139209.2-201ENSMUST00000227680 1208 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
VdrP48281 Ear14-202ENSMUST00000228064 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm5250-201ENSMUST00000059065 321 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
VdrP48281 Vaultrc5-201ENSMUST00000083211 143 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
VdrP48281 Wfdc10-201ENSMUST00000094344 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
VdrP48281 Vdac3-ps1-201ENSMUST00000099736 853 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
VdrP48281 Pcbp2-203ENSMUST00000108838 2775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm10184-201ENSMUST00000086423 1939 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
VdrP48281 Cep85l-201ENSMUST00000095691 2560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
VdrP48281 Pramel4-202ENSMUST00000091676 2399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
VdrP48281 Olfr1242-202ENSMUST00000111540 2189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
VdrP48281 Fcrl5-202ENSMUST00000166297 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
VdrP48281 Papola-215ENSMUST00000170002 2605 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm43189-201ENSMUST00000196040 3069 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
VdrP48281 1700024B05Rik-201ENSMUST00000064162 1576 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
VdrP48281 Dennd2c-202ENSMUST00000172288 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
VdrP48281 Cped1-202ENSMUST00000115383 5690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm31562-201ENSMUST00000213973 2747 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
VdrP48281 Scaper-202ENSMUST00000214747 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
VdrP48281 Siae-202ENSMUST00000213126 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
VdrP48281 Rdh11-203ENSMUST00000161204 3262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
VdrP48281 Pik3ca-202ENSMUST00000108242 6171 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
VdrP48281 Ccdc175-201ENSMUST00000021494 2622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
VdrP48281 Pomp-202ENSMUST00000201120 3850 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
VdrP48281 Ank3-240ENSMUST00000183169 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
VdrP48281 Aox1-201ENSMUST00000001027 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm28279-201ENSMUST00000186248 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm28491-202ENSMUST00000186902 1493 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm29368-201ENSMUST00000187201 1489 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm28242-201ENSMUST00000187274 1492 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm28088-202ENSMUST00000187402 1493 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm28674-201ENSMUST00000187502 1493 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm28131-203ENSMUST00000187841 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm28487-202ENSMUST00000187894 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm29056-201ENSMUST00000187933 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm29074-203ENSMUST00000188026 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm28754-201ENSMUST00000188778 1493 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm28520-202ENSMUST00000189379 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm28963-202ENSMUST00000189567 1493 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm28519-203ENSMUST00000190126 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm29207-202ENSMUST00000190931 1493 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm28310-202ENSMUST00000191136 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm29646-202ENSMUST00000191146 1493 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm28762-203ENSMUST00000191259 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm28691-202ENSMUST00000191561 1493 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm38174-201ENSMUST00000191787 1494 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm43376-202ENSMUST00000199747 1743 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
VdrP48281 Olfr965-203ENSMUST00000215164 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
VdrP48281 Platr21-201ENSMUST00000126339 3511 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm10401-201ENSMUST00000100848 607 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm23485-201ENSMUST00000104181 155 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm24373-201ENSMUST00000104393 132 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
VdrP48281 Zfp971-201ENSMUST00000108925 923 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
VdrP48281 1700006E09Rik-201ENSMUST00000010985 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm11928-201ENSMUST00000119323 437 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm14053-201ENSMUST00000121662 470 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm15335-201ENSMUST00000122442 411 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
VdrP48281 Cox7c-204ENSMUST00000132233 709 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
VdrP48281 Sspnos-201ENSMUST00000139089 826 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm12204-201ENSMUST00000147412 333 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm24647-201ENSMUST00000157112 113 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm22687-201ENSMUST00000158301 105 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm24883-201ENSMUST00000158391 281 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm24738-201ENSMUST00000158856 123 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
VdrP48281 4430402I18Rik-203ENSMUST00000160542 1057 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
VdrP48281 Polr3g-204ENSMUST00000161920 733 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
VdrP48281 Vmn1r-ps61-201ENSMUST00000173771 822 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.3 ms